データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
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生物種
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その他
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエの転写開始点に関して世界最大の情報量を提供するゲノムブラウザです。ショウジョウバエの７つの組織（胚、幼虫、老/若x雄/雌, S2（培養細胞株））から収集した約2500万個の5'-end...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Oryzias latipes
説明:
MEBase (メダカのESTデータベース)、MLBase (メダカの連鎖地図データベース)、MBBase (メダカの人工染色体データベース)の3種類からなっています。また、メダカに関する外部リンクも...
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
文部科学省「統合データベースプロジェクト」のポータルサイトです。生命科学分野のデータベースカタログや横断検索、総説や特許、研究報告書の文献検索、各種ツール、バイオNLP、教材、事業説明などを提供してい...
運用終了
Lowe Syndrome Mutation Database
運用機関:
National Human Genome Research Institute, National Institute of Health
生物種:
Homo sapiens
説明:
先天性白内障、精神発達遅滞、尿細管性アシドーシスを主な症状とするLowe症候群を引き起こす原因となっているOCRL1遺伝子の変異に関するデータベースです。
このサイトは運用を終了し、データはNDBI ...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Lotus japonicus
説明:
かずさDNA研究所で決定したミヤコグサのEST配列と、非冗長タンパク配列データベースとの間で行ったblastx検索の結果が収録されています。
運用機関:
大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
説明:
低分子化合物の３次元分子構造と原子荷電を提供するデータベースです。分子シュミレーションシステムmyPrestoの一部として開発され、KEGGや企業から提供された2次元の化合物データを元に、計算により3...
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
All
説明:
生命科学系データベースアーカイブは、国内のライフサイエンス研究者が生み出したデータセットをわが国の公共財としてまとめて長期間安定に維持保管しています。データ説明（メタデータ）を統一して検索を容易にする...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
PubMedに登録されている文献に記載されているヒト遺伝子/タンパク質名、遺伝子機能名、疾患名、化合物名のうち、2つの用語が共起した文献を検索するシステムです。遺伝子2つのように同じタイプについても検...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information, Computer Retrieval of Information on Scientific Projects, United States Patent and Trademark Office
生物種:
説明:
Labome.Orgは研究助成金、論文、特許、研究テーマに関連したWebページに関する情報を掲載しており、ゲノムや遺伝子、科学者や生物種を簡単に検索閲覧できるページです。
運用機関:
University of Wurzburg
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
L1Baseはヒトやげっ歯類ゲノムに存在する有効と思われるL1 Insertion専門のデータベースです。２つのORFが欠損していないL1 Element配列全長、そして、欠損していないORF2と欠損...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト蛋白質発現クローン（Flexi ORF clones）データベースです。ORF配列やアミノ酸配列、InterProScanの結果、transmembrane regionの予測結果、OMIM da...
運用機関:
奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
Embryophyta
説明:
生物種と代謝産物の関係を体系化することを目的に、二次代謝産物データベースシステムKNApSAcKを開発し、無償で公開しています。KNApSAcKは分子式、分子量、生物種名や実験によって得られたマススペ...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、Waardenburg症候群、QT延長症候群に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、筋ジストロフィーに関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示が...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、心筋症に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示ができます。
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、網膜色素変性症、緑内障、内障に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、聴覚障害に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示ができます...
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト疾患に関連する遺伝子変異をOMIM、GDB、文献より収集し、人体・臓器の模式図上への疾患遺伝子/発症疾患名のマッピング表示や、染色体上への疾患遺伝子のマッピング表示を行っています。変異による遺伝子...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、乳ガン、網膜芽細胞腫、神経線維腫症に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、パーキンソン病、アルツハイマー病に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、血液関連疾患に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示ができ...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
MutationViewのサブデータベースで、自己免疫関連疾患に関するデータを掲載しています。染色体イディオグラム上での疾患遺伝子の検索と一覧表示、身体・臓器の模式図上での遺伝子/疾患名の検索、表示が...
運用機関:
University of Missouri Bioinformatics Consortium
生物種:
説明:
Klothoは生物化学で始まる生物学的プロセスをモデル化しようとする試みです。このデータベースでは分子構造を検索することができます。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
文献で報告されている糖鎖構造と関連するパスウェイを収集したデータベースです。KEGG Pathwayとのリンクにより、糖鎖の生合成および分解反応や関連酵素の情報も得られます。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGG GENESは、全ゲノム配列が決定された生物種について、その遺伝子セットをRefSeq その他の公共データベースから自動生成し、KEGG 独自のアノテーション（KO アノテーション）を行ってい...
運用機関:
東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター
生物種:
説明:
KEGGに含まれる全生物のゲノムマップ情報に対して、DAS（Distributed Annotation System）サービスを提供する高度ゲノムデータベースシステムです。GBrowse GUIを用...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGGデータベースシステム全体の統括ページです。データタイプごと（PATHWAY、BRITE、DISEASE、DRUG、GENES、GENOME、COMPOUND、GLYCAN、REACTION）、...
運用機関:
京都大学 大学院生命科学研究科
生物種:
Chlamydomonas reinhardtii
説明:
緑藻クラミドモナスのゲノムデータベースです。データベースの閲覧には、データベース運用者とコンタクトを取ることが必要です。クラミドモナスは、最初に葉緑体DNAが発見された生物で、葉緑体、ミトコンドリアと...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Cyanobacteria | Embryophyta
説明:
KazusaMartはかずさDNA研究所が提供するゲノムスケールの遺伝子情報管理システムです。植物および関連微生物を対象としており、現在シアノバクテリア34生物種が公開されています。システムはBioM...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナのゲノム情報を様々な公共データベースから取得することができます。遺伝子とタンパク質、遺伝子ファミリー、遺伝子オントロジー（GO）ターム、Massively Parallel Signat...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコの塩基配列、アミノ酸配列の相同性検索(BLAST)を行うためのシステムです。お手持ちの配列とカイコ関連配列との相同性検索を行えます。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコゲノムの遺伝地図と物理地図情報が統合されたデータベースです。複数のビューアが存在し、マーカ・遺伝子・形質等のゲノム位置や注釈(アノテーション)情報をグラフィカルに参照できます。またお手持ちの配列...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコの2次元電気泳動（プロテオーム）情報を格納したデータベースです。組織・発生段階毎のスポット情報をキーワード検索や画像選択により参照できます。
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Solanum lycopersicum
説明:
矮性トマト品種マイクロトムの完全長cDNAに由来するESTおよび完全長配列のデータベースです。
運用機関:
Fritz Lipmann Institute - Leibniz Institute for Age Research
生物種:
説明:
生体高分子の立体構造情報を収録しているデータベースです。Protein Data Bank (PDB) とNucleic Acid Database (NDB)を情報源としています。対象分子はタンパク...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
説明:
産総研の糖鎖遺伝子機能解析チーム、糖鎖分子情報解析チーム、レクチン応用開発チームが保有する６種類のデータベース（GMDB、LfDB、レクチンと糖鎖の相互作用プロファイリングDB、GGDB:糖鎖関連遺伝...
運用機関:
宮城教育大学
生物種:
Formicidae
説明:
本データベースは、アリ類分類に関する最新の知識を主として学術研究および教育普及に役立てるために、アリ類データベース作成グループにより編纂された高品質画像を中心としたデータベースで、インターネットおよび...
運用機関:
日本心臓血管外科手術データベース機構
生物種:
Homo sapiens
説明:
心臓血管外科手術を受ける成人患者の術前後の医学的身体状況と手術内容・結果を掲載したデータベースです。米国胸部外科学会データベース（STS National Database）とほぼ同等の記入項目を収集...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立情報学研究所
生物種:
説明:
ジャビオンは日本語で最新の生物学や生命科学をわかりやすく解説した総合情報サイトです。コラム、注目ニュース、用語解説、研究最前線に関する情報に加え、GenomeViewer、データベースビューア、文献検...
運用機関:
J. Craig Venter Institute
生物種:
説明:
J. Craig Venter Instituteのホームページです。4つの研究グループについての研究内容、スタッフの情報が記載されています。以下のデータベースの情報、リンクがあります。
・Cas...
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構
生物種:
説明:
J-GLOBALは、「つながる、ひろがる、ひらめく」をコンセプトに、これまで個別に存在していた科学技術情報をつなぎ、発想を支援するサービスです。
登載された情報間のつながりをもとに、JST内外の良質な...
運用機関:
University of London
生物種:
説明:
IUBMB、IUPACの命名規則に関する情報を提供しています。文書全体をWeb上で閲覧できるように変換しており、見やすいように修正を加えています。
運用機関:
Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaire
生物種:
Bacteria | Archaea
説明:
古細菌や真正細菌から単離された転位因子配列情報を提供しています。名前、長さ、起源、ファミリー名などで検索することが可能で、BLAST検索も使用することができます。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens
説明:
国際 HapMap 計画は、ヒトにおける遺伝的多型パターンを明らかにし、病気や薬に対する反応性に関わる遺伝子を発見するための基盤を整備するプロジェクトです。この計画は、カナダ、中国、日本、ナイジェリア...
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
IntEnzは酵素命名規則にフォーカスした自由に使用可能な情報源です。IntEnzにはIUBMBの命名規則委員会の提言が含まれています。
運用機関:
European Bioinformatics Institute
生物種:
説明:
IntActはオープンソースの分子間相互作用のデータベースとツールキットで構成されています。データは文献から取得したり、専門家によって蓄積されたデータから構成されています。
運用機関:
東京大学 大学院情報理工学系研究科
生物種:
説明:
PubMedに収録された文献情報（アブストラクト）からキーワードの共起やその関係性を機械的に抽出することによって得られたタンパク質間相互作用、遺伝子と疾病関連性を検索することができます。画面の操作性が...
運用機関:
New England Biolabs Inc.
生物種:
説明:
インテイン（タンパク質分子の一部分で、自動的に切除され、残った部分（エクステイン）がペプチド結合で再結合される（「タンパク質スプライシング」）ようなもの）に関する公開・非公開の情報をまとめたものです。...
運用機関:
The Jackson Laboratory, Medical Research Council
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスの種類や提供情報をまとめたデータベースです。系統名や系統種、試料の形態、遺伝子名や変異の種類、染色体番号、その他、マウス試料の提供元の場所で検索することが可能です。
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）