レコード詳細
GEO: Gene Expression Omnibus
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | Gene Expression Omnibus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | National Center for Biotechnology Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | マイクロアレイや次世代シーケンサー、メチル化、その他、高スループット実験で得られた機能ゲノムデータを登録、公開、配布しているレポジトリサイトです。登録データの実験情報の記述内容はMIAME（Minimum Information About a Microarray Experiment)形式で統一されており、専門家によって精査されています。サンプル名や解析プラットフォーム名、生物種、実験内容等、各種キーワードで目的のデータを検索することができます。生データの配布も行っています。GEO DataSetsでは、データ投稿者が提供したレコード情報（サンプルやプラットフォーム情報等）とキュレートされたデータセットを提供しており、GEO ProfilesではGEO DataSetsから得られた遺伝子発現プロファイルを提供しています。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/download.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/datasets.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=Gene%20Expression%20Omnibus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/biodbcore-000441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-05-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |