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（2026年2月7日土曜日20：30～21：00）
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データベースのレコード一覧 (件数: 2589)
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生物種
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地域
その他
運用機関:
京都大学 大学院医学研究科 附属動物実験施設
生物種:
Rattus norvegicus
説明:
ラットの系統、特性、研究対象分野の検索、分与申し込みのサービスを提供しているサイトです。ラット資源の保存情報、世代数、特性や繁殖方法、参考文献などの情報が提供されています。
運用機関:
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスES細胞に対して新規の遺伝子トラップ法(UPATrap)を用い、ランダムな遺伝子破壊変異株を作成しました。トラップされた遺伝子の配列と、さらにはその配列に基づいて作成したDNAマイクロアレイを用...
運用機関:
University of Reading
生物種:
説明:
Species 2000は、生物多様性研究の基本となるデータセットとして、現在知られている地球上の生物（動物、植物、菌類、微生物）の種を全て列挙し、地球生物種カタログの作成を目指しているプロジェクトで...
運用機関:
九州大学 大学院生物資源環境科学府
生物種:
説明:
遺伝子発現や細胞増殖を制御する膨大なシグナル伝達パスウェイ情報を整理し、可視化したデータベースです。SPADでは、細胞内シグナルパスウエイの引き金となる細胞外シグナル分子に基づき、成長因子、サイトカイ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens
説明:
1～数塩基の置換、挿入/欠失、反復等の多型情報からなるデータベースです。各SNPについて、集団間での多型頻度の違いを視覚的に比較することもできます。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Homo sapiens | Pan troglodytes | Pan paniscus | Gorilla gorilla | Pongo pygmaeus | ...
説明:
チンパンジーおよびゴリラの塩基配列、ヒトと類人猿の塩基配列の比較結果、類人猿ゲノム計画(Silver)で決定した塩基配列を基にした比較結果を掲載している。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコリソースの総合データベースです。系統、変異体遺伝子情報のほか、文献情報等が掲載されており、目的に応じて各種バイオリソースの提供を受けることができます。
運用機関:
東京大学
生物種:
Bombyx mori | Samia ricini | Bombyx mandarina
説明:
家蚕であるカイコ及び野蚕の一種であるエリサンはわが国独自のモデル生物であり、鱗翅目（絹糸昆虫および農業害虫の多くがここへ入る）の代表として世界の昆虫研究をリードする研究対象となっています。「SilkB...
運用機関:
Stanford University
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
スタンフォード大学による出芽酵母の分子生物学データベースです。出芽酵母のゲノムや生物学に関する様々な情報が収録されており、キュレーターによって情報の更新や維持がなされています。SGDでは、Gene N...
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
Cryptomeria japonica | Chamaecyparis obtusa
説明:
本データベースは、スギ（Cryptomeria japonica ）とヒノキ（Chamaecyparis obtusa ）の遺伝子の部分塩基配列（EST）、DNAマーカー、遺伝連鎖地図、遺伝的多様性な...
運用機関:
The Medical Research Council (MRC) Laboratory of Molecular Biology
生物種:
説明:
PBDに登録されたタンパク質を構造と進化に着目して分類したデータベースです。分類されたタンパク質は類縁関係による単純な階層構造ではなく、タイプ（形状）、構造、進化、その他の4つのカテゴリーに定義された...
運用機関:
東京大学 先端科学技術研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
SBM DBは包括的な遺伝子発現データベースです。 ヒトの正常組織や、様々な、組織や細胞、疾患状態や薬剤による遺伝子発現プロファイルを oligo-nuculeotide DNAマイクロアレイ「Gen...
運用機関:
宮崎大学 フロンティア科学実験総合センター
生物種:
Eukaryota | Archaea | Bacteria
説明:
24種の真核生物、4種の古細菌、4種の真正細菌のリボソームタンパク質遺伝子を収集したデータベースです。ヒト、マウス、フグ、ショウジョウバエ、線虫については、ミトコンドリアリボソームタンパク質遺伝子も収...
運用機関:
国立研究開発法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネのマイクロアレイプロジェクト(1999年開始)に関する総合的な情報が掲載されています。一般的なマイクロアレイの技術背景からプロジェクトで使用したアレイ解析のプロトコルや研究データ等の情報を参照でき...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネのミトコンドリアゲノム情報が掲載されています。 ミトコンドリアゲノムの配列や物理地図等の情報を参照できます。
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構によるオリジナルサイト（http: /...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネの各種組織や細胞内小器官を対象に2次元ゲル電気泳動を行い、そのスポットを収集したデータベースです。プロテオーム解析に関する様々な手法のプロトコルも掲載されています。
国立研究開発法人 農業・食品産...
運用終了
Rice PIPELINE
運用機関:
国立研究開発法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
複数のイネ関連データベースを統合し、各データベースの情報を検索できるようにしたシステムです。 お手持ちの配列による各データベースの配列検索 (BLAST)やIDによる検索ができ、グラフィカルな検索結果...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Rhizobiales | Frankia | Azoarcus | Rhodospirillales | Cupriavidus
説明:
財団法人かずさDNA研究所で全ゲノム配列決定したミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium loti MAFF303099を含む、19種の根粒菌の全ゲノム配列情報を収録しています。種毎に、ゲノム配列、...
運用機関:
Medical College of Wisconsin/Bioinformatics Research Center
生物種:
Rattus norvegicus
説明:
ラットゲノム研究の総合サイトです。ラット遺伝子に関する情報の他に、ラットの系統に関する情報、病態モデルラットに関するデータ、文献情報等を提供しています。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Eukaryota | Bacteria | Archaea | Avsunviroidae | Pospiviroidae | ...
説明:
異なる生物種由来の冗長性を排除したDNA, RNA, タンパク配列を収録したデータベースです。プラスミド、オルガネラ、ウイルス、古細菌、真正細菌、真核生物のアノテーション付けされた配列が含まれています...
運用終了
READ: Riken Expression Array Database
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
理研マウスcDNAマイクロアレイで取得した遺伝子発現データのデータベースです。実験情報とデータが登録されており、Web画面上でデータの抽出やグラフィカル表示機能を提供しています。
2013年に全てのR...
運用機関:
Reactome Team
生物種:
Homo sapiens | Arabidopsis thaliana | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | Canis lupus familiaris | ...
説明:
ヒトの生体内の主要反応経路や生化学反応を整備したデータベースです。ヒト以外の20生物種のデータも格納しており、ヒトとの比較ができます。ここに収録されている情報は、それぞれの分野の専門家が編集しているた...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナの完全長cDNAと変異株に関するサイトです。cDNAの遺伝子名、配列、関連する変異株の情報や、変異株のフェノタイプ、変異位置、3'末端配列の情報が収録されています。キーワード検索の他、フ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネアノテーションプロジェクト（RAP）によるイネゲノムの高精度注釈（アノテーション）情報を収録したデータベースです。論文からのマニュアルキュレーションによりアノテーション情報を追加しています。ゲノム...
運用終了
RAD: Rice Annotation Database
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネゲノム研究プログラム(RGP)で蓄積されたイネゲノム(1,3,4&10番染色体)のアノテーション情報及び包括的なゲノム解析情報を提供しています。ゲノム上の予測遺伝子や完全長cDNAのアノテーション...
運用機関:
富山大学 和漢医薬学総合研究所
生物種:
説明:
民族薬物データベースには、民族薬物資料館に保管されている生薬の標本情報及び学術情報が収録されています。その内、和漢薬4,800点（英語3,500点）、ユナニー生薬177点、タイ生薬668点、アーユルヴ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
MEDLINEおよび生命科学分野のジャーナル文献の書誌情報（タイトル、著者名、雑誌名、抄録など）を収録したデータベースです。全文をフリーで公開している文献については、提供サイトへのリンクが張られていま...
休止
ProTherm: Thermodynamic Database for Protein and Mutants
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
正常蛋白質及び実験的に作成した変異蛋白質の熱力学データ（ギブスの自由エネルギー変化、エンタルピー変化、変性温度、水中での変性温度等）を文献から抽出し、収録したデータベースです。蛋白質の立体構造や安定性...
休止
ProNIT: Thermodynamic Database for Protein-Nucleic Acid Interactions
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
実験的に決定されたタンパク質-核酸間の熱力学的相互作用データを収録したデータベースです。タンパク質情報、核酸情報、文献情報、実験条件、熱力学的パラメータ（結合定数、自由エネルギー変化、エンタルピー変化...
運用機関:
大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
説明:
基準振動解析によって得られたタンパク質立体構造の動的構造に関するデータを集めたデータベースです。タンパク質分子が基準振動モードでゆらぐ様子を、無料のプラグインChimeを使うことによって、アニメーショ...
運用機関:
Rhone-Alpes Bioinformatics Center
生物種:
説明:
Swiss-ProtとTrEMBLのデータから自動生成したタンパク質ドメインファミリーのデータベースです。ProDomデータベースはInterProプロジェクトの一部です。
運用機関:
財団法人蛋白質研究奨励会
生物種:
説明:
タンパク質研究奨励会のホームページです。タンパク質文献データベースである「PRF/LITDB」、アミノ酸配列データベースである「PRF/SEQDB」、合成物質データベースである「PRF/SYNDB」が...
運用機関:
九州大学 生体防御医学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
日本人におけるマイクロサテライトマーカーヘテロ接合度の情報（4868マーカー）をデータベース化したものです。日本人集団を対象とした連鎖解析や相関解析に有用なマーカー選択の基盤を整備しました。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
説明:
タンパク質工学への貢献を目的として作られた文献データベースです。対象は、自然変異、人工変異、ランダム変異、部位指定変異などの全ての変異体を含み、グロビン属と免疫グロブリン属以外の全てのタンパク質として...
運用機関:
James Hutton Institute
生物種:
Arabidopsis thaliana | Chlamydomonas reinhardtii | Medicago truncatula | Solanum lycopersicum | Lycopersicon hirsutum f. glabratum | ...
説明:
植物の核小体低分子RNAに関するデータベースを提供しているサイトです。配列情報、発現データ、rRNA変異サイトなどの情報が提供されています。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Embryophyta
説明:
高等植物遺伝子のプロモーター等の発現制御に関わる領域の塩基配列モチーフを論文から収集し、解説や文献、PubMedへのリンク、国際塩基配列データベースのアクセッション番号などを付加したデータベースです。...
運用機関:
Georgetown University Medical Center
生物種:
説明:
タンパク質とゲノムの研究をサポートする統合公開バイオインフォマティクスリソースです。PIRは、1984年にタンパク質配列の同定とアノテーションをサポートするためのリソースとしてNational Bio...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Physcomitrella patens
説明:
基礎生物学研究所より寄託を受けたヒメツリガネゴケ完全長cDNAクローンのキーワード検索ができます。キーワードには、リソース番号（BRC）、DDBJ accession number、clone nam...
運用機関:
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種:
Physcomitrella patens
説明:
無処理、オーキシン処理、サイトカイニン処理の原糸体由来のヒメツリガネゴケ完全長cDNAライブラリーから得られた８万以上のEST配列や相同性検索結果、実験プロトコルを公開しています。ヒメツリガネゴケのm...
運用終了
Pfam
運用機関:
EMBL-EBI
生物種:
説明:
現在最もよく整備されたタンパク質ドメインデータベースの一つで、膨大な数のタンパク質ファミリーのコレクションを保持しています。手作業で分類を行った高品質のPfam-Aと、機械的に分類を行ったPfam-B...
運用機関:
国立循環器病センター研究所
生物種:
Mus musculus | Rattus norvegicus | Sus scrofa
説明:
生体内のペプチドを液体クロマトグラフィや質量分析で網羅的に分離・同定し、それらの電荷、疎水性、分子量とともに整理しています。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Sus scrofa
説明:
ブタのゲノム (コンティグ)やcDNA、cSNP (cDNA上のSNP)の配列情報を格納したデータベースです。絞り込み検索により配列やその注釈情報 (他種の配列との類似性検索結果等)を参照できます。ま...
運用終了
PEDANT3 database: a Protein Extraction, Description and Analysis Tool
運用機関:
German Research Center for Environmental Health
生物種:
説明:
数多くの解析ツールで自動的に解析されたゲノムシーケンス情報を提供しています。このサイトには事前に計算されて得られた相同マトリクスデータベースがあり、新しくシーケンスされたゲノム情報に対しても解析をすぐ...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Escherichia coli
説明:
大腸菌ゲノムの全体像を明らかにするために、染色体上の全遺伝子について、特に実験的な機能解析に重要な情報を集積させる目的で構築したデータベースです。各遺伝子につき、名前、位置および向き、生育に必須か否か...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
タンパク質立体構造データベースPDBを、京都大学科学研究所で配列解析用に編成しなおしたデータベースです。PDBの１つのエントリーには複数のポリペプチド鎖がふくまれるので、これを別々のエントリーにし、同...
運用機関:
大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
All
説明:
日本蛋白質構造データバンク (PDBj: Protein Data Bank Japan) は、米国の構造バイオインフォマティクス研究共同体 (RCSB)、生物学的磁気共鳴データバンク (BMRB)、...
運用機関:
wwPDB consortium
生物種:
All
説明:
タンパク質と核酸の３次元構造の構造座標（立体配座）を蓄積している国際的な公共レポジトリです。
RCSB PDB （https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc0...
運用終了
ナショナルバイオリソースプロジェクト 病原微生物: National Bioresource Project - Pathogenic microbes
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Bacteria | Archaea
説明:
複数の研究機関で収集、保存されている病原微生物について、各研究機関をネットワーク化することにより、病原微生物遺伝資源の収集、保存、提供体制を構築することを目的としています。細菌/放線菌、真菌、原虫のリ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens
説明:
Johns Hopkins大学のVictor A. McKusick 博士が中心となって記述、編集を行っている、ヒトの遺伝子変異と遺伝病のデータベースです。全ての既知のメンデル型遺伝病と12,000以...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）