データベースのレコード一覧 (件数: 2607)
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生物種
カテゴリ
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地域
その他
運用機関:
熊本大学
生物種:
説明:
サイトカインシグナル経路に関するデータベースです。
運用機関:
徳島大学
生物種:
Gallus gallus
説明:
ニワトリの眼の発生に着目したESTおよび発現のデータベースです。
運用機関:
地方国立研究開発法人大阪府立病院機構 大阪府立成人病センター研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスの脳に発現する遺伝子のデータベースです。
運用機関:
地方国立研究開発法人大阪府立病院機構 大阪府立成人病センター研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
大正製薬機能ゲノミクス研究所で集められた3'末端ESTコレクションに基づいて作成されたデータベースです。 公共データベースのID番号や単語で検索が可能です。また、遺伝子とライブラリの発現プロファイルが...
運用機関:
国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
細胞内局在性シグナルを基にした、ヒトのタンパク質アイソフォームのパターン分類、相関関係のデータを公開しています。
運用機関:
調査中
生物種:
説明:
微生物に関する主要なデータベースを横断的に検索することができるシステムです。
運用機関:
首都大学東京
生物種:
Embryophyta
説明:
牧野標本館が所蔵している、シーボルトが収集した植物標本を主とするコレクション（シーボルトコレクション）の2325点について、文字情報（学名、和名、科名、採集地、採集年月日、採集者、原記載など）と標本画...
運用機関:
弘前大学大学院 理工学研究科
生物種:
説明:
収集した膜貫通トポロジーに関する文献 (1074論文) から、X線結晶構造回折、NMR、遺伝子融合などの実験によって決定された、信頼度の高い302の膜貫通トポロジーモデルを抽出し、それらをSWISS-...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
タンパク質-リガンド相互作用の情報を文献より収集したデータベースです。 リガンド（名称、分子構造、分子量など）、タンパク質（名称、生物種、PIR/SWISS-PROT/PDBにおけるIDなど）、実験情...
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
説明:
Kinase Pathway Database の進化版で、相互作用の種類が分類され、evidenceの信頼度も分類されています。
運用機関:
University of California San Diego
生物種:
Homo sapiens | Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエの遺伝子と相同な配列を持つヒトの疾病遺伝子のデータベースです。疾患名、遺伝子名、OMIM番号、タイトルなどのキーワードでデータを検索することが可能です。
運用終了
BodyMap-Xs: anatomical and taxonomical breakdown of animal EST
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
説明:
臓器と遺伝子のオーソログ関係を前提に生物間で遺伝子発現パタンの比較ができます。 最新のdbEST(DDBJのESTdivision)の材料記載を解剖名称自動分類機 （自前） を用いて臓器別に分類合算し...
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Mus musculus | Homo sapiens
説明:
ヒト、マウスの遺伝子発現を組織、細胞の種類ごとに解析した結果のデータベースです。 遺伝子発現は3' ESTをベースに解析されています。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
説明:
古代 DNA に関する論文の内容を表示・分類しています。
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
Homo sapiens | Rattus | Mus musculus | Danio rerio | Drosophila | ...
説明:
9生物種(ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、線虫、出芽酵母、分裂酵母、枯草菌)を対象に遺伝子名、 遺伝子ファミリ名を集め並列関係【同義】および上下関係【ファミリ名】で関係付けま...
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
施設名称や研究室名称と、それらの各表記の対応辞書です。
ライフサイエンス統合データベースセンターによるオリジナルサイト（http://lifesciencedb.jp/MEXT_H18/ii-7d71...
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
説明:
日本国内の主要プロジェクトに関する情報（体制、予算、概要、データベースサイト、ダウンロードサイト、報告書や文献へのリンク情報等）を収集したカタログ型のデータベースです。
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
説明:
生命科学系学協会の情報(URL・名称・連絡先・会員数・学会誌)を分類別に閲覧検索できるカタログ型のデータベースです。
オリジナルサイト http ://biosciencedbc.jp/adcatal...
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部
生物種:
説明:
生命科学系データベースの情報 （URL・稼働状況・提供機関・生物種・データ種）を対象や生物種などの項目別に閲覧検索できるカタログ型のデータベースです。2013年7月29日をもってバイオサイエンスデータ...
運用機関:
高知大学 理学部
生物種:
Ciona intestinalis
説明:
カタユウレイボヤ胚におけるレチノイン酸標的遺伝子候補のマイクロアレイによる発現解析とWhole mount in situ hybridizationによる画像のデータベースです。
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
マウス（C57BL/6N系統）のBACライブラリーを構成するクローンの末端配列情報のデータベースです。
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 食品総合研究所
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
パン酵母のポストゲノム解析による遺伝子発現・遺伝子機能データベースです。DNA マイクロアレイを用いた網羅的遺伝子発現解析（トランスクリプトミクス）や酵母遺伝子破壊株セットを用いた網羅的表現型解析（フ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコcDNAの塩基配列データベースです。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコゲノム研究プログラムのホームページです。物理地図情報、遺伝地図情報、EST (Expressed Sequence Tag)情報、およびゲノム配列情報のすべてを統合した統合データベースKAIKO...
運用終了
Koshihikari vs Nipponbare SNP Database
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
コシヒカリと日本晴のSNP比較データベースです。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネの遺伝子発現情報データベースです。
運用終了
NIAS Oryza SNP Database
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
NIAS栽培イネコアコレクションと在来品種の多型情報データベースです。
運用終了
Genome Methylation Database
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa | Arabidopsis thaliana
説明:
RLGS法によるイネ・シロイヌナズナゲノムのメチル化状況をまとめたデータベースです。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネの発芽から開花までの生育画像を数分から数時間間隔で継続的に取得できる システムによる、表現型の網羅的解析結果のデータベースです。
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構によるオリジナルサ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネゲノムリソースセンターのホームページです。イネ完全長cDNAクローン配布に関する情報と、イネ突然変異系統であるTos17突然変異系統のデータヘのリンク、研究材料の申し込み方法を記載しています。
運用機関:
International Mouse Phenotype Consortium
生物種:
Mus musculus
説明:
国際マウス表現型解析コンソーシアム（IMPC）によるノックアウトマウスの網羅的表現型データを収集したデータベースです。国際マウスコンソーシアム （IKMC） により整備されたC57BL/6マウス由来の...
運用機関:
Washington State University
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
酵母のヒストン修飾やその他の染色体の特徴パターンをマッピングしたゲノムワイドChIPマイクロアレイデータを収集しています。遺伝子名とプロモーター領域あるいはORFを選択すると、その領域での22種類のヒ...
運用機関:
University of Michigan
生物種:
Homo sapiens
説明:
核磁気共鳴画像法(MRI)で撮影されたヒト胚の立体画像のデータベースです（アメリカ国立小児保健発育研究所(NICHD)資金提供）。ヒト胚画像コレクションはヒト発生研究に興味を持つ学生や研究者、臨床医、...
運用機関:
University of California
生物種:
Eukaryota | Archaea | Bacteria
説明:
ゲノム全塩基配列が決定された生物種について、tRNAscan-SEプログラム(Lowe & Eddy, 1997)によって予測されたtRNA遺伝子を収集しています。全てのアノテーションは自動的に付与さ...
運用機関:
Toxicology Excellence for Risk Assessment
生物種:
説明:
世界の信頼ある研究グループから寄せられた600以上の化学物質の人体に及ぼすリスク情報を収載しています。
運用機関:
U.S. Environmental Protection Agency
生物種:
説明:
500以上の化学物質のリスクアセスメントに役立つ情報が提供されています。データレコードは発ガン性のアセスメント (暴露度に関するリスクの推測) とレファレンスコード (有害物質への暴露、または人体に健...
運用終了
TOXNET: Toxicology Data Network
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
毒性、有害危険化学物質、環境衛生、毒性排出に関するデータベース群を集めた毒性情報総合サイトです。
化合物名、病名、環境衛生に関するキーワードを入力すると、TOXNET上の全データベースを横断検索できま...
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
母乳育児中の母親が曝露するかも知れない薬や化学物質のデータベースで、母乳や乳幼児血液中のレベルと可能性のある副作用のほかに、代用可能な治療薬に関する情報を提供しています。すべてのデータには科学的根拠と...
運用機関:
National Institute on Aging
生物種:
説明:
生物学的パスウエイ、高分子構造、遺伝子ファミリー、細胞間相互作用に関する画像を収集したデータベースです。遺伝子名、パスウエイ名、細胞や組織、病名、生物学的機能名をキーワードとして検索できます。 cDN...
運用終了
GAD: Genetic Association Database
運用機関:
National Institutes of Health
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト疾患の遺伝的関連研究データを管理するデータベースです。候補遺伝子解析やゲノムワイド関連解析(GWAS)に関する査読文献から抽出した要約データも含まれます。各エントリーは遺伝子名、染色体番号、文献名...
運用機関:
National Institutes of Health
生物種:
説明:
NIHヘルスインフォメーションは、読者に健康に関するより良い知識と理解を助け、病気を防ぐ手段とし、家族や身近な人が罹る病気の理解を深めることを目的としています。これらの記事は専門家によって精査され、正...
運用機関:
National Institute of Allergy and Infectious Diseases
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Sus scrofa | Canis lupus familiaris | ...
説明:
IEDBでは、実験で明らかにされたT細胞およびB細胞エピトープ（抗原決定基）のカタログや、主要組織適合性複合体(MHC)結合アッセイ、MHCリガンド溶出アッセイのデータ等を提供しています。エントリーに...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Human immunodeficiency virus 1
説明:
HIV-1タンパクと宿主細胞タンパクとの相互作用の知見を収集することは、HIV-1の複製や発症のプロセスを理解するのに重要であり、また安全かつ効率的なAIDSの治療法や予防戦略の開発に必須となります。...
運用機関:
National Cancer Institute
生物種:
Homo sapiens
説明:
NIHのDivision of Cancer Epidemiology and Genetics (DCEG) で行われている、がんの遺伝的、環境的決定因子とがん予防に関する研究のサイトです。前立腺が...
運用機関:
National Cancer Institute
生物種:
Homo sapiens
説明:
がんに関連するゲノム研究のデータセットを検索、ダウンロード、アップデート、分析するためのポータルサイトです。TCGA （The Cancer Genome Atlas: https://cancerg...
運用終了
Pathway Interaction Database
運用機関:
National Cancer Institute
生物種:
Homo sapiens
説明:
National Cancer Institute (NCI)とNature Publishing Group (NPG)の共同プロジェクト。NCIとNPGでキュレートした信頼性の高い113ヒトパスウ...
運用機関:
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
がんゲノム大型共同プロジェクトにおける遺伝子選択および優先付けプロセスを簡素化するためのリソースです。各遺伝子は専門家によってアノテーション付けされています - 遺伝子名、機能説明、生物種、染色体番号...
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