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AOE: All Of gene Expression

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00467
名称データベースの名称 AOE
別称データベースの別称 All Of gene Expression
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://aoe.dbcls.jp/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 EBI ArrayExpress に登録されている遺伝子発現データを容易に検索、閲覧するためのインターフェースです。ArrayExpress のメタデータから集計した統計値をインタラクティブなグラフにまとめてあり、生物種別、手法別の登録件数が一覧できます。また、生物種、手法、登録年によるデータリストの絞り込みが可能です。各データは EBI ArrayExpress にリンクしています。 NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) の登録データを容易に利用するためのインターフェースであった「GEO目次」の後継サイトです。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31978081
DOI:10.1371/journal.pone.0227076
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/aoe/download.html
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/aoe/LATEST/README.html
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/aoe/lic.html
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/aoe/desc.html
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=AOE
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-01-16
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license