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Exp-Plant Catalog: RIKEN BRC Experimental Plant Web Catalog

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02632
名称データベースの名称 Exp-Plant Catalog
別称データベースの別称 RIKEN BRC Experimental Plant Web Catalog
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://plant.rtc.riken.jp/resource/home/index.html
運用機関名現在データベースを運用している機関名 特定国立研究開発法人理化学研究所 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 理化学研究所バイオリソース研究センター(BRC)実験植物開発室が提供する植物リソースのデータベースです。代表的な実験植物のシロイヌナズナとミナトカモジグサの種子のほか、多様なモデル植物の培養細胞と遺伝子リソースの情報を収録しています。DNA リソース(RAFL clone、TF clone、TAC clone)、種子リソース(Ds line、Accession番号、Individual Mutant)、細胞株リソースの一覧からの絞り込みや、生物種、関連する遺伝子名などのキーワードによる検索が可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Arabidopsis thaliana (3702), Brachypodium distachyon (15368), Populus nigra (3691), Oryza sativa (4530), Lotus japonicus (34305), Solanum lycopersicum (4081), Striga hermonthica (68872), Nicotiana (4085), Brassica rapa (3711), Thellungiella halophila (98038), Physcomitrium patens (3218), Manihot esculenta (3983)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方
データベースの連絡先 https://plant.rtc.riken.jp/resource/contact/contact_j.html
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2024-03-22
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2024-03-22
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license