データベースのレコード一覧 (件数: 2607)
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生物種
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その他
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
cattle | deer | horse | sheep | pig | ...
説明:
家畜疾病の特徴と対策をまとめたデータベースです。ウシ、ウマ、めん羊、ヤギ、豚・イノシシ、家禽の疾病について、罹患動物の種類、特徴と対策が収録されています。法定伝染病や届出伝染病の区別も記載されています...
運用機関:
環境省自然環境局 生物多様性センター
生物種:
説明:
生物多様性データを統合的に共有化する目的で、全国の生物情報を集積、共有、提供しているシステムです。観察された生物の確認年月日と場所、和名、学名、写真、報告者が登録されています。確認年月日や和名などによ...
運用終了
iPfam
運用機関:
Howard Hughes Medical Institute
生物種:
説明:
タンパク質ファミリーに関する物理的相互作用のデータベースです。Protein DataBank（PDB）から抽出した既知タンパク質構造から計算されたタンパク質ドメイン間の相互作用、リガンドとの相互作用...
運用機関:
EMBL-EBI
生物種:
Metazoa | Ascomycota | Salpingoecidae | Arabidopsis thaliana
説明:
動物のゲノムから推測される遺伝子の系統関係のデータベースです。種々の動物ゲノムの配列情報を用いて、オーソログやパラログについての信頼できるキュレーションされた情報を提供することを目的としています。
生...
運用機関:
University of Montana
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Danio rerio | Nematoda | Drosophila
説明:
完全長の真核生物ゲノムにおける反復DNA配列の配列アライメント、隠れマルコフモデル、適合リストのコレクションです。配列の説明、記載文献、分類、モデルとdfam配列間での一致度などを収録しています。デー...
運用機関:
jPOSTプロジェクト
生物種:
All
説明:
本DBは、国内外に散在している種々のプロテオーム情報を標準化・統合・一元管理し、データベース化したもので、多彩な生物種の翻訳後修飾や絶対発現量等 の情報まで網羅したプロテオーム統合データベースです。リ...
運用機関:
名古屋大学 トランスフォーマティブ生命分子研究所
生物種:
Torenia
説明:
トレニアゲノムプロジェクトで明らかとなったトレニア （Torenia； ツルウリクサ属） のゲノムや遺伝子の塩基配列などを提供するデータベースです。cDNA塩基配列、ORF、遺伝子発現領域、シロイヌナ...
運用機関:
国立研究開発法人海洋研究開発機構 地球環境観測研究開発センター
生物種:
Foraminifera
説明:
世界の海洋に生息する単細胞の原生動物プランクトン「浮遊性有孔虫」のデータベースです。種の分類や殻、口孔、棘状突起などの形態的特徴の解説に加えて光学顕微鏡画像、電子顕微鏡（SEM）画像、飼育された生体の...
運用機関:
ORFeome Collaboration
生物種:
Homo sapiens
説明:
国際共同研究グループ The international ORFeome Collaboration (OC) が提供する完全長で精度の高いヒトのORFクローンのデータベースです。29,597クローン...
運用機関:
カビアレルゲンデータベース
生物種:
Aspergillus luchuensis | Aspergillus kawachii | Aspergillus niger CBS 513.88 | Aspergillus niger ATCC 1015
説明:
カビ（真菌）のアレルゲン情報のデータベースです。IUIS Allergen database （http://www.allergen.org） から真菌類のデータを抽出し、4種類の菌 （黒麹菌、白麹...
運用機関:
University of Leipzig, University of Strasbourg
生物種:
Eumetazoa | Placozoa | Porifera
説明:
ミトコンドリアtRNA遺伝子のデータベースです。約1500種の全シークエンスされた後生動物のミトコンドリアRefSeqゲノムのうち3つ組アンチコドンのアミノ酸選択性により分類された30,000以上のt...
公開停止中
HEMM: Human-Earth Microbes and Microbiomes
運用機関:
Shujiro Okuda laboratory
生物種:
Bacteria | Archaea
説明:
人体と地球上の環境に生息する微生物と微生物層についてのゲノムとバーチャルメタゲノム（微生物コミュニティーにおける16S rRNAsから再構成したもの）のデータベースです。公共のデータベースから得られた...
運用機関:
Screening Committee of Anticancer Drugs (SCADS)
生物種:
Homo sapiens
説明:
化合物の制がん作用と関連する遺伝子発現変化の情報を提供するデータベースです。5種類のヒトがん細胞株（結腸がん HT-29，卵巣がん SKOV3，白血病 K562，肺がん H2228，肺がん PC-9）...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
理化学研究所の天然化合物バンク (RIKEN NPdepo) に登録されている化合物を検索するデータベースです。化合物の名称、CAS番号、分子量、構造、InChI情報等を収録しています。生理活性やスペ...
運用機関:
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC)
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans
説明:
マイクロRNAターゲット予測と発現プロファイルの包括的なデータベースです。ターゲット予測はmiRandaアルゴリズムの発展によって、発現プロファイルは哺乳類の組織や正常および疾病由来の細胞系列の大きな...
運用機関:
Nigel Collier
生物種:
説明:
Web 上のニュース記事を利用した感染症監視システム（BioCaster）で使用する目的で作成された、感染症に関するオントロジーです。病原体、症状、感染経路、宿主生物に関して、概念の定義と概念間の関係...
運用機関:
京都大学 iPS細胞研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
京都大学iPS細胞研究所 (CiRA） の研究活動を紹介するサイトです。「研究材料の提供」ページでは、提供可能なヒトやマウスのiPS細胞や疾患特異的iPS細胞、マウスのES細胞やDNA試料等がリスト化...
休止
GeneSigDB: Gene Signature DataBase
運用機関:
Dana-Farber Cancer Institute
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus
説明:
公開された文献から手動でキュレートした遺伝子シグニチャー （遺伝子発現解析結果からの変動遺伝子群） のデータベースです。主にがん、幹細胞、免疫細胞、発生、肺疾患に関連する遺伝子発現に主眼を置いた文献か...
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
Dugesia japonica
説明:
プラナリアESTのデータベースです。独自に開発したプラナリア無性生殖個体を有性生殖個体に転換させる系(有性化)を用いて、有性化個体からcDNAライブラリを作成しました。ESTおよびクラスターの配列、G...
運用機関:
Yale University School of Medicine
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトの脳に関するトランスクリプトームデータのデータベースです。死亡後の脳の両半球から得られる組織サンプルをAffymetrix GeneChip Human Exon 1.0ST Arraysを使って...
運用機関:
ライフサイエンス出版株式会社
生物種:
Homo sapiens
説明:
循環器疾患を対象とした、主要な大規模臨床試験，疫学研究を収録するデータベースです。主要ジャーナルに論文掲載されたトライアルに、循環器関連の主要学会において発表されたものを追加して、目的、期間、対象など...
運用機関:
International Cancer Genome Consortium (ICGC)
生物種:
Homo sapiens
説明:
国際がんゲノムコンソーシアム （ICGC） に登録、公開されているがんのゲノム変異の研究データを、可視化、検索、ダウンロードするためのサイトです。日本からも国立がん研究センター等、大学や研究機関が参加...
運用機関:
明治大学
生物種:
Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Physcomitrella patens | Solanum lycopersicum | Sorghum bicolor | ...
説明:
高速シーケンサーにより得られた遺伝子発現プロファイルデータをもとに、文献情報に基づく知識情報を組み合わせた遺伝子発現ネットワーク情報を提供するデータベースです。種々の植物の遺伝子について、遺伝子名、説...
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
Lentinula edodes
説明:
シイタケ栽培品種の育成者権の保護強化のため、効率良く品種判別する方法を開発しました。日本の栽培シイタケ 133品種と野生菌株21菌株を特定するIGS1-DNA情報をDDBJ/EMBL/Genbank上...
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
Prunus
説明:
多摩森林科学園サクラ保存林に収集しているサクラに関するデータベースです。各サクラの履歴情報や花の形態測定データ、写真、遺伝子型、幼果菌核病罹病リスクなどの情報が紹介されています。種名・栽培品種名による...
運用機関:
国立研究開発法人国際農林水産業研究センター
生物種:
Chlorophyta | Phaeophyceae | Rhodophyta | Characeae | Tracheophyta
説明:
タイ沿岸の水中植物のウェブ写真図鑑です。緑藻、褐藻、紅藻、車軸藻、海草の写真と採集地、水深、植物の特徴と生息場所の説明が収録されています。
このデータベースはタイのカセサート大学、モンクット王工科大学...
運用機関:
国立研究開発法人国際農林水産業研究センター
生物種:
Bacteria | Fungi
説明:
タイの発酵食品を原料ごとに分類し、写真と共に解説したデータベースです。発酵食品に使用された生物種名、発酵食品に含まれる微生物種の学名が掲載されています。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Marchantia polymorpha
説明:
ゼニゴケの完全長ゲノム配列のゲノム情報データベースです。ゲノムブラウザ、遺伝子の名称を組織的に命名し管理するデータベース、解析ツール（BLAST検索、cDNAマッピング、CRISPR/Cas9用のsg...
運用機関:
東京大学総合研究博物館
生物種:
説明:
東京大学総合研究博物館が収蔵する動物標本のデータベースです。
脊椎動物収蔵資料、金華山島のニホンジカ、無脊椎動物標本 （旧理学部動物学教室）について登録番号と種名、採取地などの情報が収録されています...
運用機関:
東京大学総合研究博物館
生物種:
説明:
東京大学総合研究博物館が収蔵する古生物資料のデータベースです。標本データベースには標本の写真と学名、文献の情報が収録されており、学名、標本番号、標本生物の棲息時代などから検索できます。その他、PDFや...
運用機関:
神戸大学
生物種:
説明:
PubChemとChEBIから情報を取得したアミノ酸とケト酸様化合物について、計算により適切な合成系を推定したデータベースです。アミノ酸とケト酸様化合物の構造、組成、分子量と予測される代謝経路、その確...
運用機関:
ViBrism Database Committee
生物種:
Mus musculus
説明:
オリジナルのマッピング法によって遺伝子発現トモグラフィーを作成したマウス脳の遺伝子発現3Dマップです。第8週のオスの脳について、36, 558の発現マップを検索できます。また、遺伝子発現地図をファイル...
運用機関:
DNAバーコードデータベース作成委員会
生物種:
Gastropoda | Bivalvia | Squamata | Hirudinea | Elateridae | ...
説明:
DNAバーコーディングで用いられる塩基配列と証拠標本のデータベースです。日本国内で進行する複数のDNAバーコーディングプロジェクトにおいて用いられる、証拠標本の画像を含む情報とDNA塩基配列情報を併せ...
運用機関:
厚生労働省
生物種:
Homo sapiens
説明:
指定難病の概要、症状、治療法、診断基準等の情報を難病別に閲覧できます。臨床調査個人票のダウンロードもできます。
運用機関:
国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明:
「特定保健用食品/その他解説」は、「特定保健用食品」「ビタミン」「ミネラル」についての情報と「コラム・研究報告」を提供しています。「特定保健用食品」では、特定の保健機能が国によって確認され、認可を受け...
運用機関:
国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明:
いわゆる「健康食品」を原因とする、国内外における過去ならびに最新の健康危害の事例を紹介します。成分名や製品名、注意喚起や勧告を出した機関名等を検索欄に入れ、関連情報を絞り込むことができます。
運用機関:
明治大学 農学部
生物種:
Solanum lycopersicum
説明:
トマトの統合オミックスデータベースです。全てのトマトのEST配列、マイクロトムの完全長cDNA配列、ITAG2.4遺伝子モデルの配列を収録しています。各配列は予測されたゲノム上の位置に基づいてクラスタ...
運用機関:
東京大学 大気海洋研究所
生物種:
Copepoda | Appendicularia | Mysidacea | Chaetognatha
説明:
CMarZ （Census of Marine Zooplankton）が提供する動物プランクトンに関する情報の統合検索システムです。プランクトンの写真、スケッチ、文献の情報や生息分布図、採集地などの...
運用機関:
北海道大学
生物種:
Synechocystis sp. PCC 6803 | Arabidopsis thaliana
説明:
光合成を行う生物のためのタンパク質複合体解析のデータベースです。シロイヌナズナのチラコイドとSynechocystis PCC6803の細胞全体のタンパク質複合体について、Blue-Native PA...
運用機関:
株式会社情報数理バイオ, 明治大学
生物種:
Bos taurus | Mus musculus | Homo sapiens
説明:
ヒト、ウシ、マウスのゲノムから新規GPIアンカー型タンパク質の遺伝子を予測した結果のデータベースです。N末端、C末端からの30残基以内の平均疎水性値、C末端から30残基以内で最も平均疎水性値が高くなる...
運用機関:
九州大学 大学院医学研究院, 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans | Saccharomyces cerevisiae
説明:
論文などで報告された ChIP-seq データの可視化と解析を行うサイトです。公開 NGS データレポジトリ (NCBI, EMBL-EBI, DDBJ) に登録されたほぼ全ての ChIP-seq デ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
The Rice Expression Database II INAHO（RED II INAHO）は、イネのアブシジン酸とジベレリンの応答性遺伝子の転写プロファイリングを調べるために、60-mer...
運用機関:
一般社団法人SSCI-Net
生物種:
Homo sapiens
説明:
化粧品などによる皮膚の健康被害や安全性についての症例を登録し調査解析するためのデータベースです。皮膚科関連学会会員の医療施設，日本皮膚科学会専門医主研修施設より症例情報を登録するようになっています。ま...
運用機関:
国立保健医療科学院
生物種:
Homo sapiens
説明:
臨床研究情報ポータルサイトでは、国内の3つの臨床情報登録センター（大学病院医療情報ネットワーク研究センター〔UMIN-CTR〕、日本医薬情報センター〔JAPIC〕、日本医師会治験促進センター〔JMAC...
運用機関:
東京大学 医科学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
OpenTeinは幹細胞由来テラトーマのデジタル化したホールスライドイメージのデータベースです。個々のデータには実験情報が付けられており、画像は高解像度で拡大できる他、ダウンロードも可能です。webベ...
運用機関:
公益社団法人 日本放射線腫瘍学会
生物種:
Homo sapiens
説明:
JRODは、日本全国の放射線治療情報の基本的部分を登録し、集計・分析することで医療の質向上に役立て、治療成績の改善を目指すことを目的としたデータベースです。
情報の登録は本事業への参加登録を行った施...
運用機関:
東北大学総合学術博物館
生物種:
Foraminifera
説明:
浮遊性有孔虫電子標本のデータベースです。東北大学総合学術博物館が所有する浮遊性有孔虫の電子標本について実標本（r-specimen）の詳細な情報と3次元コンピュータ・グラフィックスでの標本観察が利用で...
運用機関:
京都大学生存圏研究所
生物種:
Basidiomycota
説明:
京都大学生存圏研究所が保有する木材腐朽性担子菌類の乾燥子実体標本および生体菌株のデータベースです。乾燥子実体標本については標本情報と書誌情報を、生体菌株については遺伝子情報に関するデータを収録していま...
運用機関:
京都大学生存圏研究所
生物種:
Acacia
説明:
インドネシア南スマトラ島のアカシア大規模造林地における地上気象観測のデータベースです。林地内の8地点における降水量、気温、日射量の観測データを10分および1時間間隔のデータにまとめて公開しています。森...
運用機関:
京都大学生存圏研究所
生物種:
Tracheophyta
説明:
北海道大学、東北大学、森林総合研究所、東京大学、名古屋大学、京都大学、九州大学の関連機関で進める木材標本データベースのネットワークです。それぞれの木材標本データベースについてキーワード検索と検索対象標...
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統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）