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MONDO: Mondo Disease Ontology

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02563
名称データベースの名称 MONDO
別称データベースの別称 Mondo Disease Ontology
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://mondo.monarchinitiative.org/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Monarch Initiative
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 Global
説明データベースの説明 疾病の定義を統合して構築したオントロジーです。疾病を定義しデータモデルを収録している多くのデータベース(HPO、OMIM、SNOMED CT、ICD、PhenoDB、MedDRA、MedGen、ORDO、DO、GARDなど)から情報を収集しています。開発当初は半自動で構築されていましたが、広範囲に渡り手動でキュレーションされるようになってきています。疾病の個々の症状、特徴の説明はHPOに準拠しており、疾病は階層構造で表示できます。OWL形式を利用したmondo-with-equivalent、obo、jsonの3つのフォーマットで利用可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31701156
DOI:10.1093/nar/gkz997
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://mondo.monarchinitiative.org/pages/download/
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://mondo.monarchinitiative.org
データベースの使い方
データベースの連絡先 https://mondo.monarchinitiative.org
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/FAIRsharing.b2979t
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2021-03-10
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-03-10
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license