レコード詳細
MetalPDB
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01691 | ||||
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| 名称データベースの名称 | MetalPDB | ||||
| 別称データベースの別称 | ― | ||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://metalpdb.cerm.unifi.it/ | ||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | CERM, University of Florence, Florence | ||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | イタリア | ||||
| 説明データベースの説明 | 生体高分子の３次元構造から得られた金属結合部位に関するデータベースです。タンパク質および核酸中の金属結合部位を、最小機能部位（MFS）を介して、系統的かつ自動的に表示します。MFS は、金属の周囲の局所環境を、その部位を含むより大きな高分子構造には関係なく記述する 3 次元テンプレートであり、等構造部位（広義に、同様の構造の対応する位置に見られる部位）と、等価部位（同一の金属を含む等構造部位）に分類されます。ユーザーは、金属 - 高分子相互作用の類似性と変動を容易に分析し、その分析を機能的な情報へとつなげることができます。 | ||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | All (1) | ||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||
| データベースの使い方 | ― | ||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― | ||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.g646hq | ||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース |
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| レコード管理者レコード管理者 | See the corresponding part in the FAIRsharing record | ||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2019-03-28 | ||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2024-07-22 | ||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |