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CropPAL

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02177
名称データベースの名称 CropPAL
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://crop-pal.org/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Australian National Data Service (ANDS), Edwards Group, University of Western Australia
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 オーストラリア
説明データベースの説明 様々な作物におけるタンパク質の細胞内局在をワンストップで調べることができるデータベースです。大規模スケールのMS/MS(質量分析)結果、蛍光タグ実験の結果、ナズナの実験的タンパク質-タンパク質相互作用から推測されるタンパク質-タンパク質相互作用のデータが含まれています。cropPAL2になり、タンパク質の細胞内局在をバイオインフォマティクスで予測したデータと、予測と実験データを共に考慮に入れたコンセンサスな局在情報も含んでいます。キーワード検索やオルガネラを選ぶことで目的タンパク質とその細胞内局在を調べることができます。相互BLAST と EnsemblPLants の相同性ツリーにより、種々作物横断的に局在を検索することや、SUBA の Arabidopsis データと比較することもできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Hordeum vulgare (4513), Oryza sativa (4530), Triticum aestivum (4565), Zea mays (4577)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:26556651
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 休止
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.p7btsb
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2019-07-02
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license