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レコード詳細

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CistromeDB: Cistrome Data Browser

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02508
名称データベースの名称 CistromeDB
別称データベースの別称 Cistrome Data Browser
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://dc2.cistrome.org/#/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Cistrome Project
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 公開されているChIP-seqやDNase-seqのデータセットのポータルブラウザーです。生物種、文献の情報等データセットについて手動でキュレーションされた情報、各サンプルを均一なパイプラインで分析した結果、読み取りレベル、注釈レベルなど各データセットの品質管理情報と、これらのデータセットを分析、視覚化できる機能を提供しています。遺伝子名やヒストン修飾検出抗体などにより絞り込み、複数のデータについてWashU BrowserやUCSC Browserで表示することが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30462313
DOI:10.1093/nar/gky1094
PubMed ID:27789702
DOI:10.1093/nar/gkw983
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://dc2.cistrome.org/#/bdown
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 http://dc2.cistrome.org/#/bdown
データベースの使い方 http://dc2.cistrome.org/#/documents
データベースの連絡先 https://liulab-dfci.github.io/contact
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-03-17
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-03-17
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license