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MSDB: MicroSatellite DataBase

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02617
名称データベースの名称 MSDB
別称データベースの別称 MicroSatellite DataBase
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL http://data.ccmb.res.in/msdb
運用機関名現在データベースを運用している機関名 CSIR-Centre for Cellular & Molecular Biology (CCMB)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 インド
説明データベースの説明 マイクロサテライト(単純反復配列)のデータベースです。12種のモデル生物を含む4万を超える生物種について、SSRの染色体位置、繰り返しの種類、繰り返しの長さ、関連遺伝子の情報などを収録しています。UCSCやRefSeq、GenBankからのデータを使用して定期的にアップデートされています。モデル生物を選択するクイックリンクのほか、種名による検索から生物ごとのSSRのデータを見られます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID All (1)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31599331
DOI:10.1093/nar/gkz886
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://data.ccmb.res.in/msdb/
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件
データベースの使い方 https://data.ccmb.res.in/msdb/
データベースの連絡先 https://data.ccmb.res.in/msdb/
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2022-04-28
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-04-28
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license