レコード詳細
休止
Comparasite: Full-length cDNA Database
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00398 | ||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | Comparasite | ||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | Full-length cDNA Database | ||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://comparasite.hgc.jp/ | ||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 東京大学 医科学研究所 (J-Globalへのリンク) | ||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 | ||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 7種類の寄生原虫（熱帯熱マラリア原虫、三日熱マラリア原虫、ネズミマラリア原虫2種、トキソプラズマ原虫、クリプトスポリジウム原虫、エキノコックス条虫）から全長cDNAライブラリを作成し、比較生物学的研究に利用するための比較ゲノムデータベースを作成しました。相同遺伝子群のクラスター化や、モチーフ、細胞膜貫通領域などの比較解析結果が含まれています。 | ||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Plasmodium falciparum (5833), Plasmodium yoelii (5861), Plasmodium vivax (5855), Plasmodium berghei (5821), Toxoplasma gondii (5811), Cryptosporidium parvum (5807), Echinococcus multilocularis (6211) | ||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 | ||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | http://comparasite.hgc.jp/ | ||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2012-10-01 | ||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |