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PlantRNA

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02125
名称データベースの名称 PlantRNA
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://plantrna.ibmp.cnrs.fr/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Plant Molecular Biology Institute (IBMP)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 フランス
説明データベースの説明 完全にアノテーションを付された植物の核、プラスチドおよびミトコンドリアのゲノムから収集された tRNA 遺伝子配列を集約したデータベースです。各 tRNA 遺伝子について、線形二次構造ならびに生物学的情報を提供しています。これには、5'-および 3'-フランキング配列、A および B ボックス配列、転写開始およびポリ(T)転写終結ストレッチ領域、tRNA イントロン配列、アミノアシル tRNA 合成酵素および tRNA の成熟や修飾に関与する酵素が含まれます。また、核でコードされた tRNA のミトコンドリアへの導入に関するデータ、ならびにそれぞれの tRNA および tRNA 結合タンパク質の詳細情報も含まれます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Arabidopsis thaliana (3702), Brachypodium distachyon (15368), Chlamydomonas reinhardtii (3055), Cyanophora paradoxa (2762), Ectocarpus siliculosus (2880), Medicago truncatula (3880), Oryza sativa (4530), Ostreococcus tauri (70448), Phaeodactylum tricornutum (2850), Physcomitrella patens (3218), Populus trichocarpa (3694), Solanum tuberosum (4113)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:21443625
DOI:-
PubMed ID:23066098
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.fy2ebk
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-07-09
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license