データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
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運用機関:
首都大学東京
生物種:
Adiantum capillus-veneris
説明:
ホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に2次情報を追加したデータベースです。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められていますが、陸上植物(種子、シ...
運用機関:
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
蛍光タンパク質などで可視化された植物オルガネラの動画や静止画像、オルガネラ研究の解析方法や関連リンク集を収集したデータベースです。
「Electron Micrograph Database」...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Acacia mangium | Arabidopsis thaliana | Cosmos bipinnatus | Dicksonia antarctica | Escherichia coli | ...
説明:
MassBaseは代謝産物(メタボライト）に関するマススペクトラルタグ（MST）のアーカイブです。主に植物の生体サンプルやその代謝産物から得られた生のクロマトグラムデータおよびクロマトグラムデータを解...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明:
健康食品に利用されている素材（成分）一覧から目的の素材名を選ぶと、素材の概要が表示されます。「すべての情報を表示」ボタンを押すと、構造式、分析法、有効性、安全性、総合評価、参考文献など詳細情報が得られ...
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 畜産草地研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
全国の飼料畑等で問題となっている外来雑草に関するデータベースです。科名、種名、学名、葉の形状、種子の形状から検索でき、外来雑草の解説、群生写真、全体写真、種子の写真を確認できます。本データベースは「写...
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 動物衛生研究部門
生物種:
Viruses | Bacteria | Bos taurus | Sus scrofa | Galloanserae | ...
説明:
家畜伝染病と届出伝染病について、原因、疫学、臨床症状、病理学的変化、病原学的検査、抗体検査、予防・治療、発生情報、参考文献を調べることができます。
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 動物衛生研究部門
生物種:
Bos taurus | Sus scrofa | Gallus gallus
説明:
都道府県の家畜保健衛生所職員の方を対象に、病理診断に役立てていただくための病理画像を提供しています。現在は、1)牛病、2)豚病、3)鶏病、4)その他 の各疾病の病理画像と参考情報を提供しています。
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
理化学研究所・長田抗生物質研究室では、研究室内外で合成された化合物や、放線菌の二次代謝産物をはじめとする天然物の収集・保管、機器分析スペクトルなどをデータベース化し、これらを提供するシステムの構築を行...
運用機関:
国立研究開発法人国立成育医療研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
琉球大学医学部医科遺伝学（遺伝医学）により作成された奇形症候群を中心とする遺伝性疾患の総合データベースです。「UR-DBMS」は、奇形症候群や染色体異常を中心とし、遺伝性疾患全般を含む遺伝性疾患総合デ...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
アミノ酸、ポリマー、農薬、医薬品など164種類の有機材料と、半導体、誘電体を含む18種類の無機材料について、テラヘルツ帯の透過スペクトルを掲載したデータベースです。カーボンナノチューブ、シリコンをはじ...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
本データベースはマウスの転写因子遺伝子とその関連遺伝子を収録したデータベースです。マウスゲノムの非冗長な転写因子遺伝子セットが提供されます。遺伝子名、Gene Ontology、InterPro、Re...
運用終了
SWISS-2DPAGE: SWISS-Two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis database
運用機関:
Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Arabidopsis thaliana | Dictyostelium discoideum | Escherichia coli | ...
説明:
様々な2D-PAGEやSDS-PAGEを用いて同定されたタンパク質のデータを収録しています。各エントリーには、タンパク質名、生物種、文献、電気泳動マップと該当スポット、UniProtKB/Swiss-...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Rattus norvegicus
説明:
理研バイオリソースセンターで管理しているラットの系統の一覧が表示されます。RBRC No.やタイプ、系統名、特徴、文献、提供者が記述されています。
運用終了
RPOPDB: RIKEN Populus Database
運用機関:
特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Populus
説明:
10種類のポプラとヨーロッパクロマツのゲノム情報を収録したデータベースです。mRNAは、GenBank/DDBJ/EMBLを情報源としています。理研で収集、アノテーションしたPopulus nigra...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 バイオリソース研究センター
生物種:
Manihot esculenta
説明:
理研バイオリソースセンターが提供する、キャッサバの完全長cDNAクローンのデータベース検索サイトです。リソース番号、NCBI番号、クローン名やBLASTによる検索が可能です。
オリジナルのサイトは運...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana | Physcomitrella patens | Manihot esculenta | Populus | Nicotiana tabacum | ...
説明:
理研BRC実験植物開発室で提供しているシロイヌナズナを中心とした植物遺伝子材料のBLAST検索ができます。
オリジナルのサイトは運用終了しました。データは Exp-Plant Catalog （ht...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
理研バイオリソースセンターが生物遺伝材料として提供する微生物株を収録しています。様々な種の微生物について、株としての情報を特性や表現型情報も含めて提供しています。生物種名、来歴、培養培地などにより検索...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus norvegicus | Mus musculus | Macaca fuscata | Pan troglodytes
説明:
理研・遺伝子材料開発室（旧DNA開発銀行）が収集した汎用宿主ベクター系とクローン化遺伝子を中心に、様々な研究機関、研究者から寄付・寄託された「動物および微生物のDNA」の収集・保存・提供を行うサイトで...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Cricetulus griseus | Mesocricetus auratus | ...
説明:
理研・細胞材料開発室が収集、培養し、提供する細胞株のデータベースです。従来の培養細胞株に加えて、ヒトのiPS細胞、胚性幹細胞（ES細胞）、体性幹細胞（臍帯血、間葉系幹細胞等）、マウスやウサギのiPS細...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナのアクティベーションタグラインは、理研バイオリソースセンター（BRC）または理研ゲノム科学総合研究センター植物ゲノム機能情報研究グループ植物変異探索研究チームにおいて、Dr. Walde...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
このデータベースは、約500のシロイヌナズナ形態的変異株についての形質とT-DNA挿入部位のゲノムDNA配列について記載されたものです。
アクティベーションタギング法によりシロイヌナズナの突然変異体...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
理研ENU-based gene-driven mutagenesis system (RGDMS)は次世代版ジーンターゲッティングシステムとして一般に公開しています。新規変異マウス研究開発チームは、...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Viruses
説明:
理研バイオリソースセンター遺伝子材料開発室で収集している組換えレトロウイルス、組換えアデノウイルス、DNAクローンのデータベースです。組換えアデノウイルスは、研究で実際に使用されたクローンならびに当開...
運用終了
PRIMe - Standard Spectrum Search: Platform for RIKEN Metabolomics - Standard Spectrum Search
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
説明:
PRIMeプロジェクトで分析された標準化合物を検索するウェブアプリケーションです。Standard Spectrum Searchでは、PRIMeプロジェクトで測定されている標準化合物を化合物名または...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター
生物種:
説明:
標準化合物の2次元NMRスペクトルデータベースを対象として、ピーク値により検索するウェブアプリケーションです。独自の1Hおよび13Cのケミカルシフトデータベースに基づき、多数の代謝物とユーザーのNMR...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
理化学研究所（長田抗生物質研究室、ケミカルバイオロジー研究グループ）で精製された新規天然化合物一覧です。化合物名、生物活性、産生生物、参考文献、化学構造が収録されています。
運用機関:
群馬大学 生体調節研究所附属生体情報ゲノムリソースセンター
生物種:
Homo sapiens
説明:
MIAMI法（マイクロアレイによるゲノムワイドなメチル化解析法）について詳しい実験手法を示すとともに、この手法を用いた解析により、様々な疾患とエピジェネティクスの関係の例をまとめています。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Solanum lycopersicum | Lotus japonicus | Glycine max | ...
説明:
遺伝子の発現データと代謝産物の蓄積データを、代謝経路マップ上で同時に表示することができるビューワーです。ユーザー自身のDNAマイクロアレイデータや代謝産物分析データを、インターネットブラウザを介してK...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコゲノム配列を元にタンパク質をコードする遺伝子構造を自動予測するシステムです。予測処理では複数の解析ツール(GeneScan、FGENESH、HMMER等)の解析結果を統合して行なっています。カイ...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
Bos taurus | Felis catus | Gallus gallus | Pan troglodytes | Canis lupus familiaris | ...
説明:
JCRBが保有する培養細胞を分譲するためのデータベースです。ヒト、マウス、ラットなどの組織細胞に加え、高発がん性遺伝病患者由来細胞、発光細胞（Luc発現細胞）、ヒトiPS細胞、マウスES細胞、霊長類細...
運用機関:
National Human Genome Research Institute, National Institute of Health
生物種:
Vertebrata
説明:
各生物種のヒストンタンパク質とその配列変異の多様性についてのデータベースです。H1、H2A、H2B、H3、H4の各多型タンパク質についてアミノ酸配列、アラインメント、αヘリックスやβストランド構造の位...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
タンパク質のX線結晶解析に用いられる重原子誘導体の作成支援を目的としたデータベースシステムです。既知の重原子誘導体をデータベース化しており、結晶構造解析を行いたいタンパク質のアミノ酸配列を入力すると、...
運用終了
AOE: All Of gene Expression
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
EBI ArrayExpress に登録されている遺伝子発現データを容易に検索、閲覧するためのインターフェースです。ArrayExpress のメタデータから集計した統計値をインタラクティブなグラフに...
運用機関:
東京大学 大学院総合文化研究科
生物種:
Embryophyta | Bacteria | Metazoa | Fungi
説明:
Gclustデータベースは系統プロファイルによる検索を可能にした相同タンパク質データベースです。95生物種の全タンパク質の総当たりBLASTの結果に基づき、類似度の閾値を自動的に設定しながら相同タンパ...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明:
経済産業省「機能性RNAプロジェクト」の成果であるデータベース群のポータルサイト「ncRNA.org」の中のデータベースです。ncRNAの配列、構造、遺伝子発現情報をまとめています。
国立研究開発法...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Hexapoda
説明:
日本産の全昆虫について、和名または学名を入力することによって、その文字列を含む昆虫のリストを学名と和名で表示する辞書です。
運用機関:
首都大学東京
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエのGSベクター挿入系統データベースです。個々の系統の情報やベクター隣接配列、GAL4存在下で強制発現される遺伝子および表現型情報が登録されています。 GS系統番号、遺伝子名、染色体領域...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナの葉緑体タンパク質を産生すると予想した遺伝子に、トランスポゾンまたはT-DNAを挿入して破壊したタグラインを大規模に収集し、植物体の形態変化を育成プレート上で観察・分類した結果、異常な表...
運用機関:
University of Wisconsin System Board of Regents
生物種:
All
説明:
ADIT-NMR、SMSDepにより登録されたペプチド、タンパク質、核酸等、生体高分子のNMR実験データを公開しています。データの検索、各データエントリーからPDBなど他のデータベースへのリンク、デー...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
バイオマーカー候補と臨床的障害の関係から新規のバイオマーカー候補を見出すためのデータベースです。MEDLINE、OMIM、PPIs等の文献情報からバイオマーカー関連の情報をまとめています。キーワード検...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種:
説明:
DDBJがWWWならびにWeb APIで提供している高速なキーワード検索サービスです。国際塩基配列データベースのほか、生命科学分野の主要なデータベースに対して統合的な検索を行うことができます。SRSに...
運用機関:
Los Alamos National Laboratory
生物種:
Chlamydophila pneumoniae | Chlamydia trachomatis | Haemophilus ducreyi | Mycoplasma genitalium | Neisseria gonorrhoeae | ...
説明:
ヒトパピローマウイルスのデータベースです。遺伝子の詳細データや配列、系統樹、パスウェイなどを収録しています。現在、オリジナルのデータベースは運用を終了し、アーカイブとしてデータが見られるようになってい...
運用機関:
一般社団法人 日本質量分析学会
生物種:
説明:
代謝物質（基礎代謝、植物二次代謝標準物質）を高分解能質量分析によって測定したマススペクトルを収集したデータベース。国内外12機関のデータをまとめて検索、閲覧が可能であり、マニュアルが充実しています。
休止
HIV Structural Database and Chem-BLAST
運用機関:
National Institute of Standards and Technology
生物種:
Human immunodeficiency virus | Homo sapiens
説明:
HIVの構造データベース。2次元構造（化学式）、3次元構造（立体構造）どちらも見ることができます。
休止
Flytrap
運用機関:
The University of Edinburgh
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエ脳におけるP（Gal4）line の発現パターンを収録したデータベースです。
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
遺伝子に、文献情報をマッピングしたデータベースです。
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
Ciona intestinalis
説明:
多細胞生物の発生の時間的経過に伴う３次元構造画像のデータベース。カタユウレイボヤの受精卵から孵化後幼生までの26段階の発生ステージについて、形態の3次元画像および断面画像を取得し、データベース化してい...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Apoidea
説明:
熱帯アジア産ハナバチ類文献データベース(TABR)は、熱帯・亜熱帯アジア産ハナバチ類に関する主要な文献について、掲載された各文献中のハナバチの分類単位(種、属、科等の学名)を一つのレコードとした英語に...
運用機関:
京都工芸繊維大学 ショウジョウバエ遺伝資源センター
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエにおいてGal4-UAS法に基づくエンハンサートラップ系統をNPコンソーシアムとして約４６００の挿入系統を作成し、それらのすべてについてエンハンサー活性を胚および幼虫において検定しまし...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
平成8年度より植物細胞開発銀行が提供をおこなっていた植物培養細胞のカタログです。植物細胞開発銀行の業務は2001年4月より理化学研究所バイオリソースセンターに移管しており、現在では実験植物開発室が行な...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）