レコード詳細
運用終了
SABRE: Systematic consolidation of Arabidopsis and other Botanical REsource
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00675 | ||||
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| 名称データベースの名称 | SABRE | ||||
| 別称データベースの別称 | Systematic consolidation of Arabidopsis and other Botanical REsource | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://saber.epd.brc.riken.jp/sabre/SABRE0101.cgi | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所 (J-Globalへのリンク) | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 | ||||
| 説明データベースの説明 | 植物で最も解析が進んでいるシロイヌナズナの研究成果を集めたデータベース「TAIR」の遺伝子情報を軸（串）とし、研究グループで収集・保存・提供しているシロイヌナズナ、ヒメツリガネゴケ、ポプラ、タバコ培養細胞など6種の遺伝子リソースを統合（串刺し）したデータベースシステムで、遺伝子名やキーワードを入力するだけで、すべての植物リソースの類似遺伝子やTAIRにある遺伝子情報を瞬時に得ることができます。現在公開中の植物に加えて、大豆や白菜などの作物の遺伝子情報を追加するための準備も進めており、塩害や砂漠化などに耐性のある「スーパー作物」を生み出す有益なツールとなることが期待されます。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Arabidopsis thaliana (3702), Thellungiella halophila (98038), Nicotiana tabacum (4097), Manihot esculenta (3983), Populus nigra (3691), Physcomitrella patens (3218) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 運用終了 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース |
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| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2018-09-10 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |