レコード詳細
休止
ViBE-Z: The Virtual Brain Explorer for Zebrafish
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02166 | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 名称データベースの名称 | ViBE-Z | ||||
| 別称データベースの別称 | The Virtual Brain Explorer for Zebrafish | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://vibez.informatik.uni-freiburg.de | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Life Imaging Center (LIC), University of Freiburg | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | ドイツ | ||||
| 説明データベースの説明 | 幼生ゼブラフィッシュの脳における仮想共局在研究のためのイメージングおよび画像解析フレームワークです。現在、72 hpf（受精後経過時間）、48 hpf、および 96 hpf の幼生が利用可能です。ViBE-Z は、正確に配置された遺伝子発現パターンのデータベース（1 μm^3 の分解能）、解剖学的アトラス、およびソフトウェアを含みます。このソフトウェアは、複数の共焦点顕微鏡画像スタックを融合し、これらのデータセットを標準的幼生に配置することで、高品質なデータセットを生成します。 データはHDF5フォーマットによるダウンロードが可能です。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Danio rerio (7955) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
||||
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
||||
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
|
||||
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.xypv6g | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||
| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
|
||||
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-09-29 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |