データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
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その他
運用機関:
Stanford University
生物種:
Candida albicans
説明:
ヒト病原体であるカンジダ菌（Candida albicans）のゲノム配列や、手作業でキュレートした遺伝子、タンパク質のアノテーション情報を提供しているデータベースです。カンジダ菌の代謝パスウエイ表示...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 和光研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
哺乳類の脳の発達に伴う時間的空間的な遺伝子発現の情報を視覚化し分析するための総合的な神経科学データベースです。遺伝子名、発現場所、発現タイミング、関連する遺伝子オントロジーの情報が、In situ h...
運用終了
Cassava Full-Length cDNA Database
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Manihot esculenta
説明:
ESTのアセンブルによって得られたキャッサバの完全長cDNAデータベースです。キーワード検索やBLAST検索が可能です。
運用終了
NCC-CIR: Cancer Image Reference Database (がん診療画像レファレンスデータベース)
運用機関:
国立研究開発法人国立がん研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
がんの診療に有用な放射線、CT、MR、内視鏡、超音波、病理画像等の各種臨床画像・診断情報を提供する医師向けデータベースです。国立がん研究センター中央病院、東病院の症例を中心に、国立がん研究センター情報...
運用終了
Caenorhabditis elegans WWW Server
運用機関:
Virginia Commonwealth University
生物種:
Caenorhabditis elegans
説明:
線虫研究に関するポータルサイト、リンク集です。最新の論文、学会情報、解析ソフトウェア、C. elegans以外の線虫を紹介するページや、主要な線虫データベース、関連サイト、各研究室へのリンク集を提供し...
運用機関:
Broad Institute of Harvard and MIT
生物種:
Homo sapiens
説明:
ブロード研究所は、マサチューセッツ工科大学（MIT）のホワイトヘッド研究所とハーバード大学のHarvard Institute of Chemistry and Cell Biology (ICCB)...
運用機関:
国立研究開発法人国立病院機構 九州がんセンター
生物種:
Homo sapiens
説明:
マンモグラフィ検診の導入や診断機器の進歩により、早期乳癌の発見率は増加してきました。一方で、境界病変や非触知病変、腫瘤非形成型病変など診断に苦慮する機会も増えています。そこで、医療関係者の方々を対象と...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
オンラインで利用できる生物医学関連の電子書籍を収録しています。テキスト中の引用文献はPubMedにリンクしています。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
エンハンサートラップ法によりカイコの新規突然変異系統を作出し、これらの系統におけるGFPレポーター発現部位情報や画像、ゲノム挿入位置情報などをまとめた新規突然変異系統データベースを構築しました。カイコ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコゲノムの遺伝地図と物理地図情報が統合されたデータベースです。 グラフィカルなビューアにより、遺伝地図と物理地図の関連やマーカ情報を参照できます。
運用終了
BioSystems
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
代謝パスウエイやシグナルパスウエイ、疾患やその他の生体内プロセスに関わる生体分子の相互作用セットを収集したデータベースです。現在は、KEGGとEcoCycデータベースのパスウエイを対象としています。各...
運用機関:
Harvard University Department of Molecular and Cellular Biology
生物種:
説明:
ハーバード大学分子細胞生物学部で公開している生物学全般に関するリンク集です。生物学の各分野や、インターネットバイオリソース、検索エンジン、データバンク、モデル生物データベースといった分類ごとに有用なリ...
運用機関:
North Dakota State University
生物種:
Phaseolus | Vigna
説明:
マメ（インゲンマメ属、ササゲ属）ゲノムデータベースへのリンク集です。※アクセス不可のページが多数みられます。
運用機関:
Beta Cell Biology Consortium
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
Beta Cell Biology Consortiumは、膵臓ランゲルハンス島の発生と機能に関する理解を進展させる学際的アプローチの促進を目的としています。長期的な目標として、インスリン・デリバリー...
運用機関:
東北大学, 東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種:
Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Glycine max | Zea mays | Solanum lycopersicum | ...
説明:
ATTED-IIは、シロイヌナズナを中心とした植物の遺伝子共発現データを提供するデータベースです。AtGenExpress (TAIR)、ArrayExpressからのマイクロアレイデータと、DDBJ...
運用機関:
筑波大学大学院 生命環境科学研究科
生物種:
Dictyostelium discoideum AX2
説明:
細胞性粘菌 Dictyostelium discoideum AX2 株 cDNAクローンについて、Whole-mount in situ hybridizationに基づく空間的遺伝子発現情報（画像...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
理化学研究所植物科学研究センターがMaxPlank研究所などと協力して、植物において初めて大規模なトランスクリプトームデータ（Affymetrixチップ1000枚以上）を収集して公開した「AtGenE...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans | Oryza sativa | ...
説明:
ASTRAは、ヒト、マウス、ハエ、線虫、シロイヌナズナ、イネについて、選択的スプライシングと選択的転写開始のパターンを収集したデータベースです。独自のアルゴリズムを用いて、ゲノム塩基配列とcDNA配列...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
二つのマウス細胞株（メラノサイト、メラノーマ）由来の完全長cDNA ライブラリから選択的スプライシングライブラリ(Alternative Splicing Library: ASL)を構築し、そこから...
運用機関:
独立行政法人酒類総合研究所
生物種:
Aspergillus oryzae RIB40
説明:
麹菌Aspergillus oryzae のゲノム配列データベースです。Aspergillus oryzaeのゲノム配列決定には、酒類総合研究所のRIB40株が使われました。ゲノムの遺伝子アノテーショ...
運用機関:
長浜バイオ大学
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
遺伝子機能の多様化に重要な役割を果たす現象と考えられている選択的スプライシングが、タンパク質の立体構造や機能にどのような影響を与え得るかについてコンピュータにより解析した結果をまとめたデータベースです...
運用機関:
University of California, Santa Cruz
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
真核ゲノムのスプライシングパターンや制御を理解するために、酵母ORFのイントロン情報やスプライシング因子破壊株のマイクロアレイデータを蓄積しています。各エントリーには、ORF名、イントロンの数と配列、...
運用機関:
Helmholtz Zentrum Munchen
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
ドイツのシロイヌナズナゲノム解析グループのホームページです。クローンやコンティグ、遺伝子情報を公開しています。データベースMatDBでは、シロイヌナズナゲノムデータベースであるMIPS、TIGR、TA...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
かずさDNA研究所で決定したシロイヌナズナのEST配列と、非冗長タンパク配列データベースとの間で行ったblastx検索の結果が収録されています。
運用終了
AQUA DNABook
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
ヒラメの遺伝地図作成に用いたマイクロサテライトマーカーと魚病診断に用いるプライマーをスポットしたDNAブックです。コイヘルペスなど病原体17種類のDNA断片と、ヒラメやマダイなどの耐病性の判定に利用で...
運用機関:
Institut national de la recherche agronomique
生物種:
Acyrthosiphon
説明:
アブラムシゲノム解析コンソーシアムによる成果として、エンドウヒゲナガアブラムシのドラフト配列とアノテーションを公開しています。各種プログラムによる自動的な遺伝子予測結果に加え、着目した2000以上の遺...
運用機関:
Lady Davis Institute for Medical Research
生物種:
Homo sapiens
説明:
アンドロゲン(男性ホルモン)受容体変異データベースです。PDFファイルによる一覧と、FileMakerPro用データベースファイルのダウンロードによりデータが得られます。
運用機関:
University of Texas Southwestern Medical Center
生物種:
説明:
CASP8に参加したグループの予測構造と、その評価を納めたデータベースです。各グループの予測構造はPyMOLを用いて表示することができます。
運用機関:
Poznan Supercomputing and Networking Center
生物種:
説明:
既知のすべてのアミノアシル-tRNA合成酵素のアミノ酸配列を集積しているデータベースです。対応するアミノ酸や生物種により分類されています。X線回折やNMRで解析した三次元構造も掲載されています。アミノ...
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
文献中に多く出現する略語は多義語であることが多く、特に専門外の読者には理解するのに困難を伴うことがあります。Allieはこの問題に対する一つの解となるよう開発されており、米国国立保健図書館(Natio...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Chlorophyta
説明:
藻類に関する株情報の検索、寄託情報、遺伝子情報、藻類の画像、文献情報を検索することができます。その他、株の分譲に関する情報も得ることができます。
運用機関:
Addgene
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Danio rerio | Drosophila melanogaster | ...
説明:
Addgeneは、研究者にプラスミドを分配する非営利組織です。数百の研究室と共同で、論文発表で用いた高品質なプラスミドのライブラリを収集し、プラスミドレポジトリを構築しています。プラスミドと文献をリン...
運用機関:
Universite Libre de Bruxelles
生物種:
Eukaryota | Bacteria | Viruses
説明:
ファージゲノムやプラスミド、トランスポゾンを含む、原核生物の全ての既知の可動性遺伝因子(Mobile Genetic Elements; MGEs)の収集とクラス分けを行ったデータベースです。ゲノムや...
運用機関:
法政大学
生物種:
Eukaryota | Bacteria | Viruses
説明:
ネット上に存在する生物多様性関連のWebサイト454件のリンク集です。各生物種ごと、あるいは標本ごとにWebページが存在し、各々について種の特徴が判別できる精細な画像と、その撮影場所、年月日、和名、学...
運用機関:
University of Leicester Department of Genetics
生物種:
Homo sapiens
説明:
骨形成不全症とエーラー・ダンロス症候群を引き起こすと報告されている全ての遺伝子の変異情報を収録することを目的としています。骨形成不全症では、COL1A1, COL1A2, CRTAP, FKBP10,...
運用機関:
Department of Computational Biology, Adam Mickiewicz University
生物種:
Eukaryota | Bacteria | Archaea
説明:
古細菌、真正細菌、真核生物の5S rRNAの塩基配列を提供しているデータベースです。二次構造や三次構造、修飾分子の情報も掲載されています。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
説明:
天然分子の三次元構造、物性値を閲覧することができます。細胞内での分子認識においては三次元構造が重要であり、特に農業分野で利用できる（農薬の設計、食品の成分分析等）天然物を中心に構成されています。簡易な...
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
説明:
木材標本庫所蔵の顕微鏡像、表面観、さく葉標本像、採集時の画像、種名、採集情報を掲載しています。
運用機関:
文科省科研費ゲノム4領域特定領域「ゲノム」
生物種:
説明:
文部科学省は、5年単位プロジェクトの4代目として、2005年4月に「特定領域研究ゲノム」をスタートさせました。このプロジェクトの研究成果情報を、カテゴリ、期間、領域、受付番号、氏名、キーワードで検索す...
運用終了
Database for Genetic Engineering of Microalgae (微細藻類遺伝子工学データベース)
運用機関:
独立行政法人産業技術総合研究所
生物種:
Anabaena sp. | Anabaena sp. PCC 7118 | Anabaena sp. PCC 7120 | Chlamydomonas reinhardtii | Chlorella sorokiniana | ...
説明:
微細藻類の遺伝子組換えの実用化へ向けて役立つ技術を集めたもので、相互に利用を図ることを目指しています。現在は手持ちのラン藻のホストーベクター系を中心に、ベクターの構造、塩基配列、文献などの情報が収めら...
運用機関:
千葉大学 大学院薬学研究科
生物種:
説明:
故萩庭丈壽千葉大学名誉教授が主に日本全国で採集し作製した約５万点に及ぶ自生顕花植物のさく葉標本群のデータベースです。植物和名、学名、科名、採集地、採集年月日などの情報や、標本写真のデジタル画像を収録し...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立極地研究所
生物種:
Bryophyta
説明:
昭和基地周辺の蘚苔類の生態、分布を掲載しています。
運用機関:
北海道大学 総合博物館
生物種:
Lepidoptera
説明:
苫小牧研究林所蔵の標本情報のデータベースです。Lepidoptera （ 鱗翅目(チョウ目)）の標本情報を写真とともに収録しています。
運用機関:
帝京科学大学 生命環境学部 アニマルサイエンス学科
生物種:
説明:
動物行動の映像データベース。動物の行動や種類別に映像を分類しています。
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
説明:
このデータベースは、森林病害虫獣を含め、日本の森林に関係する種の個々の生態等について簡単な説明と写真を掲載したものです。現在、菌類及び樹木病原性生物28件、昆虫・小動物類116種、鳥獣類14種、昆虫病...
運用終了
佐賀大学電子図書館 植物遺伝資源検索
運用機関:
佐賀大学
生物種:
Rutaceae
説明:
佐賀大学が所有する、柑橘及びミカン亜科植物の形態、分布、特徴及び画像を収録したデータベース。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立極地研究所
生物種:
説明:
国立極地研究所が収蔵している全動物標本（約2500点）を掲載しています。極域に生息する生物の理解を少しでも深めるため、標本を撮影し、分類群などで検索できるデータベースとして公開されました。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Sus scrofa domestica | Gallus gallus
説明:
家畜ゲノム解析研究プログラム（略称：ＡＧＰ）で開発されたブタのマイクロサテライトマーカー等のＤＮＡマーカー、ブタ連鎖地図（ToNMaP）等についての情報を提供しています。
運用機関:
宮崎大学 フロンティア科学実験総合センター
生物種:
Mus musculus | Mus caroli
説明:
国立遺伝学研究所、浜松医科大学、宮崎大学、埼玉県がんセンター研究所等で維持しているマウス系統の画像、および国立遺伝学研究所系統生物研究センター哺乳動物遺伝研究室が所蔵している中国産野生ハツカネズミの標...
運用機関:
財団法人蛋白質研究奨励会
生物種:
説明:
国内のペプチドを主題として扱った論文のタイトル、雑誌名、独自の抄録を収録した文献データベース。内容に応じて10種の分野に文献を分別し、セクションコードが与えられています。
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統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）