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The Improved Database Of Chimeric Transcripts and RNA-Seq Data: ChiTaRS

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC01940
名称データベースの名称 The Improved Database Of Chimeric Transcripts and RNA-Seq Data
別称データベースの別称 ChiTaRS
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://chitars.md.biu.ac.il/
運用機関名現在データベースを運用している機関名
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 イスラエル, スペイン
説明データベースの説明 キメラ転写物とRNAシークエンシングデータのデータベースです。ヒト、マウス、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、ウシ、ラット、ブタおよび酵母におけるキメラ転写物と、ヒトがんにおける染色体切断点を収録しています。実験データのエビデンスの拡張と、RT-PCR、qPCR、RNA シークエンシングおよびペプチド質量分析によって実験的に確認された同一遺伝子からのセンス-アンチセンスキメラ転写物データが付加されています。さらに各キメラデータに、予測されるChimeric Protein-Protein Interaction (ChiPPI) networkが追加され、親タンパク質及び融合タンパク質の相互作用パートナーの可視化が可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Bos taurus (9913), Danio rerio (7955), Drosophila melanogaster (7227), Homo sapiens (9606), Mus musculus (10090), Rattus norvegicus (10116), Saccharomyces cerevisiae (4932), Sus scrofa (9823)
タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:23143107
DOI:-
PubMed ID:25414346
DOI:-
PubMed ID:27899596
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 休止
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク ―
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ―
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ―
データベースの使い方 ―
データベースの連絡先 ―
API / SPARQL endpoint ―
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク ―
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク ―
統合TVへのリンク統合TVへのリンク ―
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.gg60g3
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 See the corresponding part in the FAIRsharing record
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2019-03-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2020-07-09
本レコードの利用条件 Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license