データベースのレコード一覧 (件数: 2589)
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その他
TABR: Tropical Asian Bees Reference Database
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Apoidea
説明:
熱帯アジア産ハナバチ類文献データベース(TABR)は、熱帯・亜熱帯アジア産ハナバチ類に関する主要な文献について、掲載された各文献中のハナバチの分類単位(種、属、科等の学名)を一つのレコードとした英語に...
運用機関:
京都工芸繊維大学 ショウジョウバエ遺伝資源センター
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエにおいてGal4-UAS法に基づくエンハンサートラップ系統をNPコンソーシアムとして約４６００の挿入系統を作成し、それらのすべてについてエンハンサー活性を胚および幼虫において検定しまし...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
平成8年度より植物細胞開発銀行が提供をおこなっていた植物培養細胞のカタログです。植物細胞開発銀行の業務は2001年4月より理化学研究所バイオリソースセンターに移管しており、現在では実験植物開発室が行な...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
平成8年度より植物細胞開発銀行より提供をおこなっていた遺伝子材料について引き続き実験植物開発室より提供を行なっています。
オリジナルのサイトは運用終了しました。データは Exp-Plant Ca...
運用機関:
特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
理研ゲノム科学総合研究センター植物ゲノム機能情報研究グループ植物変異開発研究チームより寄託を受けたトランスポゾンタグライン（第１および第５染色体上に存在するDs因子の転移により挿入変異が生じたライン）...
運用機関:
特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Nicotiana tabacum
説明:
理研植物科学研究センター(PSC)より寄託を受けたタバコBY-2培養細胞ESTクローンのキーワード検索ができます。キーワードには、リソース番号（BRC）、BY-2 EST clone name、DDB...
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
出芽酵母遺伝子破壊株の形態（出芽の状態）の顕微鏡写真を収集し、形態の様々な特徴をパラメータ化しているデータベースです。細胞の大きさ、細長さ、芽の位置など細胞形態情報を定量的データとして取得する画像処理...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
仙台シロイヌナズナ種子保存センター（SASSC）より寄託されたシロイヌナズナ野生株・近縁種等の種子に関わるデータベースです。各エントリーには葉の表現系や開花情報、写真が掲載されています。
運用機関:
特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
理研ゲノム科学総合研究センター(GSC)より寄託を受けたシロイヌナズナ完全長cDNAクローン(RAFL clone)のキーワード検索ができます。キーワードには、リソース番号、NCBI Accessio...
運用終了
RDP: The Ribosomal Database Project
運用機関:
Michigan State University
生物種:
Archaea | Bacteria
説明:
細菌及び古細菌のrRNA配列を収めたデータベースです。rRNA配列のアラインメントの他に、類似配列検索ツール及びrRNA配列から生物種分類を行う解析ツール等を提供しています。
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Macaca fascicularis
説明:
カニクイザル (Macaca fascicularis) の脳、精巣、肝臓、骨髄、脾臓、膵臓、腎臓、心臓、胸腺由来のオリゴキャッピングcDNAライブラリーの情報を提供しています。約120,000の5'...
運用機関:
Stanford University
生物種:
Homo sapiens
説明:
薬物応答における遺伝的変異に関する知識を蓄積するデータベースです。PharmGKB、CPIC、PharmCATの各プロジェクトを統合し、新たなツールなどを追加しています。医薬品や低分子、ジェノタイプ、...
運用機関:
The State University of New Jersey
生物種:
説明:
核酸の構造情報を収集、配布することを目的としています。各エントリーにつき、核酸配列、構造とその特徴、最初に報告された文献、実験情報、PDBへのリンクなどが表示され、構造座標や構造因子ファイルのダウンロ...
MOKUROKU: 日本産昆虫目録データベース
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Arthropoda
説明:
昆虫目録データベース（MOKUROKU)は、日本産の全昆虫について1種または1亜種 (一部1変種を含む)を一つのレコードとしたデータベースです。日本語と英語に対応しています。各レコードには、科名、属名...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスのマイクロサテライトマーカーを収集したデータベースで、研究者からの新規データの登録も受け付けています。日本産野生マウス（Mus musculus molossinus)に注目し、マウス系統間の単...
運用終了
MGC: Mammalian Gene Collection
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Bos taurus
説明:
哺乳類の遺伝子全長のcDNAクローンデータベースです。このサイトでは主にヒト、マウス、ラット、ウシの遺伝子名やキーワードで検索でき、そのcDNAクローンの提供先情報などを得ることができます。
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Arthropoda
説明:
昆虫学文献データベース(KONCHUR)は日本の主要な昆虫学・動物学雑誌について、掲載された各論文中の昆虫(クモ・ダニ類を含む)の分類単位(種、属、科等の学名または和名)を一つのレコードとした文献デー...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Arthropoda
説明:
昆虫学データベース(KONCHU)は、日本および東アジア、大平洋地域産昆虫 (クモ・ダニ類を含む)に関する種情報データベースの総称で、次のデータベースを含んでいます：昆虫学文献データベース、有用昆虫画...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
JMSRは国内の入手可能なマウス・ラットリソースのほぼすべてを対象として検索できるデータベースです。本データベースを使って希望するリソースを探し出すと同時に、そのまま提供元の機関にアクセスして注文する...
運用機関:
京都工芸繊維大学 ショウジョウバエ遺伝資源センター
生物種:
Drosophilidae
説明:
ショウジョウバエ遺伝学のデータベースです。遺伝子一覧表示、唾液染色体のバンドの地図、体の部位の名称、ショウジョウバエ科の生物の紹介、系統分類に重要な文献の検索、2次元電気泳動によるプロテオーム解析結果...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Pan troglodytes | Canis lupus familiaris | Bos taurus | Mus musculus | ...
説明:
全ゲノム配列が決定された20種類の真核生物の間で自動的検出したホモログ遺伝子のセット、およびmRNAやタンパク質の配列データを提供しています。他の生物種のUniGene配列でホモログの可能性があるもの...
運用機関:
Los Alamos National Secutiry, LLC
生物種:
Human immunodeficiency virus
説明:
このデータベースはヒト免疫不全ウィルスの塩基配列、エピトープ、薬剤耐性変異、ワクチンの臨床試験に関する情報が含まれています。
運用機関:
Institute of Medical Genetics in Cardiff
生物種:
Homo sapiens
説明:
このデータベースは、ヒト遺伝病の原因核遺伝子と遺伝病関連遺伝子の生殖細胞における変異情報を網羅的に収載しています。
運用機関:
長浜バイオ大学
生物種:
説明:
タンパク質の立体構造がどのような低分子（ヘテロ原子）との共結晶で決定されているかを知ることを目的に、Protein Data Bank (PDB)にエントリーされているタンパク質と低分子の相互作用を収...
休止
HarvEST
運用機関:
University of California
生物種:
Hordeum vulgare | Brachypodium | Manihot esculenta | Citrus | Musa | ...
説明:
大麦、ヤマカモジグサ属、ミカン属、コーヒー、ササゲ、バナナ、オオバコ、ダイズ、イネ、小麦のEST配列を提供しています。各生物種の配列や関連する遺伝子情報は、専用のソフトウェアをそれぞれダウンロードして...
運用機関:
Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture
生物種:
Avena | Triticeae
説明:
GrainGenesは様々なクラスの内容を検索することができます。クラスは研究に携わっている論文著者名、遺伝子名、文献、多型情報、タンパク情報、配列情報等があります。その他にもBLASTやCmap,G...
運用機関:
Pennsylvania State University
生物種:
Mammalia
説明:
哺乳類βグロビン遺伝子群の配列や実験結果を収めたデータベースです。自然におこるヒトヘモグロビンの変異とその影響、βグロビン遺伝子クラスターの調整に関する実験データについての情報が含まれており、その他、...
休止
ENU Mutants (A large Scale Mutagenesis Project in Riken GSC)
運用機関:
特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
理研GSC ENU誘発による大規模マウス突然変異体作製プロジェクトにおいて作製されたマウスラインと関連リソースを検索できます。プロトコルやプロジェクト情報も掲載されています。
運用機関:
Wellcome Trust Sanger Institute
生物種:
説明:
ゲノム解読された脊椎生物およびその他の主要な真核生物を対象として自動アノテーションを行い、その結果をゲノムビューワやデータベースとして公開しているプロジェクトです。EMBL-EBIとSanger Ce...
運用終了
DOGAN: a genome database of microorganisms sequenced at NITE
運用機関:
独立行政法人製品評価技術基盤機構
生物種:
Aeropyrum pernix K1 | Anaerolinea thermophila UNI-1 | Arthrospira platensis NIES-39 | Aspergillus oryzae RIB40 | Brevibacillus brevis NBRC 100599 | ...
説明:
NITEでゲノム解析した微生物のゲノムデータベースです。テキストと写真による詳細な菌株情報、塩基配列データ、ORFなどの遺伝子情報、遺伝子地図、プロテオーム解析結果を公開しています。これらの情報は、ア...
休止
PRINTS
運用機関:
The university of Manchester
生物種:
説明:
タンパク質のフィンガープリントを提供しているサイトです。Accession番号やPRINTS code、配列情報などで検索することが可能です。立体構造へのリンクや生物種間の配列比較を行うためのマルチプ...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
Cyanobacteria
説明:
らん藻遺伝子に関する全世界の研究者の知識を集約した「コミュニティデータベース」です。らん藻の１種であるSynechocystis sp. PCC6803 の全ゲノム配列は1996年にかずさDNA研究所...
運用終了
CIBEX: Center for Information Biology gene Expression database
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種:
説明:
CIBEXは、EBIのArrayExpress、NCBIのGene Expression Omnibus(GEO)とともに、遺伝子発現データの国際的レポジトリとして機能しているデータベースです。MGE...
休止
CGH Data Base: Comparative Genomic Hybridization Database
運用機関:
東京医科歯科大学 難治疾患研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
種々の癌細胞株のアレイCGH(Comparative Genomic Hybridization) 解析データを対象としたデータベースです。
運用終了
Cancer Chromosomes
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
ヒト、マウスのがん細胞株の核型解析結果、CGH解析結果、臨床情報等を提供するデータベースです。NCI/NCBIのSKY/M-FISH & CGH Database、NCIのMitelman Datab...
運用終了
Aspergillus oryzae EST DataBase
運用機関:
独立行政法人酒類総合研究所
生物種:
Aspergillus oryzae
説明:
麹菌EST解析プロジェクトで得られた成果に、さらに当研究所独自で解析した「ふすま麹」および「米麹」からのEST解析結果をあわせデータベースを作成し、公開しています。全21,368クローンから得られた7...
運用終了
ArkDB
運用機関:
The Roslin Institute （University of Edinburgh）
生物種:
Felis catus | Gallus gallus | Bos taurus | Cervus elaphus | Anas platyrhynchos | ...
説明:
家畜やその他の動物のゲノムマッピングデータを提供する公共レポジトリです。ネコ、ニワトリ、ウシ、シカ、アヒル、ウマ、ブタ、ウズラ、サケ、シーバス、ヒツジ、シチメンチョウのマイクロサテライト、SSCP等の...
運用終了
Arch GeNet: Archaeal Gene Network
運用機関:
独立行政法人産業技術総合研究所
生物種:
Thermoplasma volcanium GSS1
説明:
好熱性古細菌 (Thermoplasma volcanium GSS1)において、環境適応性に関わる発現プロファイルの同定結果を収録したデータベースです。3種類の環境下における遺伝子発現をマイクロアレ...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
ヒトのモデル動物として遺伝子機能の解明、病気の治療法や薬の開発に役立つマウスについて、その系統の収集・保存・提供を実施しています。このマウス系統検索では、フリーキーワード、系統名、遺伝子名、RBRC ...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）