データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
並び替え:
生物種
カテゴリ
稼動状況
地域
その他
運用機関:
The Centre for Applied Genomics
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトゲノムにおける構造多型を包括的にまとめたデータベースです。2005年に世界の5つの研究機関、企業が国際コンソーシアム（ヒトゲノム構造多型コンソーシアム）を結成し、多様な人種におけるコピー多型の全容...
運用機関:
九州大学 生体防御医学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
全胞状奇胎を用いて直接決定した日本人ゲノムのハプロタイプおよび連鎖不平衡構造をゲノムブラウザー上に表示します。
九州大学生体防御医学研究所によるオリジナルサイト（http: //orca.gen.ky...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Cyanobacteria
説明:
財団法人かずさDNA研究所で全ゲノム配列決定したシアノバクテリアを含む、シアノバクテリア、緑色硫黄細菌、紅色非硫黄細菌の全ゲノム配列解析結果を収録しています。2017年にリリースされた新バージョンでは...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Bacteria | Eukaryota | Viruses
説明:
各生物種のコドン使用頻度を収集しているデータベースです。生物種ごとに、各タンパク質をコードする遺伝子から算出されるコドン使用回数を集計し、千分率で表示しています。GC含量も掲載されています。
CUTG...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
酵素反応のメカニズムに関するデータベースです。酵素について、タンパク質の配列や構造、触媒残基の位置、補助因子、反応メカニズムなどのアノテーション情報を収録しています。Protein Data Bank...
運用機関:
Max-Planck-Institut fur Entwicklungsbiologie
生物種:
説明:
複数のゲノム配列で保存されている非コードDNA領域は、制御エレメントである可能性が高いと考えられます。そこで、10種類の脊椎動物の相同遺伝子の組の上流領域から、保存されている非コード領域を収集し、デー...
運用終了
CluSTr: Clusters of SWISS-PROT and TrEMBL proteins database
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
UniProtやIPIに登録されているタンパク質を関連のあるグループに自動的に分類したデータベースです。分類手法は、タンパク配列間のペアワイズ比較法に基づいています。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Chlamydomonas reinhardtii
説明:
かずさDNA研究所で決定したクラミドモナスのEST配列と、非冗長タンパク配列データベースとの間で行ったblastx検索の結果が収録されています。
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
生命プロセスに介在する小分子化合物の辞典です。ゲノムに直接コード化されている分子（例：核酸、タンパク、ペプチド）はこのデータベースの対象外です。登録されているデータは、多数の情報源のデータを組み合わせ...
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
Homo sapiens
説明:
癌の遺伝子発現データ及び臨床情報の統合データベースです。乳がん、結腸直腸がん、肝細胞がん、食道がん、甲状腺がん、胃がんの遺伝子発現プロファイル解析を行ったデータと詳細な臨床情報が格納されています。遺伝...
運用機関:
東北大学 加齢医学研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Chlorocebus aethiops | Callithrix jacchus | ...
説明:
東北大学加齢医学研究所医用細胞資源センターは、国立大学の中で唯一の癌細胞バンクであり、国内外の研究者に多数の細胞株を供給しています。種々のヒト癌細胞、正常細胞、動物腫瘍細胞、正常機能保持細胞、単クロー...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
高品質で確実にアノテーション付けされたヒトとマウスのタンパク質コード領域のコアセットを集約し、提供しているデータベースです。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
Bacillus subtilis
説明:
JAFAN（枯草菌の日本機能解析ネットワーク）による枯草菌ORFデータベースです。枯草菌ゲノム上のORFと詳細なアノテーション、変異株リスト、マイクロアレイによる遺伝子発現パターンが掲載されています。
運用機関:
Technische Universitat Braunschweig
生物種:
Gallus gallus | Bos taurus | Cervus elaphus | Canis | Danio rerio | ...
説明:
酵素の機能と特性データを収集した総合的な酵素情報データベースです。データの大半は主要文献から手動で抽出したもので、酵素の機能、構造、生成反応、生物種、活性、実験手法、応用、変異体に関する情報を網羅して...
運用終了
脳画像データベース
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens | Macaca mulatta | Macaca fuscata
説明:
ヒト、ニホンザル、アカゲザルの脳のMRI画像の連続写真をデジタル化し、マウスのみの操作で簡便に参照可能なデータベースです。
運用機関:
東京大学
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコの突然変異体の写真を集めた画像集です。変異遺伝子名をクリックするとカイコの画像が表示されます。
運用機関:
東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種:
説明:
情報検索技術と情報抽出技術を用いて、概念ネットワークを自動的に描画するシステムです。このシステムでは、(1)概念の関係性が1件以上の文献アブストラクトに明確に記述されている、(2)それぞれの概念がME...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
生体分子構造の画像を収集したデータベースです。核酸、タンパク質、タンパク質-DNA複合体、アミノ酸と塩基の相互作用が登録されています。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Hordeum vulgare
説明:
Barley DBでは、岡山大学資源植物科学研究所がナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）オオムギの代表機関として保存している分譲可能なオオムギリソース情報（オオムギ各系統の種子や穂の写真、...
運用機関:
ATLAS
生物種:
説明:
「Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology」はオンラインの査読付きジャーナルおよびデータベースで、 癌や高発癌性疾患...
運用終了
ARTADE: ARabidopsis Tiling-Array-based Detection of Exons
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナのゲノムワイドタイリングアレイデータのアノテーションのためのプログラムです。シロイヌナズナのタイリングアレイデータにATRADEを適用した結果をデータベース化し、Webから検索できるよう...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
遺伝子発現を含む機能ゲノミクス実験データの欧州版アーカイブです。ユーザはMIAMEおよびMINSEQE形式のデータを登録したりダウンロードすることが可能です。
運用終了
ARCHAIC: Archaebacterial Information Collection
運用機関:
独立行政法人産業技術総合研究所
生物種:
Pyrococcus sp. OT3 | Thermoplasma volcanium GSS1 | Archaeoglobus fulgidus
説明:
古細菌ゲノムDNAの配列とその遺伝子情報を提供しているデータベースです。古細菌ゲノムのDNA配列（独自に決定したものを含む）を独自に開発した生物情報学的手法を用いて解析することにより、ゲノム全体の構成...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
アミノ酸やアミノ酸ペアの物理化学的、生化学的な様々な特性を、過去の文献データの収集とクラスター解析により数値で指標化したデータベースです。AAindex1、AAindex2、AAindex3の3つのデ...
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト細胞株11ラインについて、5' SAGE法を用いて網羅的に遺伝子発現の解析を行った結果を収録したデータベースです。ライン間の発現の違いが分かりやすく表示されます。
オリジナルSAGE法は3'側の特...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
生体分子の構造、機能及び物性に関する統合型データベースです。蛋白質立体構造データベース (PDB)を中心に、PROSITE、Protein Mutant Database (PMD)などの機能情報、P...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Lotus japonicus
説明:
ミヤコグサの98838のEST配列と3488の完全長cDNA配列を蓄積したデータベースです。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
説明:
LC-FT/ICR-MS解析で得たフラグメントイオンの構造を予測したFT-MS、IT-MS/MS、FT-MS/MSのスペクトルデータを格納したメタボロミクスデータベースです。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana | Solanum lycopersicum | Brassica oleracea var. capitata | Chlamydomonas reinhardtii | Dicksonia antarctica | ...
説明:
KomicMarket (Kazusa Omics Data Market)は、代謝物を含むシステムバイオロジーやマルチオミックス解析に強く興味を持つ研究者により開発、運用されています。
Komic...
運用機関:
University of Alberta/Department of Computing Science
生物種:
説明:
薬剤の化学的、薬理的、薬事的データとそのターゲット（配列、構造、パスウエイ）の詳細情報を収集、統合したバイオインフォマティクスおよびケモインフォマティクスのリソースです。薬剤エントリー約4,800件の...
休止
GeneMap DB
運用機関:
Children's Hospital of Philadelphia
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトBAC (bacterial artificial chromosome) クローンの情報に関するデータベースです。各クローンについて、染色体上の位置、制限酵素処理パターン、対応するSTSマーカー...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
マウスのFREP解析の関連性と、ヒトを中心とする種間の比較をまとめたデータベースルールベースの知識発見支援システムです。
運用機関:
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科
生物種:
Mus musculus
説明:
遺伝子トラップで得たマウスES細胞のデータベースです。
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
ヒト疾患モデルマウス（ライソゾーム病モデル、生活習慣病モデル、ネフローゼモデル、心筋症モデルなど）を収集し、提供しています。25 疾患・評価系に関連する、144系統のマウスの情報があります。さらに、マ...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Pan troglodytes | Macaca fascicularis
説明:
主にヒトやマウスの遺伝子を凍結保存し、クローン情報の公開と分譲を行うサイトです。マウス脳cDNAクローン、カニクイザルcDNAクローン、染色体特異的クローン、ヒト疾患関連遺伝子cDNAクローンや正常な...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus | Mus musculus | Oryctolagus cuniculus | Cricetinae | ...
説明:
疾患研究資源の所在情報のデータベースです。実験動物、疫学研究、バイオバンクの3つのデータベースがあり、それぞれ、ヒト疾患研究のためのマウス・ラット等の系統情報、日本人を対象とする疫学研究情報、疾患を対...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
厚生労働省の難治性疾患克服研究事業で収集された難病患者試料（DNA、細胞など）を集約・保管し、分譲を行うバンク事業のサイトです。試料データベースの利用には利用者登録が必要です。
運用終了
Open TG-GATEs
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus norvegicus
説明:
131化合物（医薬品等）のin vivo（ラットの肝臓と腎臓）およびin vitro（ヒトとラットの肝細胞） 暴露データ（遺伝子発現データ、毒性学データ）を集積したデータベースです。遺伝子発現データと...
運用終了
GENE-TOX: Genetic Toxicology Data Bank
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
3,000以上の化学物質の遺伝毒性テストデータを収載しています。各物質について、実施された試験方法、ホスト、試験結果、文献情報等を確認できます。
2019年よりGENE-TOXの内容はアップデートさ...
運用終了
DART: Developmental and Reproductive Toxicology Database
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
生殖毒性試験に関する文献データを収載したデータベースです。
2019年よりDARTの内容はPubMed の “DART subset" として移行しました。
移行に関する情報は以下に掲載されていま...
運用終了
TOXLINE: Toxicology Literature Online
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
毒性に関する文献データを収載したデータベースです。
2019年よりTOXLINEの内容はPubMed の“Toxicology subset” として移行しました。
アーカイブ化されたデータの取得...
運用終了
CCRIS: Chemical Carcinogenesis Research Information System
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
8,000以上の化学物質の発がん性や変異原性、腫瘍プロモーション、助発ガン性などについての試験結果とその条件が集められています。一般的に受け入れられているプロトコルに従った研究からのデータが抽出されて...
運用終了
HSDB: Hazardous Substances Data Bank
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
5,000以上の潜在的危険有害化学物質の毒性に焦点を当てた毒性データファイルです。ヒト曝露値、産業衛生、緊急時の取扱手順、環境運命、法的要求事項やその他の関連事項情報などが収載されています。すべてのデ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
All
説明:
農業生物資源ジーンバンクでは、遺伝資源に関する情報をデータベース化し、オンラインで公開しています。遺伝資源の配布を希望される方にもご利用いただくことができます。植物遺伝資源、動物遺伝資源、微生物遺伝資...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Embryophyta
説明:
日本植物病理学会編集の日本植物病名目録に記載された情報を、同学会の許可を得て転載したデータベースです。宿主の索引から検索することも可能です。
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 畜産草地研究所
生物種:
Viridiplantae
説明:
日本の草地生態系における生物群集の動態を調査したデータベースです。地域別、草地の種類別に植生データを検索できます。「草地の動態に関する研究」の第 I 期 (1972−1981年)で得られたデータを収録...
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 果樹茶業研究部門
生物種:
Malus pumila | Pyrus pyrifolia | Castanea crenata | Diospyros kaki | Vitaceae | ...
説明:
日本国内において育成された果樹とお茶の品種に関するデータベースです。りんご、なし、くり、かき、もも、ぶどう、あんず、すもも、うめ、かんきつ、茶について品種名、主要特性や写真、登録状況、栽培適地、苗の入...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Hexapoda
説明:
ELKUTypeは、九州大学農学研究院昆虫学教室所蔵のタイプ標本情報のデータベースです。タイプ(模式標本)は、新種等のタクソン(分類単位)が設立され、記載命名された時に用いられた標本で、その中の1個体...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Apis mellifera
説明:
日本産ハナバチ類画像データベース(HANABACHI)は、 日本産の全種のハナバチに関する、画像を含めた種情報のデータベースです。 各レコードには、科名、属名、種名、和名、分布、模式産地、模式標本の所...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Encyrtidae
説明:
日本産トビコバチ類画像データベースTOBIKOBACHIは、立川哲三郎博士のコレクションに基づいた日本産トビコバチに関する、画像を含めた種情報のデータベースです。各レコードは、科名、属名、種名、和名、...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）