レコード詳細
休止
Integrative Disease Omics Database （iDOx DB）
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01508 |
|---|---|
| 名称データベースの名称 | Integrative Disease Omics Database （iDOx DB） |
| 別称データベースの別称 | ― |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://gemdbj.ncc.go.jp/omics/ |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 国立研究開発法人 国立がん研究センター |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 |
| 説明データベースの説明 | 多層的な疾患オミックス解析の統合データベースです。 (独)医薬基盤研究所の先駆的医薬品・医療機器研究発掘支援事業で採択された「多層的オミックス解析による創薬標的の網羅的探索を目指した研究」（平成22年度−26年度）において構築されました。 ６つの国立高度専門医療研究センター（ナショナルセンター）を中心とする研究体制の中で、正確に診断された適切な症例と豊富な臨床情報に基づく質の高い臨床検体を収集して実施した多層のオミックス解析データの一部を、患者さんの個人情報の保護に充分に配慮した上で公開しています（ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム解析）。 てんかん、肺がん、腎がん、乳がん、胃がん、肥満症、拡張型心筋症、大動脈瘤、非アルコール性脂肪性肝炎、アルツハイマー病、脊柱管狭窄症、アレルギー疾患、小児白血病の13疾患が対象です。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 日本語, 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://gemdbj.ncc.go.jp/omics/docs/others.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | ― |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2015-06-10 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2018-06-28 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |