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（2026年2月7日土曜日20：30～21：00）
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データベースのレコード一覧 (件数: 2589)
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生物種
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その他
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
酵素反応のメカニズムに関するデータベースです。酵素について、タンパク質の配列や構造、触媒残基の位置、補助因子、反応メカニズムなどのアノテーション情報を収録しています。Protein Data Bank...
運用機関:
Max-Planck-Institut fur Entwicklungsbiologie
生物種:
説明:
複数のゲノム配列で保存されている非コードDNA領域は、制御エレメントである可能性が高いと考えられます。そこで、10種類の脊椎動物の相同遺伝子の組の上流領域から、保存されている非コード領域を収集し、デー...
運用終了
CluSTr: Clusters of SWISS-PROT and TrEMBL proteins database
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
UniProtやIPIに登録されているタンパク質を関連のあるグループに自動的に分類したデータベースです。分類手法は、タンパク配列間のペアワイズ比較法に基づいています。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Chlamydomonas reinhardtii
説明:
かずさDNA研究所で決定したクラミドモナスのEST配列と、非冗長タンパク配列データベースとの間で行ったblastx検索の結果が収録されています。
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
生命プロセスに介在する小分子化合物の辞典です。ゲノムに直接コード化されている分子（例：核酸、タンパク、ペプチド）はこのデータベースの対象外です。登録されているデータは、多数の情報源のデータを組み合わせ...
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
Homo sapiens
説明:
癌の遺伝子発現データ及び臨床情報の統合データベースです。乳がん、結腸直腸がん、肝細胞がん、食道がん、甲状腺がん、胃がんの遺伝子発現プロファイル解析を行ったデータと詳細な臨床情報が格納されています。遺伝...
運用機関:
東北大学 加齢医学研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Chlorocebus aethiops | Callithrix jacchus | ...
説明:
東北大学加齢医学研究所医用細胞資源センターは、国立大学の中で唯一の癌細胞バンクであり、国内外の研究者に多数の細胞株を供給しています。種々のヒト癌細胞、正常細胞、動物腫瘍細胞、正常機能保持細胞、単クロー...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
高品質で確実にアノテーション付けされたヒトとマウスのタンパク質コード領域のコアセットを集約し、提供しているデータベースです。
運用機関:
熊本大学 生命資源研究・支援センター
生物種:
Mus musculus
説明:
熊本大学生命資源開発研究・支援センター動物資源開発研究部門(CARD)に保存されている遺伝子改変マウスの系統、遺伝子、文献、疾患および応用分野に関する情報が記載されています。 また、寄託、分与/分譲（...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
Bacillus subtilis
説明:
JAFAN（枯草菌の日本機能解析ネットワーク）による枯草菌ORFデータベースです。枯草菌ゲノム上のORFと詳細なアノテーション、変異株リスト、マイクロアレイによる遺伝子発現パターンが掲載されています。
運用機関:
Technische Universitat Braunschweig
生物種:
Gallus gallus | Bos taurus | Cervus elaphus | Canis | Danio rerio | ...
説明:
酵素の機能と特性データを収集した総合的な酵素情報データベースです。データの大半は主要文献から手動で抽出したもので、酵素の機能、構造、生成反応、生物種、活性、実験手法、応用、変異体に関する情報を網羅して...
運用終了
脳画像データベース
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens | Macaca mulatta | Macaca fuscata
説明:
ヒト、ニホンザル、アカゲザルの脳のMRI画像の連続写真をデジタル化し、マウスのみの操作で簡便に参照可能なデータベースです。
運用機関:
東京大学
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコの突然変異体の写真を集めた画像集です。変異遺伝子名をクリックするとカイコの画像が表示されます。
運用機関:
東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種:
説明:
情報検索技術と情報抽出技術を用いて、概念ネットワークを自動的に描画するシステムです。このシステムでは、(1)概念の関係性が1件以上の文献アブストラクトに明確に記述されている、(2)それぞれの概念がME...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
生体分子構造の画像を収集したデータベースです。核酸、タンパク質、タンパク質-DNA複合体、アミノ酸と塩基の相互作用が登録されています。
運用機関:
The Berkeley Drosophila Genome Project
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエゲノムプロジェクトのホームページです。ゲノム配列、配列アノテーション、ESTやcDNA、遺伝子発現パターン等のデータを公開しています。クローンやライブラリの分配も行っています。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Hordeum vulgare
説明:
Barley DBでは、岡山大学資源植物科学研究所がナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）オオムギの代表機関として保存している分譲可能なオオムギリソース情報（オオムギ各系統の種子や穂の写真、...
運用機関:
ATLAS
生物種:
説明:
「Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology」はオンラインの査読付きジャーナルおよびデータベースで、 癌や高発癌性疾患...
運用終了
ARTADE: ARabidopsis Tiling-Array-based Detection of Exons
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナのゲノムワイドタイリングアレイデータのアノテーションのためのプログラムです。シロイヌナズナのタイリングアレイデータにATRADEを適用した結果をデータベース化し、Webから検索できるよう...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
遺伝子発現を含む機能ゲノミクス実験データの欧州版アーカイブです。ユーザはMIAMEおよびMINSEQE形式のデータを登録したりダウンロードすることが可能です。
運用終了
ARCHAIC: Archaebacterial Information Collection
運用機関:
独立行政法人産業技術総合研究所
生物種:
Pyrococcus sp. OT3 | Thermoplasma volcanium GSS1 | Archaeoglobus fulgidus
説明:
古細菌ゲノムDNAの配列とその遺伝子情報を提供しているデータベースです。古細菌ゲノムのDNA配列（独自に決定したものを含む）を独自に開発した生物情報学的手法を用いて解析することにより、ゲノム全体の構成...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
アミノ酸やアミノ酸ペアの物理化学的、生化学的な様々な特性を、過去の文献データの収集とクラスター解析により数値で指標化したデータベースです。AAindex1、AAindex2、AAindex3の3つのデ...
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト細胞株11ラインについて、5' SAGE法を用いて網羅的に遺伝子発現の解析を行った結果を収録したデータベースです。ライン間の発現の違いが分かりやすく表示されます。
オリジナルSAGE法は3'側の特...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
生体分子の構造、機能及び物性に関する統合型データベースです。蛋白質立体構造データベース (PDB)を中心に、PROSITE、Protein Mutant Database (PMD)などの機能情報、P...
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
All
説明:
国内外の生命科学系データベースの所在情報 (URL)と、データベースについての説明や生物種などの基本的な属性情報 (メタデータ)をまとめたデータベースです。
文部科学省、厚生労働省、農林水産省、経済産...
運用機関:
University of Alberta/Department of Computing Science
生物種:
説明:
薬剤の化学的、薬理的、薬事的データとそのターゲット（配列、構造、パスウエイ）の詳細情報を収集、統合したバイオインフォマティクスおよびケモインフォマティクスのリソースです。薬剤エントリー約4,800件の...
休止
GeneMap DB
運用機関:
Children's Hospital of Philadelphia
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトBAC (bacterial artificial chromosome) クローンの情報に関するデータベースです。各クローンについて、染色体上の位置、制限酵素処理パターン、対応するSTSマーカー...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
ヒト疾患モデルマウス（ライソゾーム病モデル、生活習慣病モデル、ネフローゼモデル、心筋症モデルなど）を収集し、提供しています。25 疾患・評価系に関連する、144系統のマウスの情報があります。さらに、マ...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Pan troglodytes | Macaca fascicularis
説明:
主にヒトやマウスの遺伝子を凍結保存し、クローン情報の公開と分譲を行うサイトです。マウス脳cDNAクローン、カニクイザルcDNAクローン、染色体特異的クローン、ヒト疾患関連遺伝子cDNAクローンや正常な...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus | Mus musculus | Oryctolagus cuniculus | Cricetinae | ...
説明:
疾患研究資源の所在情報のデータベースです。実験動物、疫学研究、バイオバンクの3つのデータベースがあり、それぞれ、ヒト疾患研究のためのマウス・ラット等の系統情報、日本人を対象とする疫学研究情報、疾患を対...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
厚生労働省の難治性疾患克服研究事業で収集された難病患者試料（DNA、細胞など）を集約・保管し、分譲を行うバンク事業のサイトです。試料データベースの利用には利用者登録が必要です。
運用終了
Open TG-GATEs
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus norvegicus
説明:
131化合物（医薬品等）のin vivo（ラットの肝臓と腎臓）およびin vitro（ヒトとラットの肝細胞） 暴露データ（遺伝子発現データ、毒性学データ）を集積したデータベースです。遺伝子発現データと...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Hexapoda
説明:
ELKUTypeは、九州大学農学研究院昆虫学教室所蔵のタイプ標本情報のデータベースです。タイプ(模式標本)は、新種等のタクソン(分類単位)が設立され、記載命名された時に用いられた標本で、その中の1個体...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Apis mellifera
説明:
日本産ハナバチ類画像データベース(HANABACHI)は、 日本産の全種のハナバチに関する、画像を含めた種情報のデータベースです。 各レコードには、科名、属名、種名、和名、分布、模式産地、模式標本の所...
TOBIKOBACHI: Image Database of Encyrtid Wasp Collection
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Encyrtidae
説明:
日本産トビコバチ類画像データベースTOBIKOBACHIは、立川哲三郎博士のコレクションに基づいた日本産トビコバチに関する、画像を含めた種情報のデータベースです。各レコードは、科名、属名、種名、和名、...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明:
健康食品に利用されている素材（成分）一覧から目的の素材名を選ぶと、素材の概要が表示されます。「すべての情報を表示」ボタンを押すと、構造式、分析法、有効性、安全性、総合評価、参考文献など詳細情報が得られ...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
本データベースはマウスの転写因子遺伝子とその関連遺伝子を収録したデータベースです。マウスゲノムの非冗長な転写因子遺伝子セットが提供されます。遺伝子名、Gene Ontology、InterPro、Re...
運用終了
PRIMe - Standard Spectrum Search: Platform for RIKEN Metabolomics - Standard Spectrum Search
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
説明:
PRIMeプロジェクトで分析された標準化合物を検索するウェブアプリケーションです。Standard Spectrum Searchでは、PRIMeプロジェクトで測定されている標準化合物を化合物名または...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター
生物種:
説明:
標準化合物の2次元NMRスペクトルデータベースを対象として、ピーク値により検索するウェブアプリケーションです。独自の1Hおよび13Cのケミカルシフトデータベースに基づき、多数の代謝物とユーザーのNMR...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Bos taurus | Felis catus | Gallus gallus | Pan troglodytes | Canis lupus familiaris | ...
説明:
JCRBが保有する培養細胞を分譲するためのデータベースです。ヒト、マウス、ラットなどの組織細胞に加え、高発がん性遺伝病患者由来細胞、発光細胞（Luc発現細胞）、ヒトiPS細胞、マウスES細胞、霊長類細...
運用機関:
National Human Genome Research Institute, National Institute of Health
生物種:
Vertebrata
説明:
各生物種のヒストンタンパク質とその配列変異の多様性についてのデータベースです。H1、H2A、H2B、H3、H4の各多型タンパク質についてアミノ酸配列、アラインメント、αヘリックスやβストランド構造の位...
運用機関:
東京大学 大学院総合文化研究科
生物種:
Embryophyta | Bacteria | Metazoa | Fungi
説明:
Gclustデータベースは系統プロファイルによる検索を可能にした相同タンパク質データベースです。95生物種の全タンパク質の総当たりBLASTの結果に基づき、類似度の閾値を自動的に設定しながら相同タンパ...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明:
経済産業省「機能性RNAプロジェクト」の成果であるデータベース群のポータルサイト「ncRNA.org」の中のデータベースです。ncRNAの配列、構造、遺伝子発現情報をまとめています。
国立研究開発法...
DJI: Dictionary of Japanese Insect Names
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Hexapoda
説明:
日本産の全昆虫について、和名または学名を入力することによって、その文字列を含む昆虫のリストを学名と和名で表示する辞書です。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種:
説明:
DDBJがWWWならびにWeb APIで提供している高速なキーワード検索サービスです。国際塩基配列データベースのほか、生命科学分野の主要なデータベースに対して統合的な検索を行うことができます。SRSに...
運用機関:
Los Alamos National Laboratory
生物種:
Chlamydophila pneumoniae | Chlamydia trachomatis | Haemophilus ducreyi | Mycoplasma genitalium | Neisseria gonorrhoeae | ...
説明:
ヒトパピローマウイルスのデータベースです。遺伝子の詳細データや配列、系統樹、パスウェイなどを収録しています。現在、オリジナルのデータベースは運用を終了し、アーカイブとしてデータが見られるようになってい...
運用機関:
一般社団法人 日本質量分析学会
生物種:
説明:
代謝物質（基礎代謝、植物二次代謝標準物質）を高分解能質量分析によって測定したマススペクトルを収集したデータベース。国内外12機関のデータをまとめて検索、閲覧が可能であり、マニュアルが充実しています。
休止
HIV Structural Database and Chem-BLAST
運用機関:
National Institute of Standards and Technology
生物種:
Human immunodeficiency virus | Homo sapiens
説明:
HIVの構造データベース。2次元構造（化学式）、3次元構造（立体構造）どちらも見ることができます。
休止
Flytrap
運用機関:
The University of Edinburgh
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエ脳におけるP（Gal4）line の発現パターンを収録したデータベースです。
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
Ciona intestinalis
説明:
多細胞生物の発生の時間的経過に伴う３次元構造画像のデータベース。カタユウレイボヤの受精卵から孵化後幼生までの26段階の発生ステージについて、形態の3次元画像および断面画像を取得し、データベース化してい...
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統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）