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Haemosphere

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02532
名称データベースの名称 Haemosphere
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://haemosphere.org
運用機関名現在データベースを運用している機関名 The Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 オーストラリア
説明データベースの説明 造血細胞における遺伝子発現の研究データベースです。Walter and Eliza Hall Instituteによる研究で得られたデータセットと、公的に入手できる高品質データセットについて、RNA-Seqデータ、研究サンプルごとの細胞の種類、由来組織、免疫表現型、生物種、細胞株の情報などを収録しています。遺伝子のアノテーションにはEnsembl 、Entrez gene_info file、MGI から得られたヒトとマウスの遺伝子のホモロジー情報を用いています。遺伝子名、高発現領域、遺伝子同士の相関プロット、共発現遺伝子プロファイルによる検索が可能です。データセットや種をまたいで遺伝子発現を比較することもできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30395284
DOI:10.1093/nar/gky1020
PubMed ID:27499199
DOI:10.1016/j.stemcr.2016.07.007
PubMed ID:29617932
DOI:10.1093/bioinformatics/bty207
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://haemosphere.org/datasets/show
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 admin@haemosphere.org
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-05-27
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-05-27
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license