レコード詳細
SCOP2: Structural Classification of Proteins 2
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00200 | ||||||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | SCOP2 | ||||||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | Structural Classification of Proteins 2 | ||||||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://scop2.mrc-lmb.cam.ac.uk | ||||||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | The Medical Research Council (MRC) Laboratory of Molecular Biology | ||||||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | イギリス | ||||||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | PBDに登録されたタンパク質を構造と進化に着目して分類したデータベースです。分類されたタンパク質は類縁関係による単純な階層構造ではなく、タイプ（形状）、構造、進化、その他の4つのカテゴリーに定義された類縁関係ネットワークのノードとして扱われます。各データでは類縁関係ネットワークと代表的なタンパク質構造の領域や配列が表示されます。キーワード検索やグラフィカルなインターフェースによる類縁ネットワークからの検索が可能です． | ||||||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | ― | ||||||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | http://scop2.mrc-lmb.cam.ac.uk/download.html | ||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | http://scop2.mrc-lmb.cam.ac.uk/download.html | ||||||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/biodbcore-000423 | ||||||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2016-08-08 | ||||||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |