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AcEST: Adiantum capillus-veneris EST

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00839
名称データベースの名称 AcEST
別称データベースの別称 Adiantum capillus-veneris EST
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://togodb.dbcls.jp/acest
運用機関名現在データベースを運用している機関名 首都大学東京 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 ホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に2次情報を追加したデータベースです。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められていますが、陸上植物(種子、シダ、コケ植物)の中でシダ植物のゲノムに関する研究は発展していません。そこで、光形態形成に関する研究に用いられてきたホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)をシダのモデル植物として位置づけるために、 EST配列の解析を行いました。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Adiantum capillus-veneris (13818)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:15940394
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/acest/download.html
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/acest/LATEST/README.html
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/acest/lic.html
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/acest/desc.html
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=lecture&page=1&query=AcEST
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-01-24
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license