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LncACTdb 3.0

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02534
名称データベースの名称 LncACTdb 3.0
別称データベースの別称 ―
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 中国
説明データベースの説明 ceRNAs (competing endogenous RNAs) の相互作用のデータベースです。手動でキュレート、もしくは予測されたceRNAsについて、ceRNAとなるRNAと、これらと結合するmiRNAの情報、由来生物種や組織・細胞株の情報、関連形質・疾患、実験方法、参考文献、機能に関する情報を収録しています。ceRNAsとしては、内因的に生成された分子（lncRNA、環状RNA、コード遺伝子、偽遺伝子を含む）および外因的に導入された分子（ウイルスRNA、人工的に操作されたRNAを含む）を含んでいます。予測されたceRNAと実験的に同定されたceRNAに分けて検索、ブラウズが可能です。また、疾患、バイオマーカーに絞り込んだ検索も可能です。ブラウズではceRNAのタイプや、ceRNA、miRNA、生物種、形質・疾患を選んでデータを絞ることができます。また、BLAST検索もできます。ユーザがRNA情報を入力して機能を閲覧したり、生存性解析、ceRNAネットワーク表示を行うツールや、発現プロファイルを入力して機能的なceRNAを探すツールなどの解析ツールも多数用意されています。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID all (1)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30476305
DOI:10.1093/nar/gky1144
PubMed ID:25800746
DOI:10.1093/nar/gkv233
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/Lncact_down.jsp
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/lncact_help.jsp
データベースの連絡先 http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/lncact_help.jsp
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-06-09
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2021-08-10
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license