データベースのレコード一覧 (件数: 2607)
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生物種
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その他
運用機関:
Centre for DNA Fingerprinting and Diagnostics
生物種:
Drosophila melanogaster | Apis mellifera | Culicidae | Tribolium castaneum | Bombyx mori
説明:
このデータベースは5種の昆虫ゲノム(ショウジョウバエ、ミツバチ、マラリア蚊、コクヌストモドキ、蚕)のマイクロサテライト情報を提供しています。ユーザはサイズ、ゲノム上の位置などでマイクロサテライトを検索...
休止
IBRG: Image Bioinformatics Research Group
運用機関:
Fred Hutchinson Cancer Research Center
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
IBRGの大きな目的は、ツールやサービスを開発・提供し、生物学的研究のデータの有用性を高めることです。
IBRGプロジェクトの一環であるThe ImageStore Projectでは、FlyTED:...
運用機関:
東京医科歯科大学
生物種:
説明:
このプロジェクトは、従来散在していた個々の医科学DBの可用性の向上・高度利用・戦略的統合を可能とし、 我が国におけるライフサイエンスの医科学研究の情報基盤を形成します。このプロジェクトによって、分子か...
運用機関:
北海道大学
生物種:
説明:
「Glyco-Net」「Structure」の2つのデータベースから構成されています。Glyco-Net：複合糖質と関連酵素、表現型や病気に関係する生体機能ネットワークを収録しています。Structu...
運用機関:
RNA Research Group at Wuhan University/College of Life Sciences/Wuhan University
生物種:
説明:
本データベースは様々なデータベースからグループ1イントロンに特化した有用な情報を集めたものです。
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Dermatophagoides farinae
説明:
「Blast againt Full-Mite」のみ有効です。リンク先で、検索DBをOrganism Specific、サブカテゴリーを「Full-Mite Dematophagoides farin...
運用終了
DNAデータベース (DDBJ/EMBL/GenBank=INSD)総覧と検索
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
DNAデータベース(DDBJ/EMBL/GenBank=INSD)は研究者からの登録によってできた世界共通の登録型DNA配列集です。生物種での分類の下に研究分類があり、遺伝子発現の情報のみならず特許に...
運用終了
Database for Protein-3000 Project
運用機関:
独立行政法人理化学研究所
生物種:
説明:
文部科学省「タンパク3000プロジェクト」の現状と成果をまとめたものです。現在はタンパク3000プロジェクトのアーカイブサイト （http://www.tanpaku.org/about/old_pr...
運用機関:
名古屋大学 大学院生命農学研究科
生物種:
Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Solanum lycopersicum
説明:
シロイヌナズナの研究者のためのサイトです。マイクロアレイによる遺伝子発現解析、遺伝子の検索および解析、プライマー設計等のツールが提供されています。
運用機関:
筑波大学 下田臨海実験センター
生物種:
Ciona intestinalis
説明:
海産無脊椎動物であるホヤは、ヒトと同じ脊索動物に属し、脊椎動物の祖先にあたる動物です。幼生はオタマジャクシ幼と呼ばれ、脳、眼、脊索、神経管、筋肉をもっているにも関わらず、全細胞数が2,600と非常にシ...
運用終了
CELLPEDIA
運用機関:
独立行政法人産業技術総合研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト正常細胞に関する情報を統合的に整備したデータベースです。ヒト成人細胞、幹細胞と成熟前の先駆細胞約2300種類について、独自に開発したノイズ画像に強い細胞形態測定ツールを用いて測定した染色画像データ...
運用終了
C. elegans RNAi Phenome Database
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 神戸研究所
生物種:
Caenorhabditis elegans
説明:
線虫のRNAi表現型解析を行ない、そのデータを細胞数・各組織の分化・形態等の独立したカテゴリーについてあらかじめ定義した表現型指標の有無について体系的に表現型を記述しました。機能未知遺伝子の機能予測や...
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Homo sapiens
説明:
SAGE法を用いて、ヒト血液細胞の約70万個以上の遺伝子発現を解析した結果を公開しています。生体防御機構（免疫）、特に炎症、免疫疾患をターゲットにした遺伝的要因の同定と分子レベルでの解明の為、生体防御...
運用機関:
国立研究開発法人海洋研究開発機構
生物種:
説明:
日本周辺の海洋生物の多様性情報、特に生物地理情報を扱うデータシステムです。海洋生物の採取・観察位置、画像、動画、分類学的情報、生態・生理学特性の概要、採取記録・文献情報を収集、蓄積、公開しています。現...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
タンパク質-核酸複合体中における塩基とアミノ酸の特異的相互作用の原子対と距離を検索するためのデータベースです。
運用機関:
University of California, Los Angeles
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Xenopus tropicalis | Gallus gallus | ...
説明:
選択的スプライシング情報のデータベースです。生物種は、ヒト、マウス、ラット等9種類の脊椎動物、4種類の昆虫類、ホヤ、線虫です。キーワード検索が可能です。
運用機関:
広島大学 大学院
生物種:
Embryophyta
説明:
NIFTY のＳＡＳ氏が作られた「身近な野草を調べよう」を平田法隆氏が HTML 文書化したものです。
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
説明:
材木遺伝資源保存林ごとの保存対象樹種の一覧表です。保存林コード、保存樹種名、所在都道府県名で検索できます。成長や形質の優れた林分の遺伝子を永続的に保存するために、優良林分が伐採される前に種子を採取し、...
運用機関:
National University of Singapore
生物種:
説明:
タンパク質をコードしているDNA配列のデータベースです。イントロンを含む遺伝子、含まない遺伝子の両方の遺伝子について、詳細かつ広範囲な特徴を提供しています。
運用終了
WILD RICE DATABASE
運用機関:
株式会社植物ゲノムセンター
生物種:
Oryza sativa
説明:
野生イネの形態的特徴データを紹介するデータベースです。栽培イネの祖先種と考えられているO. rufipogon, O. barthiiおよびO. glumaepatulaなど約600系統の情報を含んで...
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
体内におけるタンパク質の局在に関する情報を、論文をもとにまとめたデータベースです。ヒトの組織の包括的な階層構造や個々の組織の名称、個々の組織で発現する遺伝子の情報を得ることができます。
運用終了
TIGR Gene Indices
運用機関:
TIGR (The Institute for Genomic Research)
生物種:
説明:
GenBankに登録されている配列から重複がなく、同じ遺伝子由来と考えられる配列を自動的にクラスタ分けし、データベース化したシステム。
運用機関:
Baylor College of Medicine
生物種:
Homo sapiens
説明:
ガン関連遺伝子のデータベースです。「The Tumor Gene Database」は 「The Tumor Gene Family of Databases」の一部としてまとめられました。将来的には...
運用機関:
名古屋大学 遺伝子実験施設
生物種:
Embryophyta
説明:
転写開始点既知の植物核遺伝子230余をその機能に従って分類し、個々の遺伝子についてTATAボックスの有無を解析したデータです。
休止
SERPIN: Southeastern Rare Plant Information Network
運用機関:
The State Botanical Garden of Georgia Duke University Biological & Experimental Sciences Library
生物種:
説明:
アメリカ南東部に生息する珍しい植物の情報を集めたデータベースです。
運用機関:
NCBI (National Center for Biotechnology Information)
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
SAGE法による発現解析データベース。データはGEOに取り込まれた。
運用終了
RNABase.org: The RNA Structure Database
運用機関:
調査中
生物種:
説明:
NDBとRCSB PDBに登録されているデータから立体構造を持つRNAを抽出し, データベース化したシステム。
それぞれの立体構造について完全な立体配座マップを提供しており, マップの外れ値の割り合い...
運用機関:
調査中
生物種:
Azotobacter vinelandii | Bacillus amyloliquefaciens | Bacillus stearothermophilus | Bos taurus | Dendroaspis angusticeps | ...
説明:
タンパク質相互作用のデータベースです。
運用機関:
調査中
生物種:
説明:
病原細菌の顕微鏡写真、性状検査結果を掲載しています。データは以下の研究機関から提供されています。京都大学医学部保健学科、京都大学医療技術短期大学部、山口大学医学部保健学科、東京都臨床医学総合研究所、法...
運用終了
Obesity Gene Map Database
運用機関:
Pennington Biomedical Research Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
肥満に関連した遺伝子の位置や特性等の詳細情報を集めたデータベースでした。
運用終了
NDG: Neuroscience Database Gateway
運用機関:
SfN (Society for Neuroscience)
生物種:
説明:
神経科学に関係のあるデータベースのカタログです。
現在は運用を終了し、 Neuroscience Information Framework （http://integbio.jp/dbcatalog...
運用機関:
生物種:
Culicidae
説明:
蚊のゲノム学に関する論文、ブログ、データベース、ディスカッション・フォーラム、ファイル、画像ギャラリー、投票、調査、Wiki にアクセスするためのコミュニティーを提供しています。
運用機関:
San Diego Supercomputer Center
生物種:
説明:
高分子、タンパク質に関する情報をインターネット上に存在する複数のバイオ関連データベースから取得することができます。SWISS-PROT、GenBank、PDB、PubMedをはじめ、50以上のデータベ...
運用機関:
東京大学
生物種:
Oryzias latipes
説明:
メダカEST、迅速マッピングシステムM-marker 2003、オリゴチップmedaka microarray 8Kのデータを掲載しています。すべてのクローンはNBRP Medaka (https:/...
運用機関:
Max-Planck-Institut
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトX染色体に関する統合データベースです。
運用機関:
情報知識学会
生物種:
説明:
赤外ラマン文献データベースの情報検索システム。文献のタイトル、ジャーナル、ページ、日付が検索結果として表示される。
運用終了
HotMolecBase
運用機関:
Weizmann Institute of Science
生物種:
説明:
疾患で重要な役割を果たしていると思われる因子（タンパク質や遺伝子等）について、広範囲の情報を提供していました。
情報は次に示す項目に整理・分類されていました。
因子の説明、構造、翻訳後の修飾（Post...
運用機関:
National Institute of Standards and Technology
生物種:
Homo sapiens
説明:
ミトコンドリアの発生と作用に関与するタンパク質のデータを包括的に集めたデータベース。以下のデータベースの情報を集約・整理したものである。
SwissProt, LocusLink, Protein D...
運用機関:
The Wistar Institute
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus
説明:
血液生成の際の転写制御に関する情報を集めたデータベースです。
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
枝分かれした糖鎖構造の相同性をKEGG GLYCANおよびCarbBankに登録されたデータから検索するサイトです。KCaM (KEGG Carbohydrate Matcher) のアルゴリズムを使...
運用終了
GDB
運用機関:
An international collaboration in support the Human Genome Project
生物種:
Homo sapiens
説明:
ゲノム統合データベースです。Amplimer、クローン、遺伝子、遺伝子位置、SNP、文献などの情報がありました。
運用終了
EICO DB: Expression-based Imprint Candidate Organizer
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
ヒト、マウスの刷り込み遺伝子のデータベースです。
運用終了
DoTS: Database Of Transcribed Sequences
運用機関:
Computational Biology and Informatics Laboratory
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
一般に公開されている転写配列から作成した、ヒトおよびマウスの転写インデックスのデータベースです。
運用機関:
University of Pennsylvania
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus
説明:
ヒト、マウス、ラットの進化距離のデータベースです。
運用終了
DDBJ/CIB ヒトゲノム情報工房
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
国際DNAデータベースに登録、公開された配列情報をもとにヒトゲノム配列をアセンブルしてコンティグを作成する独自の方法を開発し、より正確な染色体配列を作成して公開していました。
運用終了
Database for Anti-HIV Compounds
運用機関:
National Institute of Allergy and Infectious Diseases
生物種:
Homo sapiens | Human immunodeficiency virus
説明:
抗HIV化合物、HIV治療薬に関する情報を集めたデータベース。データベースに登録されている情報は、主要な文献の調査を継続して行い、収集したものである。Webサイトは、次の6つのセクションに分かれている...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）