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piRBase

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02543
名称データベースの名称 piRBase
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://bigdata.ibp.ac.cn/piRBase/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 PIWI-interacting RNA (piRNA)の機能解析とアノテーションに関するデータベースです。生殖細胞に特異的なイベントに関与するPiwiタンパク質に結合するpiRNAを手動でキュレートし、配列、生物種、文献、ターゲットの情報を収録しています。piRNAやデータセットの検索が可能です。また、メチレーションのようなエピゲノミクスの情報やゲノムブラウザ、解析ツールも備えています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090), Rattus norvegicus (10116), Drosophila melanogaster (7227), Caenorhabditis elegans (6239), Danio rerio (7955), Gallus gallus (9031), Xenopus tropicalis (8364), Bos taurus (9913), Macaca fascicularis (9541), Macaca mulatta (9544), Callithrix jacchus (9483), Tupaia belangeri (37347), Drosophila erecta (722), Drosophila yakuba (7245), Drosophila virilis (7244), Oryctolagus cuniculus (9986), Bombyx mori (7091), Nematostella vectensis (45351)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30371818
DOI:10.1093/nar/gky1043
PubMed ID:25425034
DOI:10.1093/database/bau110
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://bigdata.ibp.ac.cn/piRBase/download.php
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 http://bigdata.ibp.ac.cn/piRBase/
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/biodbcore-001422/
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-09-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2024-05-09
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license