レコード詳細
MatrisomeDB
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02616 | ||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | MatrisomeDB | ||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://matrisomedb.org | ||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Koch Institute for Integrative Cancer Research at MIT, University of Illinois at Chicago | ||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 | ||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 細胞外マトリックス (ECM) に関するプロテオームデータを統合するデータベースです。 コラーゲン、ECM糖タンパク質、プロテオグリカンなどECMの主要物質や、生体サンプル（ヒト、マウス、異種移植）、組織や腫瘍の種類による絞り込みが可能です。結果は信頼スコアで色分けされたヒートマップ（横軸がタンパク質、縦軸が組織）で示され、ヒートマップ作成に使用された実験データをまとめてダウンロードすることもできます。検出されたペプチドの遺伝子、タンパク質情報や実験の生データへのリンクなども表形式で提供されています。 | ||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090) | ||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||||||
| データベースの使い方 | https://matrisomedb.org/tutorial/ | ||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | https://matrisomedb.org/about/ | ||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2022-04-28 | ||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2023-01-15 | ||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |