データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
並び替え:
生物種
カテゴリ
稼動状況
地域
その他
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
完了した治験より得られたデータを収録するデータベースです。治験プロトコル、最初に公表した文献、データセット、アノテートした治験の報告書などを収録しています。
運用機関:
ICPSR, Institute for Social Research
生物種:
Homo sapiens | Human immunodeficiency virus
説明:
麻薬中毒やHIV研究に関連するデータを取得、保存、発信することができるツールです。広範な合法･違法薬物（アルコール、タバコ、マリファナ、コカイン、合成薬など）をカバーし、薬物使用の軌跡、パターン、なら...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
機能的および構造的なニューロイメージング解析のためのイメージングリソース（人気のツールの他、研究室やサイバースペースの隅に隠れている可能性のあるツールや機能を含む）のデータベースです。使用許諾レベル、...
運用機関:
ATCC Standards Development Organisation
生物種:
All | Clostridium Difficile | Enterovirus | Human metapneumovirus | Staphylococcus | ...
説明:
カテゴリーA、B、および C の優先病原体、新興感染症病原体、非病原性微生物および他の微生物学的材料に関連するコミュニティによる研究に対して、試薬、ツールおよび情報を提供するリポジトリです。
運用機関:
The UT Center for Integrative and Translational Genomics, US National Institute of Mental Health (NIMH)
生物種:
Arabidopsis thaliana | Drosophila melanogaster | Glycine max | Homo sapiens | Hordeum vulgare L. | ...
説明:
遺伝子、分子、ならびにより高次の遺伝子機能および表現型の複雑なネットワークを研究するために使用可能な、リンクされたデータセットおよびツール集です。数百人の科学者が 25 年以上かけて残したデータに、配...
運用機関:
生物種:
Canis | Homo sapiens | Mus musculus
説明:
CardioVascular Research Grid (CVRG) は、心血管に関するデータとデータ解析ツールを共有するためのサイトです。解析ツールのリストと使用例が収録されています。
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
NHLBI の Biorepository と Data Repositoryに収録された心臓血管、肺や血液の状況に関する研究成果を一括して検索できるサイトです。サンプルのタイプ、疾患、研究手法による...
運用機関:
生物種:
説明:
選択的スプライシングを探索することができるリソースです。スプライシングの起こる位置、関係する遺伝子、スプライシングの方法を収録しています。エクソンスプライシングエンハンサー（ESE）、エクソンスプライ...
運用機関:
National Cheng Kung University (NCKU) Bioinformatics Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
十分に特性が明らかになっているがん遺伝子およびがん抑制遺伝子の情報を収集したデータベースです。各遺伝子について、染色体上の位置、別称、タンパク質のサブユニットや機能、ドメイン、遺伝子オントロジーなどの...
運用機関:
National University of Singapore
生物種:
Homo sapiens
説明:
薬物有害反応のターゲットを容易に検索できるデータベースです。既知の薬物有害反応のターゲット、機能および特性に関する情報が含まれています。
運用機関:
U.S. National Library of Medicine
生物種:
All
説明:
NLM（National Library of Medicine）データベースに引用されている化学物質の同定に使用された構造および命名典拠ファイルへのアクセスを提供するオンライン検索システムです。また...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
All
説明:
米国国立衛生研究所（NIH：National Institutes of Health）が運営する、生物医学・生命科学雑誌に掲載された文献のデジタルアーカイブです。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Eukaryota
説明:
オルガネラについてコミュニティが標準的に使用する、キュレーションされた配列データと関連情報を提供するリソースとして、NCBI Reference Sequence（RefSeq）プロジェクトの一貫とし...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Viruses
説明:
ウイルスのゲノム配列コレクションです。キュレーションされた配列データやコミュニティに関連する情報を提供する Entrez Genome の一貫として構築されたリソースです。ウィルスゲノムブラウザ、ウィ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Influenza virus
説明:
NIAID Influenza Genome Sequencing Project および GenBank から得られたデータを、インフルエンザ配列解析ツール、ならびに GenBank へのアノテーシ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
All
説明:
GenBank に収載されたレコードに含まれる各コード配列（CDS）の分類法と各生物とレコードに正しい遺伝情報が割り当てられているかを注意深くチェックする作業の概要と参照を収録しています。変異配列、生...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
生物種:
Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
すべての公開 mRNA 配列（GenBank または RefSeq の mRNA、および dbEST および Trace の単一パス cDNA 配列）の包括的で非冗長な配列表示を提供するキュレーション...
運用機関:
Melanoma Molecular Map Project (MMMP)
生物種:
Homo sapiens
説明:
メラノーマに焦点を当てた、がんの発症と進行に関わる分子相互作用のマップとパスウェイのコレクションです。このコレクションは３つのデータベースで構成されています：
（１）個別の患者データベース
参加医療機...
運用機関:
生物種:
All
説明:
すべてのタンパク質とゲノムに関する構造的および機能的アノテーションを収録したのデータベースです。配列、ゲノムアサインメント、構造、ドメイン組合せ、系統的分布の情報を収録しています。生物種、機能、表現形...
運用機関:
Manitoba Centre for Proteomics and Systems Biology (MCPSB)
生物種:
All
説明:
プロテオミクス実験の完全なレコードではなく、配列アサインメント検証など、特定のバイオインフォマティクス関連タスクに必要な最小限の情報を保持するデータベースです。ほとんどのデータは一連の XML ファイ...
運用機関:
Krasnow Institute for Advanced Study, The National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine
生物種:
Metazoa
説明:
デジタル形式で再構築したニューロンを公開された文献からキュレーションしたデータベースです。生物種、サンプル情報、測定条件、３次元画像を収録しています。生物種、脳の領域、細胞の種類などからの絞り込み、実...
運用機関:
Biological Sciences Research Group, Instituto Superior Técnico, Knowledge Discovery & Bioinformatics Research Group, Instituto Superior Técnico
生物種:
説明:
出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）の転写因子（TF）と ターゲット遺伝子との間の調節関係を収録したデータベースです。文献からキュレートしたDNA結合タンパク質のアミノ酸配列、...
運用機関:
Kansas State University
生物種:
Tribolium castaneum
説明:
コクヌストモドキ（Tribolium）の遺伝学および発生生物学のためのコミュニティリソースです。データベースは、汎用データモデル Chado 上に構築されており、ゲノム配列から突然変異表現型まで、さま...
運用機関:
Department of Energy Joint Genome Institute (DOE JGI)
生物種:
Bacteria | Eukaryota | Fungi
説明:
公に利用可能なすべての微生物のゲノムを対象として、データの管理、分析およびアノテーション付与を行うためのプラットフォームです。ゲノム、タキソノミー、研究、代謝などの情報を収集しています。ゲノム、機能、...
運用機関:
Infrafrontier Research Infrastructure, Infrafrontier Gmbh
生物種:
Mus musculus
説明:
生物医学の基礎研究に不可欠な、重要なマウスの変異株の収集、保管（凍結保存）および配布を目的とした非営利リポジトリです。ヨーロッパ中のいくつかの研究所や機関をパートナーとして、ヒトの遺伝的および多因子性...
運用機関:
Iowa State University
生物種:
Glycine max | Glycine soja
説明:
米国農務省研究サービス植物遺伝学ユニット（USDA-ARS）が運用する大豆の遺伝子データベースです。専門家によりキュレーションされた大豆の遺伝子、ゲノミクス、関連するデータリソースを集約しており、最新...
運用機関:
Institute for Systems Biology (ISB), Seattle Proteome Center
生物種:
Apis | Bos taurus | Caenorhabditis elegans | Candida | Danio rerio | ...
説明:
タンデム質量分析プロテオミクスの研究およびソフトウェアツールで同定されたペプチドの公開データベースです。サンプルの情報、サンプルの調整、解析プラットフォーム、変性方法、報告文献などの情報を収録していま...
運用機関:
National Institute of Agrobiological Sciences, ProDom Team
生物種:
Spodoptera frugiperda
説明:
鱗翅目ヨトウガのゲノミクスの統合データベースです。数多くの遺伝子の同定と、科学コミュニティが関心を寄せる遺伝子ファミリーの包括的クローニングを可能とします。 クラスターやコンティグの塩基配列、ライブラ...
運用機関:
BioComputing laboratory, University of Padua
生物種:
Daphnia | Daphnia magna | Daphnia pulex
説明:
ミジンコ科のゲノムデータベースです。主にミジンコとオオミジンコについてEST、GSS、マイクロサテライトのライブラリー、遺伝子についての配列、染色体位置、相同遺伝子、タンパク質、オントロジー、発現情報...
運用機関:
BioComputing laboratory, University of Padua
生物種:
Anopheles gambiae | Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | Danio rerio | Drosophila melanogaster | ...
説明:
真核生物データベースから得られる遺伝子･ゲノム情報について、共通の要約を提供するリソースです。要約に含まれる情報は、遺伝子記号および完全名、染色体、遺伝子および分子マップ情報、遺伝子のオントロジー（機...
運用機関:
BioComputing laboratory, University of Padua
生物種:
All
説明:
天然と推定される状態において、全体または部分的に、固定された３次元構造をもたないタンパク質に関する情報を提供するキュレーションされたデータベースです。タンパク質を得られた生物種、機能、固定の３次元構造...
運用機関:
Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM), SBI, bioinsilico.org
生物種:
All
説明:
既知のタンパク質構造から抽出されたループの構造的分類のコレクションです。この構造的分類は、ループの幾何学的形態および立体配座に基づいて行われます。幾何学的形態は、4 つの内部変数と規則的な隣接する二次...
運用機関:
Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM), SBI
生物種:
Gallus gallus | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus
説明:
プロモーターや遺伝子についての情報を伴うオーソロガスな結合サイトのコレクションです。実験的に定義された結合サイトについて、予測される結合サイトやプロモーターの配列も収録しています。
運用機関:
International Centre Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB), Jedlik Laboratories: Bioinformatics, Faculty of Information Technology, Pázmány Péter Catholic University
生物種:
All
説明:
機械学習法の性能比較が可能な標準データセットを作成するためのコレクションです。ドメインの配列や構造のトポロジーグループの分類、タンパク質配列、データセット間の距離マトリックス、データ生成のための処理方...
運用機関:
National Centre for Scientific Research (CNRS), Institut de Biologie et Chimie des Proteines (IBCP), Centre National de la Recherche Scientifique, Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM)
生物種:
Hepatitis C virus
説明:
C型肝炎ウイルスのタンパク質配列、構造および機能解析、ならびに構造生物学を主たる焦点とするデータベースです。命名法を確実にし、遺伝子領域／タンパク質、参照文献、遺伝子タイプ、興味深いドメインなどを収録...
運用機関:
FAIRDOM, Heidelberg Institute for Theoretical Studies (HITS)
生物種:
All
説明:
生化学反応、この反応の運動方程式およびパラメータ、ならびにこれらのパラメータを測定した実験条件を収録したデータベースです。反応の基質、生成物、EC番号、関連パスウェイを収録しています。
運用機関:
Health Canada
生物種:
Homo sapiens
説明:
カナダでの使用が承認された医薬品に関する製品固有の情報を収録したデータベースです。Health Canadaが管理する本データベースには、ヒト用の医薬品および生物製剤、獣医薬および殺菌剤が含まれます。...
運用機関:
Forsyth Institute
生物種:
Bacteria | Fungi
説明:
ヒトの口腔内に存在する原核生物種に関する、部位特異的な包括的データベースです。キュレーションされた 16S rRNA 遺伝子に基づく暫定的命名法と、分類学的情報に基づくゲノム情報が含まれています。
運用機関:
Computational Biology and Informatics Laboratory (CBIL), University of Pennsylvania, Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia, The Wellcome Trust Sanger Institute, The Wellcome Trust Genome Campus
生物種:
Eukaryota | Leishmania | Leishmania major | Trypanosoma brucei | Trypanosoma cruzi | ...
説明:
トリパノソーマ科（Leishmania 属、Trypanosoma 属）の統合ゲノムデータベースです（EuPathDBのファミリーデータベース）。ゲノムの配列や変異、転写、プロテオミクス、タンパク質の...
運用機関:
Computational Biology and Informatics Laboratory (CBIL), University of Pennsylvania, Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia
生物種:
Eukaryota | Trichomonas
説明:
腟トリコモナスの統合ゲノムデータベースです（EuPathDBのファミリーデータベース）。ゲノムの配列や変異、転写、プロテオミクス、タンパク質の機能アノテーション、パスウェイや相互作用などの情報を収録し...
運用機関:
Bioinformatics Resource Centers, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), National Institutes of Health (NIH)
生物種:
Toxoplasma
説明:
ヒトおよび動物の疾病（トキソプラズマ症を含む）を引き起こす単細胞真核生物病原菌、トキソプラズマ属の統合ゲノムデータベースです（EuPathDBのファミリーデータベース）。ゲノムの配列や変異、転写、プロ...
運用機関:
生物種:
Plasmodium
説明:
ヒトおよび動物の疾病（マラリアを含む）を引き起こす単細胞真核生物病原菌、マラリア原虫属の統合ゲノムデータベースです（EuPathDBのファミリーデータベース）。ゲノムの配列や変異、転写、プロテオミクス...
運用機関:
生物種:
Eukaryota | Giardia
説明:
ヒトの下痢性疾患の原因となるランブル鞭毛虫のゲノムと機能をまとめた統合的ゲノムデータベースです（EuPathDBのファミリーデータベース）。核ゲノム組織の起源、寄生原生生物が使用する代謝経路、宿主との...
運用機関:
Institute of Integrative Biology, University of Liverpool, The Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology, The Wellcome Trust Sanger Institute, Bioinformatics Resource Centers, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), National Institutes of Health (NIH)
生物種:
Acanthamoeba | Aedes aegypti | Anncaliia | Anopheles gambiae | Babesia | ...
説明:
真核生物病原体をカバーする統合ゲノムデータベースです。同じ構造で構築された分類群ごとのデータベースを多数含んでいます。VEuPathDB ポータルは、これらすべてのリソースへの入口として機能し、属間の...
運用機関:
Computational Biology and Informatics Laboratory (CBIL), University of Pennsylvania, Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia
生物種:
Cryptosporidium
説明:
寄生虫クリプトスポリジウムのゲノムと機能をまとめた統合的ゲノムデータベースです（VEuPathDBのファミリーデータベース）。全ゲノム配列およびアノテーションを統合したこのデータベースには、コミュニテ...
運用機関:
生物種:
Homo sapiens
説明:
市販されている医薬品およびその記録された副作用に関する情報を収録しています。副作用情報は、公開文書および添付文書から抽出されます。提供されている情報には、副作用の頻度、薬と副作用の分類、関連情報（薬と...
運用機関:
生物種:
説明:
大腸菌 K-12 ゲノムおよびプロテオーム配列に関する最新情報を含むデータベースです。遺伝子名、配列、前後の遺伝子マップ、マイクロアレイ、タンパク質の情報、大規模な遺伝子関連の文献目録を収録しています...
運用機関:
Comparative Genomics Group (CRG), ELIXIR-Hub, MRC Laboratory of Molecular Biology (LMB), European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
生物種:
Homo sapiens
説明:
さまざまなデータ提供者から提供されたゲノム研究のデータセットを探索できるリソースです。データセットにアクセスするには、指定されたデータアクセス委員会（DAC）の承認を得る必要があります。
運用機関:
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), wwPDB, European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
生物種:
All
説明:
Protein Data Bank のエントリーに含まれるすべての残基および小分子成分を記述するデータベースです。リガンド、小分子、モノマーについての詳細な化学的記述（分子名、分子構造、SMILES、...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）