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HumanNet: Human gene networks for disease research

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02533
名称データベースの名称 HumanNet
別称データベースの別称 Human gene networks for disease research
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://www.inetbio.org/humannet/
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Network Biomedicine Lab, Yonsei University, Marcotte Lab, University of Texas at Austin
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 大韓民国, アメリカ合衆国
説明データベースの説明 HumanNetはヒト遺伝子ネットワークのためのデータベースです。さまざまなタイプのオミクスデータを統合し、独自のネットワーク推論アルゴリズムによって遺伝子と疾患の関係を提供しています。ユーザーは特定の疾患に関連する遺伝子を予測し、整理することができます。 HumanNet v2は階層的なヒト遺伝子ネットワークで構成されており、文献に依存するバイアスを最小限とし、疾患に関連する遺伝子セットのランク付けをすることができます。 統合されたネットワーク、コンポーネントネットワーク、およびヒト以外の生物に由来するタンパク質間相互作用ネットワーク(インターログ)をダウンロードできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30418591
DOI:10.1093/nar/gky1126
PubMed ID:21536720
DOI:10.1101/gr.118992.110
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://www.inetbio.org/humannet/download.php
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://www.inetbio.org/humannet/about.php
データベースの使い方 https://www.inetbio.org/humannet/tutorial.php
データベースの連絡先 https://www.inetbio.org/humannet/about.php
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-06-09
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-06-09
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license