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Metabolonote

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01324
名称データベースの名称 Metabolonote
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://metabolonote.kazusa.or.jp/Main_Page_ja
運用機関名現在データベースを運用している機関名 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 メタボロミクス実験の詳細な実験手法に関する情報 (メタデータ)のみを専門的に取り扱うデータベースです。セマンティックMediaWikiを利用したシステムにより、ユーザー登録(無料)をすることでだれでも気軽に各自のメタデータを記録・編集することができます。 メタデータを実際のデータ (生データファイルや、ピークアノテーション情報、ピークのスペクトル情報など)と切り離して管理することにより、1)実験後すぐに、さらには実験前であっても、メタデータを記載することができるため、実験設定の詳細を忘れてしまう前に記録に留めておくことができます。また、2)一度記録したメタデータは、論文や実際のデータを管理するその他のデータベースから共通して参照できるというメリットがあります。 Metabolonoteのコアシステムは公開されているため、ユーザー独自のMetabolonoteをLIMSや公開サイトとして構築できるほか、フォーマットを独自に定義することで、メタボロミクス以外のデータ管理についても使用することが可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID All (1)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:25905099
DOI:10.3389/fbioe.2015.00038
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語, 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方 http://metabolonote.kazusa.or.jp/Help:Contents/ja
データベースの連絡先 http://metabolonote.kazusa.or.jp/Help:ContactInfo
API / SPARQL endpoint http://metabolonote.kazusa.or.jp/Help:Use_Data_From_External_System/ja
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/metabolonote/desc.html
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2013-07-22
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2024-05-16
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license