レコード詳細
RefSeq: Reference Sequence
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00187 | ||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | RefSeq | ||||||||||||
| 別称データベースの別称 | Reference Sequence | ||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/ | ||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | National Center for Biotechnology Information | ||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 | ||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 異なる生物種由来の冗長性を排除したDNA, RNA, タンパク配列を収録したデータベースです。プラスミド、オルガネラ、ウイルス、古細菌、真正細菌、真核生物のアノテーション付けされた配列が含まれています。生物種ごとに、標準となる配列の包括的データセットを提供することを目的としています。配列の情報源はGenBank由来ですが、それらの中から情報を統合して標準となる配列を提供しています。 | ||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Eukaryota (2759), Bacteria (2), Archaea (2157), Avsunviroidae (185752), Pospiviroidae (185751), unclassified viroids (265963), Viruses (10239) | ||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/, ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/refseq/ | ||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/, ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/refseq/ | ||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/policies.shtml | ||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=RefSeq | ||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/biodbcore-000457 | ||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-09-15 | ||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |