データベースのレコード一覧 (件数: 2594)
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運用機関:
Bird Studies Canada
生物種:
Aves
説明:
全世界に生息する鳥に関するデータベース。鳥の分布、分類、同義語、各言語での名称表記法（日本語もある）等を見ることができ、分布は世界地図（画像）で見ることができます。鳥の調査のために世界各地を訪れた際の...
運用機関:
The National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
生物種:
Anopheles gambiae | Aedes aegypti
説明:
ガンビエハマダラカ、ネッタイシマカなどのマラリアを媒介する蚊の種名情報やゲノム情報のデータベースです。
運用機関:
American Museum of Natural History
生物種:
Amphibia
説明:
世界に生息する両性類の種のデータベース。階層化された両生類の生物学上の分類が表示され、各分類（網:class、目:order、科:family、亜科:subfamily、属:genus、種:speci...
運用機関:
Johns Hopkins University
生物種:
Homo sapiens
説明:
ヒト血漿タンパク質とそのisoformの包括的リソースです。Isoform特異的発現、関連する疾患、局在、翻訳後修飾、一塩基多型の情報が収集されています。このデータベースで提供される情報は、徹底的な文...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens | Canis lupus familiaris | Macaca mulatta | Pan troglodytes | Mus musculus | ...
説明:
大規模なゲノム構造変異（挿入、欠失、転座、逆位など）に関する情報を収録しています。
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
クロマチン修飾（ヒストン修飾、DNAメチル化、DNA分解酵素フットプリント法）のゲノム網羅的研究結果を収録しています。一研究につき、サンプル情報、アッセイの種類、データソース、文献情報が登録されており...
運用機関:
Weizmann Institute of Science
生物種:
Homo sapiens
説明:
オーソロジー、疾患関連、SNPs、遺伝子発現、遺伝子機能はもちろん、広範囲に存在するゲノミクス、プロテオミクス、トランスクリプトミクス情報を効率よく検索できるようにしたヒトゲノム情報のデータベースです...
運用機関:
Swiss Institute of Bioinformatics
生物種:
説明:
タンパク質のファミリーやドメインに関するデータベースで、主にUniProtKB/Swiss-Protエントリーのドメイン機能のアノテーションに使用されています。現在、1,000以上のファミリーやドメイ...
運用機関:
東北大学 加齢医学研究所
生物種:
Mus musculus | Rattus norvegicus | Cavia porcellus | Canis lupus familiaris | Oryctolagus cuniculus | ...
説明:
この一覧表は、全国の研究者にアンケートを送って移植腫瘍の情報を収集し、まとめたものです。1,002株の情報が収められています。
運用機関:
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 作物研究所
生物種:
Glycine max
説明:
二次元電気泳動および電気泳動を介さない方法によるダイズのプロテオーム解析の結果を主に収録しているデータベースです。ダイズの各器官に存在するタンパク質や細胞内局在性を示すタンパク質やストレス応答性を示す...
運用機関:
東京薬科大学 薬学部
生物種:
説明:
３次元医薬品構造データベース(3DPSD)は医療用医薬品の３次元構造を格納したデータベースで、全ての構造データを公開しています。3DPSDは医薬品の一般名（英名）をアルファベット順に収納し、名称により...
運用終了
AgriTOGO: 農林水産生物ゲノム情報統合データベース
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
説明:
農林水産生物ゲノム情報統合データベースは、農林水産省の研究の成果として公開している情報を統合し、より価値の高い情報を発信することを目的としています。統合検索システム、統合データベース、データベースや解...
運用機関:
新潟大学 脳研究所 基礎神経科学部門 分子神経生物学分野
生物種:
Homo sapiens
説明:
高感度の放射活性を利用したDNAアレイを利用して、統合失調症の脳3領域における病態遺伝子プロファイルを取得し、約2-3000個の主要な既知遺伝子mRNAの発現変化率とその個人差を解析した結果を公開して...
運用機関:
法政大学
生物種:
Mastigophora | Sarcodia | Ciliophora | Stramenopiles | Chlorophyta | ...
説明:
原生生物とその他の微生物の画像（静止画 81037枚、内訳：総計765属、3203種、15434サンプル、および、動画 2261クリップ、淡水産が主）と関連情報を提供しています。
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa Japonica Group
説明:
農業生物資源研究所遺伝子機能研究チームは、イネの遺伝子破壊系統を内在性トランスポゾン(Tos17)を転移させて作成しています。このデータベースではトランスポゾンに隣接する塩基配列を検索したり、3次元D...
運用機関:
東京大学 大学院農学生命科学研究科
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコの完全長cDNAデータベースです。カイコ完全長cDNA末端塩基配列データベース、カイコEST塩基配列データベース(SilkBase： http://integbio.jp/dbcatalog/r...
運用機関:
大阪市立大学 大学院理学研究科
生物種:
Saccharomyces | Schizosaccharomyces pombe
説明:
分裂、出芽酵母株の菌株、プラスミド、ライブラリ、完全長cDNAなどのリソースの検索が可能です。また、それらの分与申し込みも可能です。
運用機関:
広島大学 両生類研究センター
生物種:
Xenopus tropicalis
説明:
NBRPネッタイツメガエルのサイトです。ネッタイツメガエルの寄託・譲渡の受付、系統の高品質化・保存、生体（胚・幼生・亜成体・成体）や非生体リソース（DNA など）の提供を行っています。現在はNiger...
運用機関:
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種:
Xenopus laevis
説明:
アフリカツメガエル(Xenopus laevis)のEST、そのアセンブリ、WISH画像が登録されています。アセンブリは、NCBI-NR, UniGene(X.laevis), TIGR-XGI, X...
運用機関:
東京工業大学 大学院生命理工学研究科
生物種:
Vibrio parahaemolyticus
説明:
腸炎ビブリオ菌の全ゲノム配列およびアノテーションを掲載したデータベースです。ゲノムビューワやrRNAおよびtRNAの表、ORF検索、遺伝子検索、ブラスト検索などが利用できます。データ全体の一括ダウンロ...
運用機関:
東京大学 大学院新領域創成科学研究科
生物種:
Oryzias latipes
説明:
UTGB (University of Tokyo Genome Browser) を利用したメダカに関するゲノムブラウザです。予測遺伝子、EST、GC含有量、繰り返しと比較ゲノミクスなど基本的な情報...
運用終了
Probe
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
説明:
遺伝子型決定や遺伝子発現解析、SNP解析、ゲノムマッピング、遺伝子サイレンシングなどの研究に用いられる核酸プローブ情報を登録するデータベースです。各プローブにつき、配列、文献、実験方法が掲載されていま...
運用機関:
UniProt Consortium
生物種:
All
説明:
アミノ酸配列とその機能情報を掲載している代表的なデータベースです。「UniProtKB」、「UniRef」、「UniParc」の3種類のデータベースから構成されています。
UniProtKB: 文献情...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
All
説明:
転写産物の非冗長配列セット（クラスター）を自動的に生成し、収録しています。各クラスターは別々の遺伝子、あるいは発現偽遺伝子を表し、クラスタごとに相同タンパク、遺伝子発現、ゲノム位置、mRNA配列、ES...
運用機関:
University of California, Santa Cruz
生物種:
Mammalia | Vertebrata | Deuterostomia | Hexapoda | Nematoda | ...
説明:
ゲノム解読がなされている真核生物を対象として自動アノテーションを行い、その結果をゲノムブラウザ/データベースとして公開しているプロジェクトです。ゲノム上にマッピングされた様々な分子情報や実験データを閲...
運用機関:
九州工業大学
生物種:
説明:
遺伝子発現は転写だけでなく、翻訳のレベルでも制御されています。そこで、mRNAの翻訳レベルでのシグナル配列と機能活性データを集めたデータベースを構築しました。現在、18種類のウィルス、10種類の植物、...
運用終了
TraP: Transcription Product Database
運用機関:
独立行政法人産業技術総合研究所
生物種:
Aeropyrum pernix | Archaeoglobus fulgidus | Methanobacterium thermoautotrophicum | Methanococcus jannaschii | Pyrococcus abyssi | ...
説明:
古細菌7種の間で、代謝経路（解糖系、TCA回路、電子伝達系、アミノ酸生合成、核酸生合成）を比較したデータベースです。種による差分のハイライト表示が可能です。
運用機関:
Tel Aviv University
生物種:
Homo sapiens | Mus musculus | Gallus gallus | Danio rerio | Drosophila melanogaster | ...
説明:
7生物種のタンパク質コード領域に存在する可動性遺伝因子Transposed Elements (TEs) のデータベースです。TEsの種類やファミリー、ホスト遺伝子に関する情報が収録されています。
運用機関:
奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
Escherichia coli
説明:
大腸菌2成分制御系の欠失変異株における遺伝子発現プロファイルのマイクロアレイ解析データを公開しています。2成分制御系により影響を受ける遺伝子情報や細胞機能の解析が可能です。
※2012年9月時点で画面...
運用機関:
東京大学 大学院薬学系研究科
生物種:
Homo sapiens | Rattus | Mus | Cercopithecidaes
説明:
薬物体内動態を規定する重要な役割を果たしていることが想定される薬物トランスポーターに関する情報を収集したデータベースです。情報は文献から抽出されたものです。
このデータベースは以下の4つのサイトで構成...
運用機関:
地方国立研究開発法人東京都健康長寿医療センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
老化の指標となるタンパク質についての二次元電気泳動実験結果を掲載したデータベースです。
運用機関:
京都大学 大学院医学研究科 附属動物実験施設
生物種:
Rattus norvegicus
説明:
ラットの系統、特性、研究対象分野の検索、分与申し込みのサービスを提供しているサイトです。ラット資源の保存情報、世代数、特性や繁殖方法、参考文献などの情報が提供されています。
運用機関:
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科
生物種:
Mus musculus
説明:
マウスES細胞に対して新規の遺伝子トラップ法(UPATrap)を用い、ランダムな遺伝子破壊変異株を作成しました。トラップされた遺伝子の配列と、さらにはその配列に基づいて作成したDNAマイクロアレイを用...
運用機関:
University of Reading
生物種:
説明:
Species 2000は、生物多様性研究の基本となるデータセットとして、現在知られている地球上の生物（動物、植物、菌類、微生物）の種を全て列挙し、地球生物種カタログの作成を目指しているプロジェクトで...
運用機関:
九州大学 大学院生物資源環境科学府
生物種:
説明:
遺伝子発現や細胞増殖を制御する膨大なシグナル伝達パスウェイ情報を整理し、可視化したデータベースです。SPADでは、細胞内シグナルパスウエイの引き金となる細胞外シグナル分子に基づき、成長因子、サイトカイ...
運用機関:
National Center for Biotechnology Information
生物種:
Homo sapiens
説明:
1～数塩基の置換、挿入/欠失、反復等の多型情報からなるデータベースです。各SNPについて、集団間での多型頻度の違いを視覚的に比較することもできます。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種:
Homo sapiens | Pan troglodytes | Pan paniscus | Gorilla gorilla | Pongo pygmaeus | ...
説明:
チンパンジーおよびゴリラの塩基配列、ヒトと類人猿の塩基配列の比較結果、類人猿ゲノム計画(Silver)で決定した塩基配列を基にした比較結果を掲載している。
運用機関:
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター
生物種:
Bombyx mori
説明:
カイコリソースの総合データベースです。系統、変異体遺伝子情報のほか、文献情報等が掲載されており、目的に応じて各種バイオリソースの提供を受けることができます。
運用機関:
東京大学
生物種:
Bombyx mori | Samia ricini | Bombyx mandarina
説明:
家蚕であるカイコ及び野蚕の一種であるエリサンはわが国独自のモデル生物であり、鱗翅目（絹糸昆虫および農業害虫の多くがここへ入る）の代表として世界の昆虫研究をリードする研究対象となっています。「SilkB...
運用機関:
Stanford University
生物種:
Saccharomyces cerevisiae
説明:
スタンフォード大学による出芽酵母の分子生物学データベースです。出芽酵母のゲノムや生物学に関する様々な情報が収録されており、キュレーターによって情報の更新や維持がなされています。SGDでは、Gene N...
運用機関:
国立研究開発法人森林研究・整備機構 森林総合研究所
生物種:
Cryptomeria japonica | Chamaecyparis obtusa
説明:
本データベースは、スギ（Cryptomeria japonica ）とヒノキ（Chamaecyparis obtusa ）の遺伝子の部分塩基配列（EST）、DNAマーカー、遺伝連鎖地図、遺伝的多様性な...
運用機関:
The Medical Research Council (MRC) Laboratory of Molecular Biology
生物種:
説明:
PBDに登録されたタンパク質を構造と進化に着目して分類したデータベースです。分類されたタンパク質は類縁関係による単純な階層構造ではなく、タイプ（形状）、構造、進化、その他の4つのカテゴリーに定義された...
運用機関:
東京大学 先端科学技術研究センター
生物種:
Homo sapiens
説明:
SBM DBは包括的な遺伝子発現データベースです。 ヒトの正常組織や、様々な、組織や細胞、疾患状態や薬剤による遺伝子発現プロファイルを oligo-nuculeotide DNAマイクロアレイ「Gen...
運用機関:
宮崎大学 フロンティア科学実験総合センター
生物種:
Eukaryota | Archaea | Bacteria
説明:
24種の真核生物、4種の古細菌、4種の真正細菌のリボソームタンパク質遺伝子を収集したデータベースです。ヒト、マウス、フグ、ショウジョウバエ、線虫については、ミトコンドリアリボソームタンパク質遺伝子も収...
運用機関:
国立研究開発法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネのマイクロアレイプロジェクト(1999年開始)に関する総合的な情報が掲載されています。一般的なマイクロアレイの技術背景からプロジェクトで使用したアレイ解析のプロトコルや研究データ等の情報を参照でき...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネのミトコンドリアゲノム情報が掲載されています。 ミトコンドリアゲノムの配列や物理地図等の情報を参照できます。
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構によるオリジナルサイト（http: /...
運用機関:
国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構
生物種:
Oryza sativa
説明:
イネの各種組織や細胞内小器官を対象に2次元ゲル電気泳動を行い、そのスポットを収集したデータベースです。プロテオーム解析に関する様々な手法のプロトコルも掲載されています。
国立研究開発法人 農業・食品産...
運用終了
Rice PIPELINE
運用機関:
国立研究開発法人農業生物資源研究所
生物種:
Oryza sativa
説明:
複数のイネ関連データベースを統合し、各データベースの情報を検索できるようにしたシステムです。 お手持ちの配列による各データベースの配列検索 (BLAST)やIDによる検索ができ、グラフィカルな検索結果...
運用機関:
公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種:
Rhizobiales | Frankia | Azoarcus | Rhodospirillales | Cupriavidus
説明:
財団法人かずさDNA研究所で全ゲノム配列決定したミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium loti MAFF303099を含む、19種の根粒菌の全ゲノム配列情報を収録しています。種毎に、ゲノム配列、...
運用機関:
Medical College of Wisconsin/Bioinformatics Research Center
生物種:
Rattus norvegicus
説明:
ラットゲノム研究の総合サイトです。ラット遺伝子に関する情報の他に、ラットの系統に関する情報、病態モデルラットに関するデータ、文献情報等を提供しています。
本カタログの使い方
統合TVにて解説動画が公開されています (2017年10月04日 版）