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TSEA-DB

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC02606
名称データベースの名称 TSEA-DB
別称データベースの別称
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://bioinfo.uth.edu/TSEADB
運用機関名現在データベースを運用している機関名 University of Texas Health Science Center at Houston
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 アメリカ合衆国
説明データベースの説明 形質に関連する組織特異性のデータベースです。組織特異的エンリッチメント分析(tissue-specific enrichment analysis; TSEA)を行った形質コレクションと、(1)手動キュレーションによるゲノムワイド関連研究(GWAS)、および(2)UKBBGWASデータを含むそれらの関連遺伝子が収録されています。Multi-Trait Collection (MTC; GWASと複合的な処置や疾患)、Expanded Trait Collection (ETC; 手動キュレートGWAS)、UKBB Traits(UK BankからのGWAS)、Tissue Panel(GTEx v7やENCODEからの組織情報)などの一覧から閲覧が可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Homo sapiens (9606)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:31680168
DOI:10.1093/nar/gkz957
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://www.uth.edu/index/dmca.htm
データベースの使い方 https://bioinfo.uth.edu/TSEADB/html/document.jsp?csrt=14847895420740164682#p4
データベースの連絡先 https://bioinfo.uth.edu/TSEADB/html/contact.jsp?csrt=14847895420740164682
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2022-03-30
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-03-30
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license