レコード詳細
Human Protein Atlas
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00905 | ||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | Human Protein Atlas | ||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://www.proteinatlas.org | ||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Uppsala University | ||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | スウェーデン | ||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 様々な種類のヒトの器官、組織、細胞におけるタンパク質の発現および局在に関するデータベースです。蛍光抗体イメージング、質量分析に基づくプロテオミクス、網羅的な遺伝子発現解析によるトランスクリプトミクスおよびシステム生物学の手法により得られた情報を遺伝子ごとに記載しています。各レコードは３つのアトラスで構成されています。 「組織アトラス」：ヒトの主要組織や器官におけるRNA発現量、タンパク質発現量 「細胞アトラス」：RNA発現量や発現画像、GFP発現画像など細胞内での局在 「疾病アトラス」：生存がん患者の組織における量的発現解析（RNA-seq）や空間的発現解析（マイクロアレイ）によるタンパク質発現レベル また、抗体の情報、細胞内器官の説明、各組織における腫瘍の説明や生存率の情報なども収録しています。 遺伝子名、抗体名、タンパク質の分類によるデータの絞り込みが可能です。 | ||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606) | ||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://www.proteinatlas.org/about/download | ||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | https://www.proteinatlas.org/about/download | ||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://www.proteinatlas.org/about/licence | ||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=Human%20Protein%20Atlas | ||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/biodbcore-000411 | ||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-01-24 | ||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |