レコード詳細
LocDB: Protein Localization Database for Human and Arabidopsis
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01677 | ||||
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| 名称データベースの名称 | LocDB | ||||
| 別称データベースの別称 | Protein Localization Database for Human and Arabidopsis | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://www.rostlab.org/services/locDB/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | RostLab, Technische Universität München | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | ドイツ | ||||
| 説明データベースの説明 | LocDBはヒトとシロイヌナズナにおけるタンパク質の細胞内局在性についての実験によるアノテーションを収録したデータベースです。40%以上のエントリでは、既存の様々な細胞内局在の予測方法による結果も併せて示すことで、より良い新規の細胞内局在予測法を開発するプラットフォームとしても利用できます。生物種、タンパク質/遺伝子の名前、UniProt, Ensemble, TAIRなどのID、局在箇所名によるキーワード検索が可能です。ユーザが論文に発表したタンパク質の細胞内局在を登録することもできます。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606), Arabidopsis Thaliana (3702) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2017-10-16 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2017-10-16 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |