レコード詳細
MetaboBank
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC02623 |
|---|---|
| 名称データベースの名称 | MetaboBank |
| 別称データベースの別称 | ― |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://www.ddbj.nig.ac.jp/metabobank/index.html |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 |
| 説明データベースの説明 | メタボロミクスデータの登録を受付ける公共リポジトリです。 質量分析、NMR、もしくは質量分析イメージングによって得られたデータファイルやメタデータを収録しています。GC-MS、LC-MS、LC-PDAなどの分析方法、データファイルの形式、生物種による絞り込みが可能です。メタデータは一般的な機能ゲノミクスDB（GEA や EBI のArrayExpress）やプロテオミクスDB（SDRF-Proteomics）と共通する MAGE-TAB 形式です。また EBI のメタボロミクスDB MetaboLights の ISA-TAB とも互換性があります。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | ― |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://ddbj.nig.ac.jp/public/metabobank/project/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://www.ddbj.nig.ac.jp/policies.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | https://www.ddbj.nig.ac.jp/metabobank/contact.html |
| API / SPARQL endpoint | https://www.ddbj.nig.ac.jp/metabobank/index.html |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2022-09-14 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2023-02-20 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |