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運用終了

VectorDB

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00732
名称データベースの名称 VectorDB
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://genome-www.stanford.edu/vectordb//
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Stanford University
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 分子生物学分野で一般的に使用されている2,600以上のベクターの配列情報とアノテーションを収録しています。対象としているベクターの種類は、Pharge Vector、Plasmid Vector、Phagemid Vector、Phasmid Vector、Cosmid Vector、Virus Vector、YAC Vector です。 Stanford Universityによるオリジナルサイトは運用を終了しましたが、1997年の最終更新時点でのプラスミドベクターの配列データはThe Saccharomyces Genome Database (SGD, https://www.yeastgenome.org) に移行され、こちらのページ(https://www.yeastgenome.org/search?q=VectorDB&is_quick=true) からダウンロードできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Eukaryota (2759), Bacteria (2), Viruses (10239)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 運用終了
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2019-08-15
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license