データベースのレコード一覧 (件数: 2607)
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運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 動物衛生研究部門
生物種:
説明:
牛海綿状脳症 (BSE) に関する国内、海外の情報をリンクしたポータルサイトです。
運用機関:
北海道大学
生物種:
Apicomplexa
説明:
数種の重要な寄生虫のfull-ength cDNA情報とRNA-seqのデータセットを提供するデータベースです。前バージョン（Full-Length cDNA Database）からの大規模なバージョ...
運用機関:
東京大学
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエの脳について、文献に発表されたすべての神経細胞に関する情報を統一したフォーマットで提供するデータベースです。既知神経の情報を各神経や経路の名称から検索・閲覧できる「ニューロンデータベー...
運用機関:
Flybrain Database Consortium
生物種:
Drosophila melanogaster
説明:
ショウジョウバエ脳神経系の解剖学的画像データベースです。各種分子マーカーによる染色像と解説を提供しています。このアトラスの初心者から専門家まで、階層的に使い方に見合った情報が得られるようになっています...
運用機関:
明治薬科大学
生物種:
Homo sapiens
説明:
ファブリー病の病因であるalpha-galactosidase A (GLA) の構造変異のデータベースです。変異の種類、臨床表現型や文献、α-ガラクトシダーゼの立体構造変化の情報を収録しています。変...
運用機関:
福井大学医学部
生物種:
Homo sapiens | Rattus
説明:
内分泌かく乱物質が女性生殖器系に及ぼす影響を遺伝子発現の変化としてとらえ、解析したデータベースです。ラットとヒトの生殖器細胞株について、ダイオキシン (TCDD) およびジエチルスティルベステロール（...
運用機関:
ダイナミックブレインプラットフォーム(DBPF)委員会
生物種:
説明:
脳の情報表現やその処理に関わるダイナミクスの研究に関係する研究データおよび研究者のメッセージを広く体系的に共有するためのプラットフォームです。脳の細胞、局所回路、脳全域、行動などの様々なレベルでの実験...
運用機関:
東京工業大学 生命理工学院
生物種:
説明:
タンパク質の動きを主鎖二面角の大きな変化に基づいて特徴づけしたデータベースです。動きを示す高分解能タンパク質構造ペアを幅広くかつ重複無いように集めています。データは様々な側面からの並べ替えや検索が可能...
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
Caenorhabditis elegans
説明:
線虫の神経シナプス結合に関するデータベースです。咽頭および咽頭以外の体性神経系におけるニューロン中のシナプス接続についての図と表により構成されています。いくつかのニューロンクラスを選択すると、神経結合...
運用機関:
長浜バイオ大学
生物種:
説明:
国際塩基配列データベース (DDBJ/EMBL/Genbank, INSDC) に登録されている環境メタゲノム解析由来の配列から、ヒトの健康に役立つ可能性のある遺伝子の候補を抽出して収録したデータベー...
運用機関:
CEOPつくばリファレンスサイトプロジェクト
生物種:
説明:
つくば学園都市にある多数の研究所および大学によって観察された水文気象学のデータをアーカイブするためのポータルデータベースです。このデータベースは、地表気象・放射線測定データ、フラックスデータ、地温・土...
運用終了
Cassava Online Archive
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター
生物種:
Manihot esculenta | Ricinus communis | Populus trichocarpa | Vitis vinifera | Arabidopsis thaliana
説明:
有用熱帯作物キャッサバのmRNA配列、EST、それらのアノテーション情報を提供するデータベースです。mRNAやESTの配列、そのアノテーション、既知遺伝子との類似性、タンパク質ドメインなどの情報をアノ...
運用機関:
名城大学 薬学部 医薬情報センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
国内で報告された副作用及び中毒に関する症例報告を集めたデータベースです。利用、検索には利用者番号とパスワードの入力が必要です。
運用機関:
慶應義塾大学
生物種:
説明:
癌関連タンパク質の相互作用を含めたパスウエイの画像データベースシステムです。癌を引き起こす遺伝子名、タンパク質名やそれぞれの配列情報、ドメイン情報、および関連するパスウェイデータが収録されています。キ...
運用機関:
Institut de Biologie du Développement de Marseille
生物種:
Botryllus schlosseri | Ciona intestinalis | Ciona savignyi | Halocynthia aurantium | Halocynthia roretzi | ...
説明:
ホヤ初期胚における遺伝子発現のデータベースです。既存データベースや文献から抽出された遺伝子のアノテーション、解剖学的オントロジー、遺伝子の発現や機能、文献などの情報が、胚の発生段階と共に収録されていま...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Hexapoda
説明:
日本国内の大学、博物館、研究機関などが所蔵するアジア、大平洋地域産昆虫類のタイプ標本および種情報のデータベースをまとめたポータルサイトです。
日本だけでなく、海外調査によってもたらされたアジア・太平洋...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Streptomyces coelicolor | Streptomyces griseus | Streptomyces peucetius | Streptomyces albogriseolus | Streptomyces venezuelae | ...
説明:
抗生物質生産菌である放線菌Streptomyces coelicolor A3(2)とその近縁種の転写制御に関するデータベースです。転写因子、被制御遺伝子、転写開始点のシーケンスや機能、遺伝子位置など...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
小脳プラットフォームは、小脳研究に関連する情報を収録したデジタル研究アーカイブです。実験結果の数値データ、画像、動画や、モデルプログラムおよびスクリプト、データ解析用プログラムやスクリプト、関連論文や...
運用機関:
京都大学 iPS細胞研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトの分化した細胞および幹細胞に関する情報を網羅的に収集したデータベースです。各エントリーには形態情報や細胞の画像、物理的位置や機能、遺伝子発現、細胞オントロジー、関連文献などの情報を収録しています。...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGG Metagenomeはメタゲノム配列が決定された環境サンプル情報のデータベースです。KEGG MGENEに収録されている遺伝子のサンプル情報にあたります。Projectからそのサンプルで決定...
運用機関:
京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種:
説明:
KEGG MODULEは、シークエンスが明らかにされたゲノムのアノテーションおよび生物学的意味解釈に使用される機能ユニット (KEGGモジュール) のデータベースです。KEGGモジュールは手動で定義さ...
運用機関:
藤田保健衛生大学 総合医科学研究所 システム医科学研究部門
生物種:
Mus musculus
説明:
マウス系統を使った行動実験の生データを収録したデータベースです。データは公表された論文から収集しています。マウス表現型データベース、C57BL6系統行動データベースと行動解析用ソフトウェアとで構成され...
運用機関:
東京大学
生物種:
Oryzias latipes
説明:
メダカゲノムのメチル化に関するデータベースです。CpGサイトのメチル化レベルの情報を２つの系統 （HdrR、HNI）の３種類の組織 （胞胚、肝臓、精巣） について収録しています。ゲノムブラウザでの閲覧...
運用機関:
東京大学
生物種:
Caenorhabditis elegans
説明:
線虫のトランススプライシング遺伝子に関連する転写開始点(TSS）についての包括的なコレクションです。
ゲノムブラウザとTSSリストで構成されています。リストにはアウトロンTSSとエクソンTSSとについ...
運用機関:
情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種:
説明:
塩基配列を高速に検索するサイトです。数塩基のミスマッチ、挿入、欠失を許容した配列の検索が可能です。検索結果はHTMLのほか、タブ区切りテキスト、JSONなど様々なフォーマットで取得できます。
運用機関:
アメリカ国立医学図書館
生物種:
Homo sapiens
説明:
ClinicalTrials.govは，米国国立公衆衛生研究所 (NIH) と米国医薬食品局 (FDA) が共同で、米国国立医学図書館 (NLM) を通じて、現在行われている治験及び臨床研究に関する情...
運用機関:
フランス国立保健医学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
Orphanetは希少疾患患者の診断と治療の向上を図ることを目的とした、希少疾患や希少疾患用医薬品について様々な情報を参照可能にしたデータベースです。疾患や薬に関する一般的な情報をはじめとして、臨床試...
運用機関:
日本人類遺伝学会 臨床細胞遺伝学認定士制度委員ワーキンググループ
生物種:
Homo sapiens
説明:
山口大学名誉教授 梶井正医学博士により作成された，染色体異常の報告を受けた医師のための解説サイトです。染色体数の異常，出生前診断等項目別に詳しい解説を参照することが出来ます。
運用機関:
日本小児遺伝学会
生物種:
Homo sapiens
説明:
国際基準に基づく小奇形アトラスは、奇形徴候の記載法に関する国際的なコンセンサスに基づき、頭蓋顔面の形態異常と四肢の形態異常 （頭部・眼囲・外耳・鼻・口囲・手足） の用語と定義や写真が掲載された解説集で...
運用機関:
GeneReviews Japan 運営事務局
生物種:
Homo sapiens
説明:
GENEReviewsは、遺伝性疾患の症状や診断、遺伝学的検査、遺伝カウンセリングなどについて、専門家による解説が参照できる医療スタッフ向けの遺伝性疾患情報サイトです。臨床遺伝医学に関する総合情報サイ...
運用機関:
日本ハンドサーチ・エレクトロニックサーチ研究会
生物種:
Homo sapiens
説明:
東アジアの伝統医学 （漢方治療、日本鍼灸、あんまマッサージ指圧、韓医学） について、論文を参考にしてエビデンスレポートを作成、まとめたデータベースです。
運用終了
日本人難聴遺伝子データベース
運用機関:
信州大学医学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
難聴に関する一般的な情報や診断・治療法に関わる情報、原因遺伝子についての情報が掲載されているデータベースです。
信州大学医学部によるオリジナルサイト （http ://www.shinshu-u.a...
運用終了
リハ患者DB: リハビリテーション患者データベース
運用機関:
日本リハビリテーション・データベース協議会
生物種:
Homo sapiens
説明:
リハビリテーション患者データベースは、患者さんのリハビリテーションに関わる項目 （リハビリ実施情報、看護必要度、入院・退院情報、発症情報、担当医療従事者など ）を蓄積したデータベースです。利用には医療...
運用機関:
多発性内分泌腫瘍症研究コンソーシアム
生物種:
Homo sapiens
説明:
多発性内分泌腫瘍症 （Multiple Endocrine Neoplasia: MEN） の情報サイトです。MENに関する一般的な情報や医療従事者、患者さん向けの情報が充実しており、症例調査結果も閲...
運用機関:
青森県立保健大学 健康科学部
生物種:
Homo sapiens
説明:
国民健康・栄養調査の結果 （全国） および各都道府県から提供された健康・栄養調査結果の報告書等に記載されている公開データを参照し、主に「健康日本２１」に掲げられている主要指標についてのデータを選択し収...
運用機関:
厚生労働省 国立医薬品食品衛生研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus norvegicus | Mus musculus
説明:
100種類超の化学物質をマウス、ラット、ヒトの細胞に投与した場合における生体影響のトランスクリプトームをマイクロアレイを用いて網羅的かつ高精度に測定した大規模トキシコゲノミクスデータベースです。主に単...
運用機関:
厚生労働省 国立感染症研究所
生物種:
Norovirus | Sapovirus | Vesivirus | Lagovirus | Small round structured virus | ...
説明:
下痢症ウイルスの遺伝情報や関連する文献情報を調べられるデータベースです。遺伝子配列に関する情報やウイルスなどの条件を指定して検索をすることができます。
運用機関:
東京女子医科大学
生物種:
Homo sapiens
説明:
2003年以降に全国の総合周産期母子医療センターおよび主要新生児医療施設に入院して治療を受けた出生体重1500g以下の新生児の情報を共有したデータベースです。
母体情報、妊娠合併症、分娩情報、新生児情...
運用機関:
国立研究開発法人 国立がん研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
がん専門施設から集めたクリニカルパス （タイムスケジュールと医療内容を記述した表） のデータベースです。
医学的な根拠を基に現時点で最も妥当であると考えられる処置や治療を掲載した基本パスを検索できます...
運用機関:
国立研究開発法人国立循環器病研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
日本脳卒中データバンクは、脳卒中の急性期治療等の標準化に必要なEBM (Evidence based medicine) を確立するためのインフラとして作成された、脳卒中急性期患者データベース（患者の...
運用機関:
京都大学
生物種:
Homo sapiens
説明:
DDIDAは薬、低分子化合物とその身体的応答（疾患／症状）の関係性についてのメカニズムに基づいた情報を提供するために開発されたデータベースです。医薬品、低分子化合物、表現型応答、薬の副作用、薬とターゲ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
FiT- DBは、圃場におけるイネ（日本晴－農林８号）の葉の遺伝子発現データと、遺伝子発現変化の背景にある要因の統計モデリング解析結果のデータベースです。遺伝子ごとの発現量や気象条件 、概日時計、日齢...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Hordeum vulgare
説明:
オオムギ完全長cDNA遺伝子と遺伝子発現情報のデータベースです。塩基配列、マイクロアレイ解析による遺伝子発現データを収録し、IBSCによって解析されたゲノム情報を基にしたゲノムブラウザも提供しています...
運用終了
AfRicA DB: African Rice Annotation DataBase
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza glaberrima
説明:
AfRicA DBはアフリカ米 (Oryza glaberrima, IRGC104038) のゲノムについてまとめたデータベースです。ゲノムアノテーション情報、挿入/欠失、SNP、SSRなどの情報を...
運用終了
PGF-DB: Plant Gene Family Database
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Sorghum bicolor | Zea mays
説明:
PGF-DBは、RAP-DB (Rice Annotation Project Database)とつないで、イネ、ソルガム (モロコシ) 、トウモロコシ、シロイヌナズナの遺伝子ファミリーを解析するた...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Triticum aestivum
説明:
コムギゲノムに関する統合データベースです。ゲノム配列、遺伝子発現情報、アノテーション情報やゲノム解読に関する論文、学会情報を収録しています。コムギ、オオムギの配列に対するBLAST検索や遺伝子の全文検...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Glycine max
説明:
DAIZUbaseは大豆ゲノムのデータベースです。遺伝子ごとに染色体上の位置、配列の情報が収録されています。マップブラウザ、遺伝子ビューア、およびBLAST検索システムを備えており、GbrowseやU...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Viridiplantae
説明:
顕花植物のゲノムをアノテーションするためのウェブサービスです。Oryza sativa、 Zea mays、 Arabidopsis thaliana、 Solanum lycopersicumなど１...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Raphanus sativus
説明:
ダイコン (Raphanus sativus、ラファナス サチブス) のDNAマーカーデータベースです。EST-SSR、Isozyme marker、Morphological marker、R-ES...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Dianthus caryophyllus
説明:
カーネーション (Dianthus caryophyllus、ダイアンサス カリオフィラス)のゲノム情報のデータベースです。遺伝子ごとに配列データに加えてGOなどによるアノーテーション情報やUniPr...
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統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）