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レコード詳細

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PED: Plant Editosome Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02490
名称データベースの名称 PED
別称データベースの別称 Plant Editosome Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://bigd.big.ac.cn/ped/home
運用機関名現在データベースを運用している機関名 National Genomics Data Center, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 植物のRNA編集因子（editosome）のデータベースです。文献やオルガネラゲノムアノテーションから手動で収集した情報に基づいて、RNA編集因子、ターゲットとなるオルガネラ遺伝子の編集機構、編集因子とターゲットとの相互作用、生物学的機能などを収集、公開しています。編集因子、遺伝子名、編集機構、生物種、器官、文献による絞り込みが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Viridiplantae (33090)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30364952
DOI:10.1093/nar/gky1026
PubMed ID:30365034
DOI:10.1093/nar/gky993
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://bigd.big.ac.cn/ped/browse/factors, http://bigd.big.ac.cn/ped/browse/genes, http://bigd.big.ac.cn/ped/browse/species
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 http://bigd.big.ac.cn/ped/home
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 https://bigd.big.ac.cn/ped/contact
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-01-21
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-01-21
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license