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レコード詳細

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CADD: Combined Annotation-Dependent Depletion

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02530
名称データベースの名称 CADD
別称データベースの別称 Combined Annotation-Dependent Depletion
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://cadd.gs.washington.edu
運用機関名現在データベースを運用している機関名 University of Washington
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 ヒトゲノムの一塩基バリエーションおよび挿入／欠損による有害性をスコア化するCombined Annotation-Dependent Depletion (CADD)のためのサイトです。CADDはバリアントに様々なアノテーションを統合して客観的な重み付けをします。染色体位置と使用するリファレンスを指定すると、スコアと、変異塩基、転写に関するアノテーションタイプ（コード、ノンコード、モチーフなど）、GC率、CpG、GeneIDなどが一覧で表示されます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:30371827
DOI:10.1093/nar/gky1016
PubMed ID:24487276
DOI:10.1038/ng.2892
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://cadd.gs.washington.edu/download
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://cadd.gs.washington.edu/download
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 https://cadd.gs.washington.edu/contact
API / SPARQL endpoint https://cadd.gs.washington.edu/api
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク ―
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2020-05-12
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-05-12
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license