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CSDB: Carbohydrate Structure Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00840
名称データベースの名称 CSDB
別称データベースの別称 Carbohydrate Structure Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://csdb.glycoscience.ru
運用機関名現在データベースを運用している機関名 Russian Academy of Sciences
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 ロシア連邦
説明データベースの説明 マニュアルキュレートされた天然糖類のデータベースです。原核生物、植物、菌類、数種の原生生物のグルカン、グライコポリマーについて、糖鎖構造、文献、分類、NMRデータ、関連情報を提供しています。微生物については報告された糖鎖構造の約90%を網羅しています。2017年時点で、~7,000の文献で報告された~9,000の生物種に由来する~19,000の構造と~8,000のNMRスペクトル情報を保持しています。サイトでは他にもGlycosyltransferase databaseや1D and 2D NMRシミュレーション、NMRをベースとした自動構造解析、糖質をベースとした生物分類、生物分類に対する構造フラグメントの分布などの様々なサービスが提供されています。全てのデータはRDFで出力することができます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Bacteria (2), Archaea (2157), Viridiplantae (33090), Fungi (4751)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:29786940
DOI:-
PubMed ID:26337239
DOI:-
PubMed ID:24680503
DOI:-
PubMed ID:21155523
DOI:-
PubMed ID:26087011
DOI:-
PubMed ID:27227420
DOI:-
PubMed ID:29092007
DOI:-
PubMed ID:28011601
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/biodbcore-000187
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2023-06-01
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license