データベースのレコード一覧 (件数: 2596)
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DART: Developmental and Reproductive Toxicology Database
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
生殖毒性試験に関する文献データを収載したデータベースです。
2019年よりDARTの内容はPubMed の “DART subset" として移行しました。
移行に関する情報は以下に掲載されていま...
運用終了
TOXLINE: Toxicology Literature Online
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
毒性に関する文献データを収載したデータベースです。
2019年よりTOXLINEの内容はPubMed の“Toxicology subset” として移行しました。
アーカイブ化されたデータの取得...
運用終了
CCRIS: Chemical Carcinogenesis Research Information System
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
8,000以上の化学物質の発がん性や変異原性、腫瘍プロモーション、助発ガン性などについての試験結果とその条件が集められています。一般的に受け入れられているプロトコルに従った研究からのデータが抽出されて...
運用終了
HSDB: Hazardous Substances Data Bank
運用機関:
National Library of Medicine
生物種:
説明:
5,000以上の潜在的危険有害化学物質の毒性に焦点を当てた毒性データファイルです。ヒト曝露値、産業衛生、緊急時の取扱手順、環境運命、法的要求事項やその他の関連事項情報などが収載されています。すべてのデ...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
All
説明:
農業生物資源ジーンバンクでは、遺伝資源に関する情報をデータベース化し、オンラインで公開しています。遺伝資源の配布を希望される方にもご利用いただくことができます。植物遺伝資源、動物遺伝資源、微生物遺伝資...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Embryophyta
説明:
日本植物病理学会編集の日本植物病名目録に記載された情報を、同学会の許可を得て転載したデータベースです。宿主の索引から検索することも可能です。
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 畜産草地研究所
生物種:
Viridiplantae
説明:
日本の草地生態系における生物群集の動態を調査したデータベースです。地域別、草地の種類別に植生データを検索できます。「草地の動態に関する研究」の第 I 期 (1972−1981年)で得られたデータを収録...
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 果樹茶業研究部門
生物種:
Malus pumila | Pyrus pyrifolia | Castanea crenata | Diospyros kaki | Vitaceae | ...
説明:
日本国内において育成された果樹とお茶の品種に関するデータベースです。りんご、なし、くり、かき、もも、ぶどう、あんず、すもも、うめ、かんきつ、茶について品種名、主要特性や写真、登録状況、栽培適地、苗の入...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Hexapoda
説明:
ELKUTypeは、九州大学農学研究院昆虫学教室所蔵のタイプ標本情報のデータベースです。タイプ(模式標本)は、新種等のタクソン(分類単位)が設立され、記載命名された時に用いられた標本で、その中の1個体...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Apis mellifera
説明:
日本産ハナバチ類画像データベース(HANABACHI)は、 日本産の全種のハナバチに関する、画像を含めた種情報のデータベースです。 各レコードには、科名、属名、種名、和名、分布、模式産地、模式標本の所...
運用機関:
九州大学 大学院農学研究院
生物種:
Encyrtidae
説明:
日本産トビコバチ類画像データベースTOBIKOBACHIは、立川哲三郎博士のコレクションに基づいた日本産トビコバチに関する、画像を含めた種情報のデータベースです。各レコードは、科名、属名、種名、和名、...
運用機関:
首都大学東京
生物種:
Adiantum capillus-veneris
説明:
ホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に2次情報を追加したデータベースです。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められていますが、陸上植物(種子、シ...
運用機関:
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
蛍光タンパク質などで可視化された植物オルガネラの動画や静止画像、オルガネラ研究の解析方法や関連リンク集を収集したデータベースです。
「Electron Micrograph Database」...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Acacia mangium | Arabidopsis thaliana | Cosmos bipinnatus | Dicksonia antarctica | Escherichia coli | ...
説明:
MassBaseは代謝産物(メタボライト）に関するマススペクトラルタグ（MST）のアーカイブです。主に植物の生体サンプルやその代謝産物から得られた生のクロマトグラムデータおよびクロマトグラムデータを解...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明:
健康食品に利用されている素材（成分）一覧から目的の素材名を選ぶと、素材の概要が表示されます。「すべての情報を表示」ボタンを押すと、構造式、分析法、有効性、安全性、総合評価、参考文献など詳細情報が得られ...
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 畜産草地研究所
生物種:
Embryophyta
説明:
全国の飼料畑等で問題となっている外来雑草に関するデータベースです。科名、種名、学名、葉の形状、種子の形状から検索でき、外来雑草の解説、群生写真、全体写真、種子の写真を確認できます。本データベースは「写...
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 動物衛生研究部門
生物種:
Viruses | Bacteria | Bos taurus | Sus scrofa | Galloanserae | ...
説明:
家畜伝染病と届出伝染病について、原因、疫学、臨床症状、病理学的変化、病原学的検査、抗体検査、予防・治療、発生情報、参考文献を調べることができます。
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 動物衛生研究部門
生物種:
Bos taurus | Sus scrofa | Gallus gallus
説明:
都道府県の家畜保健衛生所職員の方を対象に、病理診断に役立てていただくための病理画像を提供しています。現在は、1)牛病、2)豚病、3)鶏病、4)その他 の各疾病の病理画像と参考情報を提供しています。
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
理化学研究所・長田抗生物質研究室では、研究室内外で合成された化合物や、放線菌の二次代謝産物をはじめとする天然物の収集・保管、機器分析スペクトルなどをデータベース化し、これらを提供するシステムの構築を行...
運用機関:
Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
説明:
論文で報告された二次元ポリアクリルアミドゲル電気泳動イメージデータを蓄積している世界的なデータベースです。各マップにつき、ゲル実験情報、生物種、同定スポット数、同定タンパク質数、ゲルの写真と同定スポッ...
運用終了
WhoGA: Whole Genome Annotation
運用機関:
独立行政法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネゲノム研究プログラム(RPG)では、日本型イネ「日本晴」全塩基配列解析の配列 Build04 を利用し、全染色体のマニュアルアノテーションを行いました。WhoGA ではこれらアノテーション結果をゲ...
運用終了
VectorDB
運用機関:
Stanford University
生物種:
Eukaryota | Bacteria | Viruses
説明:
分子生物学分野で一般的に使用されている2,600以上のベクターの配列情報とアノテーションを収録しています。対象としているベクターの種類は、Pharge Vector、Plasmid Vector、Ph...
運用機関:
国立研究開発法人国立成育医療研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
琉球大学医学部医科遺伝学（遺伝医学）により作成された奇形症候群を中心とする遺伝性疾患の総合データベースです。「UR-DBMS」は、奇形症候群や染色体異常を中心とし、遺伝性疾患全般を含む遺伝性疾患総合デ...
運用機関:
国立研究開発法人科学技術振興機構
生物種:
Homo sapiens
説明:
日本熱帯医学会では熱帯医学分野の学術的研究成果を学術誌「Tropical Medicine and Health」にて発表、掲載しています。本誌は熱帯地を中心とした海外における医療、研究、教育のそれぞ...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
アミノ酸、ポリマー、農薬、医薬品など164種類の有機材料と、半導体、誘電体を含む18種類の無機材料について、テラヘルツ帯の透過スペクトルを掲載したデータベースです。カーボンナノチューブ、シリコンをはじ...
運用機関:
Stanford University
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Danio rerio
説明:
Wnt研究者に向けて、Wnt研究の最新情報、WntおよびWntシグナル経路上の遺伝子やタンパク質の分子情報、シグナルパスウエイマップ、研究方法など、Wntに関する有用な情報を提供しています。
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
本データベースはマウスの転写因子遺伝子とその関連遺伝子を収録したデータベースです。マウスゲノムの非冗長な転写因子遺伝子セットが提供されます。遺伝子名、Gene Ontology、InterPro、Re...
運用終了
SWISS-2DPAGE: SWISS-Two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis database
運用機関:
Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Arabidopsis thaliana | Dictyostelium discoideum | Escherichia coli | ...
説明:
様々な2D-PAGEやSDS-PAGEを用いて同定されたタンパク質のデータを収録しています。各エントリーには、タンパク質名、生物種、文献、電気泳動マップと該当スポット、UniProtKB/Swiss-...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Rattus norvegicus
説明:
理研バイオリソースセンターで管理しているラットの系統の一覧が表示されます。RBRC No.やタイプ、系統名、特徴、文献、提供者が記述されています。
運用終了
SABRE: Systematic consolidation of Arabidopsis and other Botanical REsource
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 筑波研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana | Thellungiella halophila | Nicotiana tabacum | Manihot esculenta | Populus nigra | ...
説明:
植物で最も解析が進んでいるシロイヌナズナの研究成果を集めたデータベース「TAIR」の遺伝子情報を軸（串）とし、研究グループで収集・保存・提供しているシロイヌナズナ、ヒメツリガネゴケ、ポプラ、タバコ培養...
運用終了
RPOPDB: RIKEN Populus Database
運用機関:
特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Populus
説明:
10種類のポプラとヨーロッパクロマツのゲノム情報を収録したデータベースです。mRNAは、GenBank/DDBJ/EMBLを情報源としています。理研で収集、アノテーションしたPopulus nigra...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 バイオリソース研究センター
生物種:
Manihot esculenta
説明:
理研バイオリソースセンターが提供する、キャッサバの完全長cDNAクローンのデータベース検索サイトです。リソース番号、NCBI番号、クローン名やBLASTによる検索が可能です。
オリジナルのサイトは運...
運用終了
SciNeS: Scientist's Networking System
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
説明:
理研サイネスは、セマンティックウェブに準拠したウェブシステムです。セキュリティで区切られた多数のバーチャルラボを同時並列的に内包できるクラウド型のウェブシステムで、理研の生命情報基盤研究部門で研究開発...
運用終了
RIKEN Mouse Genome Encyclopedia DNABook
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
6万以上のマウス完全長cDNAクローンを収録したDNAブックです。DNAブックとは、DNAを固相化して紙に固定し、書籍の形にする技術です。通常の宅配便などで多種類のDNAを印刷された情報とともに研究者...
運用終了
RIKEN Hub Database
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
説明:
理研には約400の研究室があり、それぞれが自発的に研究成果の発表を行っています。データ公開も様々な形式で行われ、現在約80のデータ提供サイトがWeb上で公開されています。このため、どこでどのようなデー...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana | Physcomitrella patens | Manihot esculenta | Populus | Nicotiana tabacum | ...
説明:
理研BRC実験植物開発室で提供しているシロイヌナズナを中心とした植物遺伝子材料のBLAST検索ができます。
オリジナルのサイトは運用終了しました。データは Exp-Plant Catalog （ht...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明:
理研バイオリソースセンターが生物遺伝材料として提供する微生物株を収録しています。様々な種の微生物について、株としての情報を特性や表現型情報も含めて提供しています。生物種名、来歴、培養培地などにより検索...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens | Rattus norvegicus | Mus musculus | Macaca fuscata | Pan troglodytes
説明:
理研・遺伝子材料開発室（旧DNA開発銀行）が収集した汎用宿主ベクター系とクローン化遺伝子を中心に、様々な研究機関、研究者から寄付・寄託された「動物および微生物のDNA」の収集・保存・提供を行うサイトで...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Cricetulus griseus | Mesocricetus auratus | ...
説明:
理研・細胞材料開発室が収集、培養し、提供する細胞株のデータベースです。従来の培養細胞株に加えて、ヒトのiPS細胞、胚性幹細胞（ES細胞）、体性幹細胞（臍帯血、間葉系幹細胞等）、マウスやウサギのiPS細...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
シロイヌナズナのアクティベーションタグラインは、理研バイオリソースセンター（BRC）または理研ゲノム科学総合研究センター植物ゲノム機能情報研究グループ植物変異探索研究チームにおいて、Dr. Walde...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
このデータベースは、約500のシロイヌナズナ形態的変異株についての形質とT-DNA挿入部位のゲノムDNA配列について記載されたものです。
アクティベーションタギング法によりシロイヌナズナの突然変異体...
運用終了
Rice Full-Length cDNA Encyclopedia DNABook
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネ完全長cDNA約3万2千個を収録したDNAブックです。農業生物資源研究所の所有する約3万2千個のイネcDNAをより一層有効活用する手段の1つとして、1冊の本の中にそれらの全cDNAを貼付けた書籍タ...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Mus musculus
説明:
理研ENU-based gene-driven mutagenesis system (RGDMS)は次世代版ジーンターゲッティングシステムとして一般に公開しています。新規変異マウス研究開発チームは、...
運用終了
RED II: Rice Expression Database II
運用機関:
国立研究開発法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネウィルストランスクリプトームプロジェクト（2007年～）において得られた、9種類のイネウイルスに感染させたイネの遺伝子発現データを収録したデータベースです。マイクロアレイは、Agilentカスタム...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Viruses
説明:
理研バイオリソースセンター遺伝子材料開発室で収集している組換えレトロウイルス、組換えアデノウイルス、DNAクローンのデータベースです。組換えアデノウイルスは、研究で実際に使用されたクローンならびに当開...
運用機関:
University College Cork
生物種:
説明:
Recodingとは、塩基配列を通常の規則に沿わないで読み取ることを指します。Recodingが起こることにより、セレノシステインが挿入されたり、停止コドンが無視されたりなどの現象が起こります。これら...
運用終了
RARTF: RIKEN Arabidopsis Transcription Factor database
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
PSI-BLAST検索により検出されたシロイヌナズナの全転写因子1,978件と転写因子ファミリーの情報を扱うデータベースです。完全長cDNA配列、Ds-tagged 変異体、ファミリー間のマルチプルシ...
運用終了
RAPID: RIKEN Arabidopsis Phenome Information Database
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
Arabidopsis thaliana
説明:
理研植物科学研究センターで作製したシロイヌナズナトランスポゾンタグラインのデータベースです。Line Codeをキーにした検索と、表現型を選択することによる検索が可能です。Line Codeの一覧も表...
運用終了
PRIMe - Standard Spectrum Search: Platform for RIKEN Metabolomics - Standard Spectrum Search
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所
生物種:
説明:
PRIMeプロジェクトで分析された標準化合物を検索するウェブアプリケーションです。Standard Spectrum Searchでは、PRIMeプロジェクトで測定されている標準化合物を化合物名または...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター
生物種:
説明:
標準化合物の2次元NMRスペクトルデータベースを対象として、ピーク値により検索するウェブアプリケーションです。独自の1Hおよび13Cのケミカルシフトデータベースに基づき、多数の代謝物とユーザーのNMR...
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）