レコード詳細
運用終了
International HapMap Project (国際HapMap計画)
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00509 |
|---|---|
| 名称データベースの名称 | International HapMap Project (国際HapMap計画) |
| 別称データベースの別称 | ― |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/index.html.ja |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | National Center for Biotechnology Information |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 |
| 説明データベースの説明 | 国際 HapMap 計画は、ヒトにおける遺伝的多型パターンを明らかにし、病気や薬に対する反応性に関わる遺伝子を発見するための基盤を整備するプロジェクトです。この計画は、カナダ、中国、日本、ナイジェリア、英国、米国の科学者と各国政府、財団などの協力により行われています。 「Generic Genome Browser」では、プロジェクトのデータを閲覧することができます。染色体上のある領域について、遺伝子型およびアレル頻度のデータや、それ以外のゲノム情報を同時にみることができます。 染色体の１つをまるごとブラウズすることもできます。 「データ全体のダウンロード」では、現在公開されている遺伝子型のデータ、SNPリスト、連鎖不平衡に関する数値、各SNPのアレル頻度と遺伝子型頻度、タイピング詳細情報、サンプル詳細情報などを取得することができます。遺伝子型データを取得するにはID登録が必要です。 NCBIによるオリジナルサイト （http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/index.html.ja） の運用は終了しました。HapMap Projectのアーカイブデータは引き続きFTPサイト （ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/hapmap/） からダウンロードできます。 また、運用終了の経緯と今後の情報がこちらのページ （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/news/NCBI_retiring_HapMap/） に記載されています。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 日本語, 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/downloads/index.html.en |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/genotypes/00README.txt, http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/downloads/ld_data/2005-10/00README.TXT, http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/downloads/samples_individuals/00README.txt, http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/downloads/xml_docs/ |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/guidelines_hapmap_data.html.en |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | ― |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2018-07-16 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |