データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
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生物種
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その他
運用機関:
International Mycological Association (IMA), U.S. National Library of Medicine
生物種:
Fungi
説明:
新たな菌学上の名称を関連情報と組み合わせをて文書化したオンラインデータベースです。新規の名称、報告文献、系統分類、サンプル情報などを収録しています。種名、文献などの情報から検索が可能です。
運用機関:
Institute of Bioinformatics
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトタンパク質データの共有･統合のためのコミュニティポータルです。翻訳後修飾、タンパク質ータンパク質相互作用、組織ごとの発現、細胞株での発現、酵素ー基質作用などの情報を免疫蛍光発現、MS/MS Spe...
運用機関:
Higher Institute of Applied Biological Sciences of Tunis (ISSBAT), Laval University
生物種:
Bacteria
説明:
グラム陽性細菌およびグラム陰性細菌の双方により産生されるバクテリオシンの物理化学的特性（計算値または予測値）のデータベースです。生物種、文献、構造データ、物理化学的情報が収録されています。一般的情報、...
運用終了
Streptococcus agalactiae NEM316 / Serotype III genome database: SagaList
運用機関:
生物種:
説明:
食品媒介病原菌であるストレプトコッカス・アガラクティエ（Streptococcus agalactiae）のゲノム解析専用のデータベースです。Streptococcus agalactiae NEM3...
運用終了
Photorhabdus luminescens genome database: PhotoList
運用機関:
生物種:
説明:
Photorhabdus luminescens のゲノム解析データベースです。線虫に内部共生し、昆虫に病原性を示すPhotorhabdus luminescensのゲノムについて、遺伝子名、塩基長、...
運用終了
Mycoplasma pulmonis genome database: MypuList
運用機関:
生物種:
説明:
マウスの呼吸器マイコプラズマの病原菌である肺マイコプラズマ（M. pulmonis）のゲノム情報を、様々な面から関連づけ、統合することを目的としています。肺マイコプラズマ UAB CTIP 株から抽出...
運用終了
Listeria innocua and Listeria monocytogenes genomes database: ListiList
運用機関:
生物種:
説明:
食品媒介性病原菌であるリステリア菌、およびその非病原性近縁種であるリステリア・イノキュアのゲノムの解析に特化したデータベースです。細菌-宿主の相互作用を起こす典型であるリステリア菌（L. monocy...
運用終了
Legionella pneumophila genome database: LegioList
運用機関:
生物種:
説明:
レジオネラ・ニューモフィラ（Legionella pneumophila）の Paris 株 （フランスの固有種）、Lens 株（流行株）、Phildelphia 1 株、Corby 株のゲノム分析専...
運用終了
Colibri
運用機関:
生物種:
説明:
グラム陰性細菌の典型である大腸菌（E. coli）のゲノム情報を様々な面から関連づけ、統合することを目的としたリソースです。典型株 K-12 から抽出された DNA とタンパク質の完全な配列データセッ...
運用終了
Buruli ulcer bacillus Database: BuruList
運用機関:
生物種:
説明:
マイコバクテリウム・ウルセランス菌、ブルーリ潰瘍桿菌のゲノム解析を専門とするデータベースです。流行株 Agy99 から抽出された DNA とタンパク質の完全な配列データセットを関連するアノテーションお...
運用機関:
Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (INSERM)
生物種:
Viruses
説明:
VirHostNet 2.0は広範囲におよぶ原著の文献をキュレートし、公開されたデータで補完したウイルス/ウイルス間およびウイルス/ホスト間のタンパク質間相互作用のデータセットを統合するデータベースで...
運用機関:
Indian Institute of Science
生物種:
All
説明:
非冗長（25％および90％）データセットに存在するアミノ酸残基の立体配座角（主鎖および側鎖）に関する情報の検索を容易にするために開発された包括的でタイムリーな、権威あるリソースです。
運用機関:
University of Tampere
生物種:
Homo sapiens
説明:
疾患の原因となるタンパク質キナーゼドメイン上の変異を収録した包括的なレジストリです。本リソースは、突然変異に関する統計情報および表示、突然変異を有する配列（クリック可能）、および制限酵素パターンの変化...
運用終了
The Gene Index Project: TIGR_TGI
運用機関:
Harvard University, Dana-Farber Cancer Institute
生物種:
All
説明:
入手可能な EST および遺伝子配列を、可能な限り参照ゲノムと一緒に使用することで、可能性のある遺伝子およびそのバリアントのインベントリを提供し、あわせてこれらの遺伝子によって果たされる機能的役割およ...
休止
STING
運用機関:
Computational Biology Research Group , Embrapa/Informatica Agropecuaria
生物種:
All
説明:
タンパク質と他の生体巨大分子との相互作用に関する情報を収録したデータベースです。ブラジルの農業、家畜および医学が直面する課題の研究を支援することを主な目的として、これらの相互作用の分析に使用される構造...
運用機関:
Human Genome Organisation (HUGO), Transforming Genetic Medicine Initiative
生物種:
Homo sapiens
説明:
HGNCデータベースは、HGNC (HUGO Gene Nomenclature Comittee) が既知のヒトの遺伝子ごとに承認した全ての遺伝子名と短縮名（シンボル）を収録しています。HGNC承認...
運用機関:
Bioversity International
生物種:
Oryza
説明:
Genoplante プロジェクトによるイネ挿入変異株ライブラリーの評価から得られた表現型データを統合した検索可能なデータベースです。変異名、対応遺伝子、発現レベル、発現部位、観察方法などを収録してい...
運用機関:
International Cooperation Center for Agricultural Research for Development (CIRAD), Bioversity International, Generation Challenge Programme, South Green
生物種:
Viridiplantae
説明:
主要な植物門の進化に関する 37 種の完全ゲノムを含むデータベースです。位相同型の植物ファミリーを、広範かつ一貫した形で定義するため、これらのゲノムのクラスタリングを行いアノテーションしています。クラ...
運用機関:
Cincinnati Children's Hospital Medical Center
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒトの一塩基多型（SNP）とそのアノテーションをまとめた統合的データベースです。mRNA、タンパク質、遺伝子のNCBIリンク、CDD、パスウェイ情報などを収録しています。
運用機関:
Cincinnati Children's Hospital Medical Center, National Institute of Health
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus
説明:
ヒトおよびマウス遺伝子のオーソログセットを系統的に分析することによって得られたシスエレメント領域のデータベースです。NCBI の参照配列（RefSeq）データベースにおけるマウスおよびヒト遺伝子の m...
運用機関:
Centro Biotecnologie Avanzate
生物種:
Bacteria | Bacteriophage sp. | Fungi | Saccharomyces
説明:
ヨーロッパのさまざまな生物種、遺伝的資料、およびその他の生物学的なカタログデータベースへリンクする統合リソースセンターです。これにより、世界中のユーザーは １つの共通の入り口からの検索で、関連する複数...
運用機関:
Center for Bioinformatics (CBI), Peking University
生物種:
Viridiplantae
説明:
植物転写因子（TF）、調節因子およびそれらの間の相互作用に関する包括的で高品質なリソースを提供するデータベースです。GO、機能的記述、結合モチーフ、シスエレメント、調節、オーソロガスなグループ、系統樹...
運用機関:
Bonsai Bioinformatics
生物種:
All
説明:
非リボゾームペプチドのデータベースと解析ツールを含むプラットフォームです。ペプチドの種類、活性、分子式、重量などを収録しています。
運用機関:
BindingDB
生物種:
Pan paniscus | Pan troglodytes | Rattus norvegicus | Sus scrofa | Teleostei | ...
説明:
薬物ターゲットと薬物様小分子との相互作用に焦点を当てた、測定による結合親和性についての公共オンラインデータベースです。ターゲットと生物種、リガンド、ターゲットとリガンドの化学的性質、文献などの情報を収...
運用機関:
Beijing Genomics Institute (BGI)
生物種:
Influenza virus
説明:
BGI が作成したインフルエンザAウイルスの完全なゲノム配列の他、その他すべての公開されたインフルエンザウイルス配列を専門家のアノテーションを付した上で収録したデータベースです。ウイルスゲノム、遺伝子...
運用機関:
ATCC Standards Development Organisation
生物種:
All
説明:
微生物および細胞株の真正性を確認し、科学コミュニティのため培養体の長期保存と分配を管理するためのデータベースです。ATCC は、入手した培養体についてサポートを提供するとともに、専門家の技術的サポート...
運用機関:
Arizona State University, National Institute of Health
生物種:
Archaea | Bacteria | Eukaryota | Viruses
説明:
プラスミドのクローンおよびコレクションのリポジトリです。「PSI: Biology Material Repository」(PSI:Biology-MR) や個人研究者が作成した大小のコレクションか...
運用機関:
California Academy of Sciences
生物種:
Formicidae
説明:
アリの既知の種を文書化したウェブサイトです。各々の種についてのレコードは、地理的分布や生活史に関連づけられており、写真も含まれています。
運用機関:
Nottingham Arabidopsis Stock Centre (NASC)
生物種:
Arabidopsis thaliana | Brassica
説明:
国際シロイヌナズナゲノムプログラム（International Arabidopsis Genome Programme）および、より広範な研究コミュニティに種子と情報資源を提供するデータベースです。...
運用機関:
Laboratory of Bioinformatics, Faculty of Biology, Adam Mickiewicz University
生物種:
All
説明:
動物、植物、ウィルスのマイクロRNAに関する統合データベースです。
外部DBや文献からのデータだけではなく、オリジナルのコンピュータ予測（新規miRNA、ターゲット、mirtron、miRNA遺伝子...
運用機関:
Australian Centre For Plant Functional Genomics (ACPFG)
生物種:
Brassica | Hordeum vulgare | Oryza sativa | Triticum
説明:
SNP 探索ソフトウェア autoSNP をリレーショナルデータベース内に実装し、同定された多型の効率的なデータマイニングとデータの詳細な照会を可能にしたデータベースです。コンティグのEST配列、SN...
運用機関:
EuroCarbDB, Justus Liebig Universitat Giesen, Justus-Liebig University Giessen
生物種:
All
説明:
炭水化物の構成要素である単一の残基（単糖類）のデータベースです。さまざまな種類の残基データ、特に記述法に関する情報を提供します。
運用機関:
生物種:
All
説明:
検証済みの遺伝子やタンパク質の発現、細胞型に関連する表現型や画像をマッピングするツールです。各細胞のタイプやクラス、シノニム、発現遺伝子、および各用語のデータにより、細胞型の特性決定および比較が可能と...
運用機関:
American Society for Cell Biology (ASCB)
生物種:
All
説明:
細胞の画像、動画、およびアニメーションを集めた公共データベースです。簡単にアクセスでき、多様な生物、細胞型、細胞プロセスをカバーしています。細胞プロセス、構成要素、細胞のタイプ、生物種から検索できます...
運用機関:
CERM, University of Florence, Florence
生物種:
All
説明:
生体高分子の３次元構造から得られた金属結合部位に関するデータベースです。タンパク質および核酸中の金属結合部位を、最小機能部位（MFS）を介して、系統的かつ自動的に表示します。MFS は、金属の周囲の局...
運用機関:
慶應義塾大学 医学部 臨床遺伝学センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
日本人の生殖細胞系列の病的変異（バリアント）の情報を提供するデータベースです。主に難病希少疾患領域における病的変異の情報を、論文からのキュレーションや既存のデータベースから収録しています。変異、疾患、...
運用機関:
国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
Homo sapiens
説明:
核酸医薬の開発支援のための、ヒトと実験動物（霊長類）のRNAデータを網羅するデータベース（2019年3月現在テスト版）です。RefSeq、Gencode、FANTOM5のデータから作成されたヒトのゲノ...
運用機関:
日本環境変異原学会
生物種:
Homo sapiens | Bacteria | Salmonella Typhimurium | Escherichia coli | Drosophila | ...
説明:
天然物を含め、食品や食品添加物、医薬品や医療用品、農薬などのほか、それらの材料として使用されてきた既存の工業用化学物質に対して国内外で行われた変異原性試験の結果を収集したデータベースです。化合物の一般...
運用機関:
難病プラットフォーム
生物種:
Homo sapiens
説明:
日本医療研究開発機構（AMED）の「難治性疾患実用化研究事業」および厚生労働省が所管する「難治性疾患政策研究事業」で行われている難病を対象としたレジストリ研究の共通基盤を提供するサイトです。各研究班か...
運用機関:
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明:
医薬基盤・健康・栄養研究所が公開している16のデータベース（生物資源および研究データ）を横断的に検索できるシステムです。キーワードを入力し、対象のデータベースを選択した検索の他、薬剤・化合物、疾患、遺...
運用機関:
東京大学医学部附属病院
生物種:
Homo sapiens
説明:
東京大学医学部附属病院脳神経外科で開発された健常成人（アジア人男性）の頭部解剖構造の3次元コンピュータグラフィックス（ポリゴンモデル）です。検体データを基礎とし、複数の教科書や医師の知見に基づき作成さ...
運用機関:
Neotoma Leadership Council
生物種:
Spermatophyta | Vertebrata | Bacillariophyta | Ostracoda | Insecta | ...
説明:
コミュニティベースの古生態学データベースです。約500万年前からの花粉、哺乳類、珪藻、貝形虫などの化石のデータおよび地質学データを含みます。ユーザーはCC BY 4.0の利用条件の下でデータを自由に利...
運用機関:
国立科学博物館
生物種:
Tracheophyta
説明:
日本の絶滅危惧維管束植物（環境省 2012）について、周辺地域となる中国、韓国、台湾、ロシア東部における分布と状態（絶滅危惧あるいは非絶滅危惧）を、各国および各地域のレッドリストをもとに作成し公開して...
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター, TEC group
生物種:
Escherichia coli
説明:
大腸菌の全シグマ因子・転写因子とその制御標的遺伝子セットを格納したデータベースです。新規に開発したGonomic SELEX法により、全シグマ因子・転写因子の認識配列を同定しています。転写因子を指定し...
運用機関:
東京大学, 国立研究開発法人 森林研究・整備機構, 地方独立行政法人 北海道立総合研究機構, 明治大学
生物種:
Abies sachalinensis
説明:
トドマツのトランスクリプトームデータベースです。網羅的に収集された、トドマツの主要な器官（雄花、雌花、新葉、内樹皮）で働く遺伝子の発現と塩基配列情報およびアノテーションを提供しています。キーワード検索...
運用機関:
東邦大学 理学部 生物分子科学科
生物種:
Homo sapiens
説明:
核内受容体constitutive androstane receptor（CAR）のヒトゲノム内の結合部位配列および結合部位内のrSNPs (regulatory SNPs) の情報を提供するサイト...
運用機関:
東邦大学 理学部 生物分子科学科
生物種:
Homo sapiens
説明:
核内ホルモン受容体スーパーファミリーで転写因子として働く retinoid X receptor (RXR) のヒトゲノム内の結合部位配列および結合部位内のrSNPs (regulatory SNPs...
運用機関:
大阪府立大学大学院 生命環境科学研究科 緑地環境科学専攻
生物種:
Aves
説明:
大阪府立大学とその隣にあるにさんざい古墳で観察された野鳥約40種を紹介しています。種名・科名・および風景の写真から検索ができます。
運用機関:
大阪府立大学大学院 生命環境科学研究科 緑地環境科学専攻
生物種:
Embryophyta
説明:
大阪府立大学キャンパスおよび森林、公園、緑化現場などで出現した樹木の実生画像約170種を紹介しています。
運用機関:
大阪府立大学大学院 生命環境科学研究科 緑地環境科学専攻
生物種:
Embryophyta
説明:
大阪府立大学のキャンパスに生育する200種以上の樹木を紹介しています。種名・科名・花やたねおよび風景の写真から樹木の検索ができます。
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）