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ConfC (アーカイブ): Database of conformation changes in protein structures

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00400
名称データベースの名称 ConfC (アーカイブ)
別称データベースの別称 Database of conformation changes in protein structures
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/confc/desc.html
運用機関名現在データベースを運用している機関名 国立研究開発法人産業技術総合研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 タンパク質立体構造と機能の関係を動的に扱った研究は、実験的には数多く存在しますが、一般的なドラッグデザインではいまだにタンパク質を静的に扱っています。タンパク質の動的情報を得るには、実験もしくは分子動力学計算を行う必要がありますが、どちらも全てのタンパク質を網羅するには非常に膨大な時間と労力を必要とします。本データベースは、現在得られているタンパク質の立体構造からこの動的情報を抽出し、1)進化的構造変化、2)結合による構造変化、3)構造的揺らぎの3種類に分類しました。 産業技術総合研究所によるオリジナルサイト(http ://mbs.cbrc.jp/ConfC/)の運用は終了しました。ConfCのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブからご利用いただけます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/confc/download.html
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/confc/LATEST/README.html
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/confc/lic.html
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/confc/desc.html
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク http://medals.jp/list/detail/47.html
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-01-13
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license