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（2026年2月7日土曜日20：30～21：00）
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データベースのレコード一覧 (件数: 2589)
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生物種
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その他
運用機関:
University of Sydney
生物種:
説明:
ヒト、マウス以外の動物の遺伝子疾患を収録したデータベースです。テキストによる解説、文献情報、OMIM, PubMed, Geneへのリンク情報が含まれます。手作業によるキュレートが行われています。
運用機関:
新潟大学 大学院医歯学総合研究科
生物種:
説明:
様々な生物種のオペロンの情報を文献から収集し、データベース化しました。また、既知オペロン構造から推測されるオペロン構造もデータベース化しています。さらに、オペロンに関連する遺伝子間距離、マイクロアレイ...
運用機関:
Pole BioInformatique Lyonnais
生物種:
Bacillus subtilis
説明:
枯草菌に関する情報を提供しているサイトです。シーケンス名、遺伝子アクセション番号、全文検索で検索することが可能です。SWISS-PROT, ENZYME, HOBACGENへの相互参照に加えて、遺伝子...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Triticum | Aegilops | Avena
説明:
コムギの統合データベースです。1996年にコムギ（Triticumと関連種Aegilops）の遺伝資源に関心の高い研究者らにより作成され、現在は系統情報に加えてゲノム関連情報として遺伝子記号のカタログ...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Oryza
説明:
イネ研究に関連するデータおよびリソースを収集したポータルサイトです。種に関する情報（系統、野生種、突然変異体）、遺伝子発現に関する情報（組織、発生段階との関連）、配列情報（遺伝子、オルガネラ）、マップ...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Oryzias
説明:
メダカバイオリソースに関する情報を提供しています。組織、発生段階等の情報から絞り込んで目的の資源を分与申し込みすることが可能です。また、Medaka Atlasなどの情報へのリンク、BLAST検索ツー...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Escherichia coli
説明:
大腸菌や大腸菌組み換えDNA操作ベクター、ラムダファージのコレクションの検索、分与申し込みのサービスを提供しているサイトです。各生物資源に関する情報や、資源利用した時に得られた成果発表に関する情報を提...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Chrysanthemum
説明:
広義キク属の分与、保存を目的としています。属種別の画像が掲載されており、その種類はこのサイトで定義されているAccessionNumberで管理されています。
運用機関:
独立行政法人製品評価技術基盤機構
生物種:
Archaea | Bacteria | Fungi | Cyanobacteria | Glaucocystophyceae | ...
説明:
NBRC (NITE Biological Resource Center)は、バイオ産業の発展のため、糸状菌、酵母、細菌、放線菌、微細藻類など多様な微生物資源を収集・保存し、提供しています。本サイト...
運用機関:
厚生労働省 国立感染症研究所
生物種:
Mycoplasma penetrans
説明:
マイコプラズマ (M. penetrans、M. pneumoniae) のゲノム配列、遺伝子予測結果が掲載されています。M. penetransについては、完全長ゲノム配列、アミノ酸配列、アノテーシ...
運用終了
MRCD: Microbial Resources and Chemotaxomy Database
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明:
知的基盤分類番号をIDとする微生物情報のデータベースです。オリジナル論文、旧名（もしあれば）、系統的位置、type strain、分離源、化学分類指標になる各種化学成分、基質利用性、エネルギー獲得様式...
運用機関:
九州大学 大学院
生物種:
Ipomoea nil
説明:
アサガオ突然変異系統の収集・保存・提供を行っているページです。系統リスト、画像カタログ、交配系統カタログのほか、遺伝子リストや連鎖地図など、分かりやすい解説ページとして掲載されています。アサガオの栽培...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Lotus japonicus
説明:
財団法人かずさDNA研究所は、マメ科植物では世界初となるミヤコグサ（Lotus japonicus）のゲノムの解読に成功しました。「miyakogusa.jp」では、得られた成果や情報を公開しており、...
運用機関:
東京大学 大気海洋研究所
生物種:
Gnathostomata | Hyperoartia
説明:
DDBJ、GenBank、EMBL に登録された魚類の完全長ミトコンドリア・ゲノム情報の容易な検索を可能にし、あわせて関連情報（記載論文情報、標本情報、生物情報など）を提供します。また、このデータセッ...
運用機関:
Faculty of Life Sciences (The University of Manchester)
生物種:
説明:
公開されているmicroRNAの配列について、配列から予測されるmiRNA前駆体のヘアピン構造(mirで示されます)、成熟miRNAの配列(miRで示されます)、文献情報等が登録されています。様々な検...
運用機関:
The Jackson Laboratory
生物種:
Mus musculus
説明:
マウス研究の総合サイトです。マウス遺伝子に関する情報の他、遺伝子発現データ、多型・変異情報、パスウエイ、遺伝性癌症候群モデルラットに関するデータ、マウス各系統の表現型に関する詳細な情報等を提供していま...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Archaea | Bacteria
説明:
ゲノム配列が公開されているバクテリアおよび古細菌を対象とした遺伝子の検索や各種解析ツールを提供しています。プロテアーゼによる分解シミュレーション、制限酵素による切断サイトのシミュレーションも行えます。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
文献や、生物学情報の内容を表すキーワードのデータベースです。このキーワードを利用することで関連する生物学情報を得ることができます。キーワードは階層構造をなしており、より詳細に情報をたどることも、より抽...
運用機関:
The European Molecular Biology Laboratory
生物種:
Oryzias latipes
説明:
このデータベースはメダカの遺伝子発現情報をin-situ hybridizationで確認した情報を公開しています。また、制御配列の発現データも収録しています。各データには遺伝子名、Ensembl I...
運用機関:
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種:
Archaea | Bacteria | Apicomplexa | Mycetozoa | Fungi | ...
説明:
オーソログ解析に基づいて微生物ゲノムの比較解析を行うためのデータベースです。公開されたゲノム全体を含む標準オーソログテーブルに基づいて、各オーソロググループの系統プロファイルの比較などを行えるほか、動...
運用機関:
MaizeGDB TEAM
生物種:
Zea mays
説明:
トウモロコシ研究の総合サイトです。トウモロコシゲノムの配列、変異データ、染色体上でのマッピングデータの他に、研究者の連絡先等の情報を提供しています。
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Halocynthia roretzi
説明:
ホヤ卵に存在する母性mRNAのESTと各クローンの発現パターンに関するデータを提供しています。
運用機関:
LSDプロジェクト
生物種:
説明:
ライフサイエンス分野で使用される専門用語の辞書です。英和検索、和英検索、共起検索、用例、スペルチェックなどが可能で、用語の論文アブストラクト中における用例を確認できます。
運用機関:
日本脂質生化学会 (JCBL)
生物種:
説明:
6,000以上の天然生理活性脂質（脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、ビタミン類）について、その構造、物理的・化学的特性、スペクトルデータ、代謝系、脂肪酸組成、参考文献を収集したデータベ...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
ゲノムネット内データベースとその他 500以上の外部公共データベースの間のクロスリファレンス情報を2項関係ファイルとして取り込み、あるデータベースのあるエントリについて、他のデータベース中の対応するデ...
運用機関:
宮崎大学 農学部
生物種:
Lotus japonicus | Glycine max | Rhizobium
説明:
ミヤコグサ、ダイズの2種類の情報を提供しているサイトです。分与申し込みもサイト上で受け付けており、種子、DNA、ベクターなどのバイオリソースを検索することが可能です。
運用機関:
島根大学
生物種:
Lentinula edodes
説明:
シイタケよりcDNAライブラリを構築し、その5' ESTを配列決定しました。EST番号、配列、NCBI BLASTによるホモロジー検索結果（ホモログと相同性）を表形式で掲載しています。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
「イネ完全長cDNAプロジェクト」において、日本晴イネ由来の各種組織、ストレス処理等をおこなった組織より、完全長cDNAライブラリーを構築し、機能解析を行った約28,000種類のイネ完全長cDNAの情...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGG GENES データベースをもとに、完全ゲノム配列決定されている全生物種を対象としてそのアミノ酸配列の類似性スコアがデータベース化されています。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
代謝、様々な細胞プロセス、ヒト疾患などに関する分子ネットワークの知識を表現したパスウェイマップを収録しています。マップは文献等から手作業で作成しています。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
生体機能と関連する化合物と反応に関する情報を収めたデータベースです。分子量や構造などの化合物そのものの情報の他に、化合物が関連するKEGG PATHWAYへのリンクが含まれています。KEGG COMP...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
Synechocystis sp. PCC 6803 | Bacillus subtilis | Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 | Nostoc sp. PCC 7120 | Homo sapiens
説明:
ラン藻Synechocystis PCC6803、枯草菌、大腸菌W3110 株、窒素固定ラン藻アナベナ PCC7120、その他、日本の研究コミュニティが寄与した生物種の遺伝子発現プロファイルデータのレ...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
生命システムを様々な観点から機能分類し、階層的に表現したデータベースで、文献等から手作業で作成されています。「パスウエイ・オントロジー」、「遺伝子・タンパク質」、「病気・医薬品」、「化合物・化学反応」...
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
日本人の持つ約19万7000の一塩基多型（SNPs）データにアノテーション（遺伝子情報、位置情報、アミノ酸置換情報等）を付加して公開しているデータベースです。
東京大学医科学研究所によるオリジナルサイ...
運用機関:
地方国立研究開発法人東京都健康長寿医療センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
東京都老人医療センターで収集された、老年病患者の臨床診断、病理診断、遺伝子多型データをデータベース化したものです。高齢者に特有な疾患と遺伝子多型性との関連に関する研究成果を広く役立てるために構築され、...
運用機関:
東京大学 分子細胞生物学研究所
生物種:
Drosophilidae
説明:
Jflyでは、ショウジョウバエを中心とした研究を促進する3つのサービスを提供しています。
（１）会員制メーリングリストサービス：ショウジョウバエ研究に関連する情報を交換するメールリストと、bionet...
運用機関:
Georgetown University Medical Center
生物種:
説明:
UniProtKBおよびUniParc登録タンパク質に対し、タンパクファミリー、機能、パスウェイ、相互作用、構造、構造分類、遺伝子、ゲノム、オントロジー、文献、生物種などを含む90種類以上の生物学デー...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
EBI によるタンパク質のファミリー分類、ドメイン、機能サイトに関する記述を収集した統合データベースです。UniProtやPROSITE、PANTHER、ProDom、SMARTなどタンパク質の特性を...
運用機関:
東京大学大学院 医学系研究科
生物種:
Drosophila | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
ヒト、マウス、ラット等のモデル動物のパスウェイデータベースです。シグナル伝達パスウェイや代謝を構成する複層的生体分子の関係などの高次機能情報をオントロジーを使ってデータベース化しています。文献から手作...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
Homo sapiens
説明:
このデータベースはヒト主要組織適合遺伝子複合体の配列情報とWHOの命名委員会の公式配列情報を提供しています。このデータベースはIMGT(the International ImMuno GeneTic...
運用機関:
CNRS (The National Center for Scientific Research), Montpellier University, Montpellier
生物種:
説明:
免疫グロブリン(IG)、Ｔ細胞レセプター(TR）、主要組織適合性遺伝子複合体（MHC）、免疫グロブリン超分子群、主要組織適合複合体スーパーファミリー、免疫システムに関連するタンパク質に特化した知識リソ...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
財団法人かずさDNA研究所では、巨大タンパク質をコードすることが予想される4,000塩基以上のヒト長鎖cDNAの構造情報を蓄積してきました。長鎖cDNAがコードするマルチドメイン構造を持つタンパク質が...
運用機関:
Institute of Bioinformatics
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトタンパク質に関して、タンパク質名、各種DBのAccessionNumber、HPRD_ID、GeneSymbol、染色体位置、分子分類、翻訳後修飾、局在情報、ドメイン名、モチーフ名、発現位置、タン...
運用終了
HOWDY-R: Human Organized Whole genome Database Powered by RDF
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトゲノム情報に関する公共データベースを相互に関連付け、それらを統合的に利用できるようにしたヒトゲノム情報統合データベースです。キーワードで検索すると、キーワードを含む各データベースの項目が相互に関連...
運用終了
HINTdb: Homologous Interactions Database
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Homo sapiens | Saccharomyces cerevisiae | Drosophila melanogaster | Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | ...
説明:
実験的に決定したタンパク質-タンパク質相互作用のデータベースです。配列相同性を元にグループ化されています。9生物種間で176,983件の相互作用が登録されており、このうち87,026件の相互作用にはホ...
運用終了
HGS: Human Genome Sequencing
運用機関:
独立行政法人科学技術振興機構
生物種:
説明:
高機能基盤生体データベース (ALIS) プロジェクトの配列データを提供しています。JSTと4つのシークエンシングチームが7染色体を対象としてシークエンシングを行いました。染色体マップとシークエンシン...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Hepatitis C virus | Hepatitis B virus | Hepatitis E virus
説明:
肝炎ウィルス (B型、C型、E型）の各遺伝子の核酸配列、アミノ酸配列、全遺伝子配列を対象にした系統樹、アライメント、距離行列を掲載しています。ユーザ登録が必要なアカウントモードと、フリーで閲覧できる（...
休止
HAL: Human genome Annotation Library
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトゲノムに潜む遺伝子を発見する信頼性の高いコンピュータアルゴリズムを開発し、それを利用してヒトゲノムに潜む遺伝子の位置と構造、その機能などの注釈情報を取得しました。その成果をデータベース化しています...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
H-InvDBはヒトのすべての転写産物を対象とした統合データベースです。ヒト遺伝子の構造、選択的スプライシングバリアント、機能性RNA、タンパク質としての機能、機能ドメイン、細胞内局在、代謝経路、立体...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトの遺伝子発現についての情報を提供するデータベースです。H-Invitationalプロジェクトの構築した転写産物データに対する遺伝子発現パターンを表示し,遺伝子発現パターンは複数の測定プラットフォ...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）