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SHIGEN: Shared Information of GENetic Resources

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00322
名称データベースの名称 SHIGEN
別称データベースの別称 Shared Information of GENetic Resources
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://www.shigen.nig.ac.jp/indexja.htm
運用機関名現在データベースを運用している機関名 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 遺伝資源情報の提供者と利用者が一緒に作り上げる情報アーカイブ。SHIGENプロジェクトは 実験研究に必要な遺伝資源材料の情報公開サイトを網羅的に調べて提供する(WGR) 国内の利用可能な資源に関しては、関連する様々な情報を含めた統合データベースを構築して利用者の便宜を図る 日本の生物遺伝資源委員会の活動に関する最新の情報を提供する (GRC) 国内の遺伝資源に関するデータベース構築を支援する(Databases) などを目的として、国立遺伝学研究所・生物遺伝資源情報センター(三島市)で推進しています。ここでいう「遺伝資源」とは、遺伝物質を含み、増殖、保存、分譲が可能な実験材料(生物個体、 組織、細胞、DNA、笂など)をさします。本センターは国内の遺伝資源情報の中心を担うべく、1998年に設立されました。また2002年7月に発足したナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)における情報中核機関としても機能しています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=SHIGEN
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-01-24
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license