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EDK: Editome disease knowledgebase

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02468
名称データベースの名称 EDK
別称データベースの別称 Editome disease knowledgebase
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://bigd.big.ac.cn/edk/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 National Genomics Data Center, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 RNA編集と疾患の関連についてのデータベースです。mRNA、miRNA、lncRNA、ウイルスのRNA上でおこる実験的に検証された異常な編集イベントと疾患との関係や、RNA編集酵素に関連する異常な活動と疾患との関係が整理されています。疾患、編集されたRNA、ウィルス、酵素、編集部位、文献を選んで、各リストからのブラウズが可能です。また異常RNA編集遺伝子をIngenuity Pathway Analysis (IPA) 解析に基づき3つのパスウェイに集約して示した図から、RNAを探索することもできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606), Viruses (10239)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30357418
DOI:10.1093/nar/gky958
PubMed ID:29036542
DOI:10.1093/nar/gkx897
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先 https://bigd.big.ac.cn/edk/contact
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-10-09
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-01-12
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license